More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0586 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  51.91 
 
 		 631 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  52.28 
 
 		 633 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  51.69 
 
 		 660 aa  668    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  60.19 
 
 		 630 aa  790    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  100 
 
 		 632 aa  1311    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  54.42 
 
 		 632 aa  700    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  54.32 
 
 		 636 aa  711    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0977  DNA primase  41.69 
 
 		 619 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0910  DNA primase  38.52 
 
 		 656 aa  340  5.9999999999999996e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  39.77 
 
 		 598 aa  337  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  40.05 
 
 		 600 aa  336  9e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  40.14 
 
 		 571 aa  336  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  39.54 
 
 		 598 aa  336  9e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  39.54 
 
 		 598 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  39.54 
 
 		 598 aa  335  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  39.54 
 
 		 598 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  39.54 
 
 		 598 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  39.54 
 
 		 598 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  39.54 
 
 		 598 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  39.44 
 
 		 599 aa  335  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06600  putative DNA primase  40 
 
 		 657 aa  328  1.0000000000000001e-88  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1790  DNA primase  39.11 
 
 		 704 aa  328  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  39.77 
 
 		 598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  34.93 
 
 		 601 aa  324  2e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1508  DNA primase, DNAG  40.14 
 
 		 593 aa  320  3.9999999999999996e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.083335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3090  DNA primase  35.62 
 
 		 587 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  35.81 
 
 		 653 aa  315  9.999999999999999e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  37.09 
 
 		 601 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  37.55 
 
 		 587 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  36.56 
 
 		 583 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  37.11 
 
 		 582 aa  310  4e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0394  DNA primase  37.85 
 
 		 588 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  40.44 
 
 		 595 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5973  DNA primase  38.31 
 
 		 703 aa  308  1.0000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  38.28 
 
 		 600 aa  305  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 604 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  37.88 
 
 		 598 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0276  DNA primase  38.36 
 
 		 660 aa  303  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.121752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  37.61 
 
 		 626 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4217  DNA primase  38.75 
 
 		 614 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000725747  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3370  DNA primase  37 
 
 		 674 aa  300  4e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  38.21 
 
 		 599 aa  300  5e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0540  DNA primase  36.07 
 
 		 604 aa  296  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00398394  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0912  hypothetical protein  37.94 
 
 		 640 aa  295  2e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.121689 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  37.1 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2679  DNA primase  36.33 
 
 		 604 aa  294  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0388  DNA primase  41.03 
 
 		 660 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0422  DNA primase  41.03 
 
 		 660 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1014  DNA primase  35.01 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.394769  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1814  DNA primase  35.4 
 
 		 673 aa  291  4e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6451  DNA primase  36.71 
 
 		 662 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.6099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0623  DNA primase  40.75 
 
 		 605 aa  290  5.0000000000000004e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4814  DNA primase  41.18 
 
 		 660 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0572  DNA primase  35.19 
 
 		 629 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.26895  normal  0.474628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  40.91 
 
 		 660 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  38.83 
 
 		 599 aa  287  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46990  DNA primase  41.98 
 
 		 638 aa  286  9e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  33.88 
 
 		 586 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07530  DNA primase  40.72 
 
 		 664 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.412597 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  33.33 
 
 		 588 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  40.72 
 
 		 663 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3522  DNA primase  39.52 
 
 		 596 aa  283  8.000000000000001e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3050  DNA primase  34.84 
 
 		 584 aa  283  9e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.233907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  31.42 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5148  DNA primase  40.64 
 
 		 655 aa  282  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.932917 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  37.45 
 
 		 613 aa  282  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2265  DNA primase  36.06 
 
 		 595 aa  282  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0225159  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  38.39 
 
 		 663 aa  281  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0313  DNA primase  37.37 
 
 		 578 aa  280  4e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166585 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1976  DNA primase  35.84 
 
 		 595 aa  280  5e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00122543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4640  DNA primase  40.64 
 
 		 651 aa  280  7e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.625681 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  36.15 
 
 		 576 aa  280  8e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  35.1 
 
 		 575 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  36.58 
 
 		 601 aa  278  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1799  DNA primase  36.97 
 
 		 616 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  31.9 
 
 		 609 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0717  DNA primase  37.36 
 
 		 656 aa  277  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.261682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  35.65 
 
 		 642 aa  277  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  40.11 
 
 		 652 aa  277  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  37.74 
 
 		 575 aa  277  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1042  DNA primase  35.95 
 
 		 666 aa  277  5e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.118792  normal  0.884554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6776  DNA primase  36.12 
 
 		 627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.258909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3298  DNA primase  36.99 
 
 		 665 aa  275  2.0000000000000002e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.877456 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  35.06 
 
 		 641 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  34.82 
 
 		 641 aa  274  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  37.77 
 
 		 598 aa  274  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  36.96 
 
 		 639 aa  274  5.000000000000001e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7521  DNA primase  36.12 
 
 		 629 aa  273  6e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  38.68 
 
 		 646 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  38.68 
 
 		 646 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  35.55 
 
 		 574 aa  273  7e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0394  DNA primase  34.45 
 
 		 572 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0720  DNA primase  33.84 
 
 		 647 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205397  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  38.95 
 
 		 586 aa  272  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1783  DNA primase  34.45 
 
 		 553 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1625  DNA primase  35.16 
 
 		 599 aa  271  2.9999999999999997e-71  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.947875 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  41.74 
 
 		 605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  36.85 
 
 		 544 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  36.79 
 
 		 573 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0824  DNA primase  40.7 
 
 		 576 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0132507  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>