More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0699 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0699  Peptidase M23  100 
 
 
400 aa  811    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240238  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1814  Peptidase M23  62 
 
 
436 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.495234  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0808  peptidase M23B  41.85 
 
 
495 aa  354  1e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.190534  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0562  membrane-bound metallopeptidase-like  44.71 
 
 
465 aa  351  1e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.179343  normal  0.12509 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0855  Peptidase M23  39.27 
 
 
503 aa  340  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0522  Peptidase M23  41.47 
 
 
516 aa  338  7e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000038172  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1281  membrane-bound metallopeptidase-like  54.94 
 
 
503 aa  196  9e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.490805  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1971  Peptidase M23  26.92 
 
 
394 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.324427  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0023  M23/M37 family peptidase  26.6 
 
 
412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.257571  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03530  putative peptidase  26.68 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2361  Peptidase M23  27.32 
 
 
418 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147353  normal  0.297457 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1067  peptidase M23B  26.93 
 
 
417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0749  Peptidase M23  24.51 
 
 
422 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4398  Peptidase M23  25.98 
 
 
475 aa  112  9e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0079  peptidase M23  24.81 
 
 
419 aa  109  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.597935 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3774  Peptidase M23  25 
 
 
446 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0956  M24/M37 family peptidase putative  23.53 
 
 
431 aa  106  8e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.17281 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1773  M23/M37 peptidase domain-containing protein  22.51 
 
 
391 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00471646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1854  peptidase M23B  27.71 
 
 
394 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00139977  normal  0.475417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1289  peptidase M23B  23.2 
 
 
397 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0135605  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3838  Peptidase M23  23.98 
 
 
429 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2994  Peptidase M23  23.1 
 
 
397 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.13009e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1921  Peptidase M23  23.6 
 
 
398 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000118753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0045  peptidase M23B  24.68 
 
 
387 aa  99.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1188  Peptidase M23  35.62 
 
 
490 aa  97.8  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  26.1 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2410  peptidase M23B  23.38 
 
 
404 aa  97.8  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000521707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1934  peptidase M23B  24.76 
 
 
396 aa  97.1  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000344038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67790  putative membrane-bound metallopeptidase  24.38 
 
 
428 aa  97.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.498493  normal  0.610112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  24.3 
 
 
374 aa  95.9  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  24.23 
 
 
374 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  23.73 
 
 
428 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  24.22 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2452  peptidase M23B  27.62 
 
 
430 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000046431  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  23.53 
 
 
404 aa  90.9  4e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1218  peptidase M23  30.17 
 
 
387 aa  90.5  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.064926 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0712  peptidase M23B  36.09 
 
 
370 aa  90.1  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483453  normal  0.143509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  24.15 
 
 
375 aa  89.7  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2158  Peptidase M23  32.29 
 
 
382 aa  89  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.284453 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  24.47 
 
 
441 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1674  hypothetical protein  23.27 
 
 
388 aa  88.6  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  24.13 
 
 
420 aa  88.2  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0668  peptidase M23B  37.98 
 
 
372 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288255  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  37.29 
 
 
319 aa  87.8  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0702  Peptidase M23  37.31 
 
 
373 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  25.44 
 
 
375 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2540  peptidase M23B  39.82 
 
 
304 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.258183  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0703  Peptidase M23  37.98 
 
 
372 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1457  peptidase M23B  43.33 
 
 
241 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  37.29 
 
 
369 aa  85.9  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  24.38 
 
 
416 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  23.4 
 
 
438 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0493  ATPase  24.1 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  24.29 
 
 
440 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1721  M23 peptidase domain-containing protein  22.7 
 
 
369 aa  84  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1101  Peptidase M23  35.66 
 
 
375 aa  83.2  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000152343  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0450  non-proteolytic protein, peptidase family M23  22.7 
 
 
413 aa  82.8  0.000000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0993471  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  21.99 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  25.76 
 
 
344 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2708  Peptidase M23  26.34 
 
 
455 aa  82  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  23.57 
 
 
438 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  23.57 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  24.62 
 
 
411 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4142  hypothetical protein  23.05 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  25.76 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  25.76 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146051 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0177  hypothetical protein  21.94 
 
 
424 aa  79  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  26.75 
 
 
509 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  25.19 
 
 
377 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0068  hypothetical protein  21.13 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0074  hypothetical protein  23.05 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00126  peptidase  24.82 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4084  hypothetical protein  21.37 
 
 
433 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  34.43 
 
 
318 aa  79  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0758  Peptidase M23  36.07 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  25.19 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3157  Peptidase M23  32.33 
 
 
458 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0574328 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1572  peptidase, M23/M37 family  36.75 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.42945e-48 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1362  cell wall endopeptidase  36.75 
 
 
204 aa  77  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.83171e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1361  cell wall endopeptidase  36.75 
 
 
204 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000286273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4365  hypothetical protein  21.95 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  25.19 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1640  peptidase, M23/M37 family  36.75 
 
 
204 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3489  peptidase M23B  34.68 
 
 
288 aa  77  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.20898 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2393  M23 family peptidase  23.82 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.825234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  24.49 
 
 
379 aa  76.6  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  30.32 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  22.9 
 
 
417 aa  76.3  0.0000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1738  M23/M37 peptidase domain-containing protein  28.57 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.708166  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4041  hypothetical protein  22.9 
 
 
427 aa  76.3  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03471  protease with a role in cell division  22.19 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0092  Peptidase M23  22.19 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3825  hypothetical protein  22.19 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4117  hypothetical protein  22.19 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4986  hypothetical protein  22.19 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.263173  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  25.19 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000015395 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0095  hypothetical protein  22.19 
 
 
427 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03422  hypothetical protein  22.19 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  25.19 
 
 
362 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000129234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0609  peptidase M23B  30.18 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.802252  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>