More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0797 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 
268 aa  539  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  55.41 
 
 
283 aa  258  9e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  47.86 
 
 
288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  46.69 
 
 
286 aa  251  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  44.74 
 
 
270 aa  251  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  47.08 
 
 
288 aa  248  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  44.36 
 
 
287 aa  246  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 
275 aa  245  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  44.83 
 
 
274 aa  244  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  44.06 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  42.91 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 
275 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  43.68 
 
 
275 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  43.68 
 
 
275 aa  243  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  44.06 
 
 
274 aa  241  7e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 
275 aa  241  7e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  43.3 
 
 
275 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  42.96 
 
 
277 aa  236  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  42.91 
 
 
274 aa  236  3e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  42.91 
 
 
275 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0527  MscS mechanosensitive ion channel  45.25 
 
 
276 aa  233  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.546646 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  41.54 
 
 
275 aa  231  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  43.08 
 
 
268 aa  232  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  41.22 
 
 
298 aa  231  9e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  42.15 
 
 
280 aa  230  2e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  39.69 
 
 
269 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  40.77 
 
 
275 aa  228  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  41.13 
 
 
275 aa  228  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  41.76 
 
 
274 aa  228  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  43.36 
 
 
288 aa  226  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  43.31 
 
 
276 aa  225  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  42.8 
 
 
285 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  42.8 
 
 
285 aa  221  9e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  42.8 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  42.97 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  42.41 
 
 
285 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  39.85 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  40.47 
 
 
270 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  42.25 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  42.25 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  42.25 
 
 
291 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  42.25 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  42.25 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  42.25 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  42.25 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  42.25 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  41.86 
 
 
286 aa  212  5.999999999999999e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  42 
 
 
276 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  45.34 
 
 
276 aa  210  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0202  mechanosensitive ion channel family protein  39.16 
 
 
271 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0204  mechanosensitive ion channel family protein  39.16 
 
 
271 aa  209  3e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.171183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  42.47 
 
 
274 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3942  MscS mechanosensitive ion channel  45.37 
 
 
288 aa  208  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.639966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.86 
 
 
289 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  40.86 
 
 
289 aa  206  4e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  40.86 
 
 
289 aa  206  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  42.8 
 
 
283 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  42.41 
 
 
283 aa  205  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  42.19 
 
 
293 aa  204  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  38.93 
 
 
288 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  40.91 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  43.61 
 
 
286 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  43.61 
 
 
286 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  43.61 
 
 
286 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  38.26 
 
 
277 aa  199  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  43.61 
 
 
286 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  43.61 
 
 
286 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1162  MscS Mechanosensitive ion channel  38.59 
 
 
294 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.102088  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  42.53 
 
 
279 aa  198  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5331  MscS mechanosensitive ion channel  35.14 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  37.84 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  38.76 
 
 
279 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  39.67 
 
 
494 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  35.5 
 
 
279 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  41.85 
 
 
284 aa  191  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  38.72 
 
 
283 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  43.6 
 
 
327 aa  188  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  37.6 
 
 
531 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  35.23 
 
 
275 aa  187  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  37.4 
 
 
273 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5803  Small-conductance mechanosensitive channel  36.71 
 
 
284 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.528701 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  34.87 
 
 
280 aa  187  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3397  MscS mechanosensitive ion channel  38.78 
 
 
291 aa  186  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  37.5 
 
 
274 aa  187  2e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 
549 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 
549 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  38.13 
 
 
277 aa  186  3e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  33.95 
 
 
549 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1419  mechanosensitive ion channel family protein  35.85 
 
 
278 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  36.36 
 
 
547 aa  185  6e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 
550 aa  185  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 
551 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 
551 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5106  MscS mechanosensitive ion channel  37.12 
 
 
292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0140126  decreased coverage  0.0019989 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  35.88 
 
 
533 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3256  MscS mechanosensitive ion channel  36.68 
 
 
292 aa  183  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00789281  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  32.96 
 
 
270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  34.43 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2942  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 
288 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.711571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>