217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0824 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 444 aa  900    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  58.2 
 
 		 441 aa  532  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  52.52 
 
 		 442 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  54.67 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  48.83 
 
 		 443 aa  431  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  47.79 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  46.58 
 
 		 403 aa  410  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  35.87 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  28.76 
 
 		 483 aa  191  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  30.86 
 
 		 478 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  28.2 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  28.14 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  27.45 
 
 		 501 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  27.85 
 
 		 417 aa  155  2e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0011  permease YjgP/YjgQ family protein  24.08 
 
 		 527 aa  151  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0598  hypothetical protein  25.05 
 
 		 651 aa  142  1.9999999999999998e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  25.75 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  26.4 
 
 		 456 aa  129  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2110  permease YjgP/YjgQ family protein  25.82 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.185125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  22.75 
 
 		 399 aa  117  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  23.49 
 
 		 365 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  23.38 
 
 		 391 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  34.51 
 
 		 394 aa  99.4  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  24.49 
 
 		 391 aa  96.7  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  22.09 
 
 		 364 aa  90.9  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.95 
 
 		 388 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16001  putative permease  22.99 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.245859  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  26.72 
 
 		 392 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  27.31 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  29.88 
 
 		 384 aa  84  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 391 aa  83.2  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  23.54 
 
 		 359 aa  82  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.42 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  21.84 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08021  putative permease  34.31 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  28.35 
 
 		 1153 aa  79.7  0.00000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0170  putative permease  35.04 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.736703  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  30.3 
 
 		 359 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  26.81 
 
 		 374 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  21.83 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  21.32 
 
 		 400 aa  75.5  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  24.68 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  27.71 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  27.78 
 
 		 359 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  22.25 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  20.36 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  21.28 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09981  putative permease  30.66 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.341989 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15831  putative permease  26.36 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0944857  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15721  putative permease  30.66 
 
 		 386 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.868052  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  25.21 
 
 		 371 aa  67.8  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  23 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  25.51 
 
 		 389 aa  67  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  26.07 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  22.18 
 
 		 1096 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  25.37 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  24.34 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  21.79 
 
 		 364 aa  64.3  0.000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  22.9 
 
 		 382 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2209  permease YjgP/YjgQ family protein  28.79 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  24.38 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  27.95 
 
 		 1040 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  27.87 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  25.25 
 
 		 1061 aa  62.4  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  26.52 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  25.26 
 
 		 1111 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  24.75 
 
 		 1061 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0148  permease YjgP/YjgQ family protein  21.54 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.496142  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1407  permease YjgP/YjgQ family protein  31.25 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.185064 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  21.14 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  23.31 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  23.65 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  27.22 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  23.89 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  25.32 
 
 		 388 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  25 
 
 		 389 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.93 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  27.92 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  33.33 
 
 		 792 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16801  putative permease  26.87 
 
 		 403 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.636863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  25.93 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  31.34 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  23.32 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  26.67 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  32 
 
 		 356 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  27.03 
 
 		 360 aa  55.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  22.83 
 
 		 379 aa  55.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>