145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0834 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0834  UspA domain protein  100 
 
 		 315 aa  647    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.652975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1615  UspA domain protein  75.56 
 
 		 315 aa  504  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2306  hypothetical protein  42.49 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2449  hypothetical protein  41.53 
 
 		 312 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1119  hypothetical protein  38.8 
 
 		 313 aa  235  6e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2271  UspA domain-containing protein  40.63 
 
 		 313 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000419  universal stress protein family 1  36.31 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2765  UspA domain-containing protein  38.75 
 
 		 318 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0566  hypothetical protein  39.31 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2623  putative universal stress protein  32.81 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2951  universal stress protein UspA  33.23 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.70353  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  27.36 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1391  universal stress protein, UspA  33.23 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2220  universal stress protein UspE  28.3 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.875118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2015  universal stress protein UspE  27.94 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000455059 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1960  universal stress protein UspE  27.94 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778314 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2116  universal stress protein UspE  27.94 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.673331  normal  0.0394292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0929  UspA domain protein  35.5 
 
 		 326 aa  112  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1994  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.436901  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2355  universal stress protein UspE  27.62 
 
 		 310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03146  Universal stress protein, UspA  29.74 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.747468  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2095  UspA domain-containing protein  28.12 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2019  universal stress protein UspE  27.38 
 
 		 309 aa  109  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.865134  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1950  universal stress protein UspE  27.27 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2416  universal stress protein UspE  28.93 
 
 		 310 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268854  decreased coverage  0.000000187412 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2161  universal stress protein UspE  27.62 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2223  universal stress protein UspE  27.62 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000145957  normal  0.12873 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4496  universal stress protein UspE  27.62 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2210  universal stress protein UspE  27.62 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000689351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1044  universal stress protein UspE  27.3 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.106711  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2211  universal stress protein UspE  27.62 
 
 		 310 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00209938  normal  0.266977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1832  universal stress protein UspE  28.44 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1943  universal stress protein UspE  28.44 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.361169  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2223  universal stress protein UspE  27.76 
 
 		 310 aa  106  6e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0502569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02294  universal stress protein UspE  28.62 
 
 		 315 aa  105  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1800  universal stress protein UspE  26.73 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.846071  normal  0.320472 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1863  universal stress protein UspE  27.91 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.809514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2583  universal stress protein UspE  28.12 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1851  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 316 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2399  universal stress protein UspE  27.66 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0930  universal stress protein UspE  29.32 
 
 		 311 aa  102  8e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1672  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 315 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0632813 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1846  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1842  universal stress protein UspE  27.67 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000992679  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1786  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144508 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1490  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0578551  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1784  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334213  normal  0.266242 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2106  universal stress protein UspE  27.83 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.107549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2065  universal stress protein UspE  28.44 
 
 		 311 aa  99.8  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01310  stress-induced protein  28.75 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2312  UspA domain protein  28.75 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.172993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2292  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1789  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01320  hypothetical protein  28.75 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2080  universal stress protein UspE  27.5 
 
 		 323 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.108307  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1980  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.420697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1449  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1545  universal stress protein UspE  28.75 
 
 		 316 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003476  universal stress protein E  31.84 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.181718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02064  universal stress protein UspE  25.08 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00593148  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1986  universal stress protein UspE  30.67 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.652994  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2285  hypothetical protein  29.44 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0879  universal stress protein UspE  28.71 
 
 		 307 aa  90.9  3e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0349688  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3260  UspA domain-containing protein  25.57 
 
 		 302 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38400  universal stress protein family  27.19 
 
 		 310 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1572  universal stress protein UspE  26.22 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.322555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0722  hypothetical protein  24.13 
 
 		 294 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.483462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1258  universal stress protein UspA  26.92 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3340  universal stress protein  26.4 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2453  UspA domain-containing protein  23.92 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.740896 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3237  universal stress protein  23.75 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4897  hypothetical protein  28.81 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56220  hypothetical protein  29.94 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3969  universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein  57.45 
 
 		 53 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3344  hypothetical protein  29.76 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2576  UspA domain-containing protein  27.81 
 
 		 287 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140838  hitchhiker  0.00089263 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3296  universal stress protein  23.08 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.249085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3514  hypothetical protein  28.19 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.306404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41440  hypothetical protein  27.66 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  24.4 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  26.5 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25790  universal stress protein, UspA family  21.85 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1667  universal stress protein family  23.96 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105926  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3432  UspA domain-containing protein  28.29 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.85473  normal  0.743493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1649  UspA domain-containing protein  24.87 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1811  UspA domain-containing protein  27.72 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  25.23 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2187  universal stress protein  26.34 
 
 		 287 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0618  hypothetical protein  23.67 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0884  UspA domain-containing protein  25.84 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3393  hypothetical protein  23.81 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3342  hypothetical protein  23.87 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2938  universal stress protein  23.59 
 
 		 297 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3029  UspA domain-containing protein  26.24 
 
 		 308 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.367394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1915  UspA domain-containing protein  24.04 
 
 		 289 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  28.03 
 
 		 170 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  28.03 
 
 		 170 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  29.11 
 
 		 169 aa  53.9  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3963  hypothetical protein  23.04 
 
 		 294 aa  53.9  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.144543  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3008  UspA domain-containing protein  24.31 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>