More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0728 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0728  sun protein  100 
 
 
449 aa  934    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0818  sun protein  56.56 
 
 
447 aa  515  1.0000000000000001e-145  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  51.99 
 
 
451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0928  sun protein  51.48 
 
 
445 aa  457  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1768  sun protein  50.11 
 
 
444 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  47.96 
 
 
429 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0591  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  46.95 
 
 
442 aa  375  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1707  sun protein  38.44 
 
 
453 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2311  sun protein  36.44 
 
 
452 aa  291  1e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.362668  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0571  sun protein  34.35 
 
 
455 aa  281  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0809795  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1591  sun protein  36.81 
 
 
452 aa  280  3e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1954  sun protein  36.08 
 
 
444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0918  sun protein  37.08 
 
 
453 aa  271  1e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1064  sun protein  37.06 
 
 
447 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0859  sun protein  35.49 
 
 
452 aa  270  5e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1532  sun protein  32.82 
 
 
449 aa  268  2e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09930  sun protein  34.01 
 
 
440 aa  263  6.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  37.03 
 
 
446 aa  262  8e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3688  sun protein  36.88 
 
 
444 aa  259  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.66831  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3045  sun protein  34.3 
 
 
452 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1279  sun protein  35.1 
 
 
444 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.19762 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3716  sun protein  35.73 
 
 
444 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0992207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3606  sun protein  35.73 
 
 
444 aa  256  8e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3879  sun protein  35.73 
 
 
444 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.26957e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4003  sun protein  35.73 
 
 
444 aa  256  8e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3913  sun protein  35.73 
 
 
444 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0159883  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3907  sun protein  35.73 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3624  sun protein  35.73 
 
 
444 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0232202  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  35.03 
 
 
451 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3851  sun protein  34.89 
 
 
453 aa  253  6e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3964  sun protein  35.48 
 
 
444 aa  252  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0193  sun protein  35.7 
 
 
448 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000593735  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0672  sun protein  34 
 
 
451 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0363723  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0652  sun protein  33.78 
 
 
451 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2517  sun protein  35.4 
 
 
444 aa  250  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000512112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  36.22 
 
 
448 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2231  sun protein  32.68 
 
 
468 aa  248  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0744  sun protein  34.6 
 
 
443 aa  249  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.323768  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  34.97 
 
 
443 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  34.23 
 
 
446 aa  246  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1228  hypothetical protein  31.81 
 
 
456 aa  246  8e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.13972  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0241  Sun protein  34.88 
 
 
451 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.63 
 
 
449 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0150  sun protein  32.59 
 
 
449 aa  239  5.999999999999999e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.958214  normal  0.637853 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1752  sun protein  30.86 
 
 
444 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.731166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  34.9 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3528  sun protein  33.33 
 
 
448 aa  232  9e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1337  sun protein  30.62 
 
 
462 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0524507  normal  0.361587 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3594  sun protein  33.11 
 
 
448 aa  229  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0900  sun protein  33.33 
 
 
457 aa  223  4e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1712  sun protein  31.71 
 
 
442 aa  219  7e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.212482  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04881  Sun protein (Fmu protein)  33.75 
 
 
437 aa  218  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.929228  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3612  sun protein  34.37 
 
 
464 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  35.46 
 
 
432 aa  217  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0425  sun protein  33.57 
 
 
438 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04501  Sun protein (Fmu protein)  33.33 
 
 
438 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1994  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.22 
 
 
442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04811  Sun protein (Fmu protein)  33.98 
 
 
438 aa  213  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1437  sun protein  33.42 
 
 
430 aa  211  3e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04801  Sun protein (Fmu protein)  35.18 
 
 
448 aa  210  4e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.273951  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1758  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  34.13 
 
 
438 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20681  Sun protein (Fmu protein)  34.78 
 
 
450 aa  206  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1171  sun protein  30.89 
 
 
449 aa  204  2e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1107  sun protein  31.6 
 
 
471 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1322  sun protein  33.33 
 
 
451 aa  195  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4229  sun protein  32.43 
 
 
432 aa  193  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.494405 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1575  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  33.58 
 
 
445 aa  192  9e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0804  sun protein  34.62 
 
 
445 aa  190  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0103148 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0762  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  30 
 
 
438 aa  188  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000298868 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0209  rRNA methyltransferase RsmB (sun protein), putative  27.77 
 
 
428 aa  187  3e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1406  sun protein  31.28 
 
 
431 aa  187  4e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  29.54 
 
 
440 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2489  sun protein  28.6 
 
 
453 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.968037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  30.62 
 
 
452 aa  185  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0664  Fmu (Sun) domain protein  33.16 
 
 
430 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0783  sun protein  27.68 
 
 
435 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.29 
 
 
436 aa  184  3e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1280  sun protein  31.06 
 
 
431 aa  183  7e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000185655  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  30.98 
 
 
427 aa  181  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1513  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  28.26 
 
 
448 aa  180  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2843  sun protein  32.6 
 
 
424 aa  177  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  31.47 
 
 
429 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2084  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  29.67 
 
 
424 aa  177  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.616143  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  32.88 
 
 
428 aa  176  9e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1301  sun protein  26.33 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  33.06 
 
 
426 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  32.88 
 
 
428 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1276  sun protein  26.33 
 
 
435 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  31.25 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  32.88 
 
 
428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  31.03 
 
 
429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.33 
 
 
436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  32.61 
 
 
428 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  31.5 
 
 
429 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  30.72 
 
 
431 aa  172  1e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  31.75 
 
 
426 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  31.26 
 
 
428 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  30.51 
 
 
428 aa  169  7e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1042  Fmu (Sun) domain protein  27.27 
 
 
406 aa  169  8e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl196  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  32.73 
 
 
425 aa  169  1e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0292309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>