More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0665 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0665  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 301 aa  617  1e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000125417  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  60.87 
 
 		 316 aa  382  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  53.97 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.64 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  53.02 
 
 		 300 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  53.02 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  53.02 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  54 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  50.83 
 
 		 311 aa  269  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.18 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  49.18 
 
 		 333 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  49.18 
 
 		 329 aa  265  5.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.5 
 
 		 298 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  49.51 
 
 		 328 aa  263  2e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  52.65 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  52.65 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  51.96 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  50.99 
 
 		 305 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  52.32 
 
 		 306 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.83 
 
 		 298 aa  258  6e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.27 
 
 		 324 aa  258  6e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  51.5 
 
 		 303 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  50 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 		 307 aa  256  4e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.5 
 
 		 304 aa  254  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.49 
 
 		 301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  51.5 
 
 		 302 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.03 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.32 
 
 		 298 aa  248  9e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.66 
 
 		 326 aa  244  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3334  short chain dehydrogenase  51.32 
 
 		 299 aa  244  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.03 
 
 		 297 aa  243  1.9999999999999999e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.66 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.42 
 
 		 312 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  48 
 
 		 302 aa  238  8e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47 
 
 		 290 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.19 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.63 
 
 		 315 aa  236  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.01 
 
 		 305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 		 328 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.74 
 
 		 320 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 		 307 aa  231  9e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  44.33 
 
 		 301 aa  230  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  41.75 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.01 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  42.16 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  41.2 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.14 
 
 		 298 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0618  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.52 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.77353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.42 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.86 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.95 
 
 		 304 aa  222  7e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.82 
 
 		 288 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5768  putative short chain dehydrogenase  47.06 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  38.69 
 
 		 309 aa  219  3e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  44.26 
 
 		 317 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.67 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  46.39 
 
 		 306 aa  216  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.58284 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66520  putative short chain dehydrogenase  47.71 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.973643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  38.08 
 
 		 309 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0964  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.3 
 
 		 298 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.468031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  44.88 
 
 		 300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.33 
 
 		 303 aa  212  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 		 289 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  37.63 
 
 		 309 aa  211  7.999999999999999e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  38.13 
 
 		 309 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.82 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.99 
 
 		 306 aa  209  6e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0639963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.59 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  44.87 
 
 		 318 aa  201  9e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.26 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4893  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.46 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37207  hitchhiker  0.00818757 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  41.08 
 
 		 308 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 306 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  42.62 
 
 		 292 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6655  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.16 
 
 		 314 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0106464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1947  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.95 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.156536  normal  0.0102569 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.55 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  42.57 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.21 
 
 		 320 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.44 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1529  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.392114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.94 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.23 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.92 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0589  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.72 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.75 
 
 		 313 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  39.67 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.85 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 		 271 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.196171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  34.84 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2577  short chain dehydrogenase  41.41 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>