More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0550 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_0717  phosphofructokinase  82.54 
 
 
401 aa  701  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1780  phosphofructokinase  83.29 
 
 
401 aa  698  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  5.06993e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1600  phosphofructokinase  81.3 
 
 
401 aa  688  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.760779 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0589  6-phosphofructokinase  83.29 
 
 
401 aa  696  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0550  6-phosphofructokinase  100 
 
 
401 aa  821  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  1.01268e-09  normal  0.239253 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0608  phosphofructokinase  90.02 
 
 
401 aa  756  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  6.47644e-06  decreased coverage  0.00336631 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1368  6-phosphofructokinase  32.22 
 
 
344 aa  164  4e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.323932  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1465  phosphofructokinase, pyrophosphate dependent  32.53 
 
 
348 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  31.76 
 
 
346 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  6.10364e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1236  phosphofructokinase  31.58 
 
 
361 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.40469e-08 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0983  6-phosphofructokinase  31.79 
 
 
341 aa  150  5e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0410  6-phosphofructokinase  33.5 
 
 
368 aa  149  7e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  32.05 
 
 
341 aa  148  1e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1170  6-phosphofructokinase  31.47 
 
 
365 aa  149  1e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3014  phosphofructokinase  31.66 
 
 
359 aa  147  2e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2076  6-phosphofructokinase  31.46 
 
 
362 aa  147  4e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  4.03027e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1203  phosphofructokinase  34.4 
 
 
366 aa  146  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.312729  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  31.58 
 
 
340 aa  146  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  31.2 
 
 
341 aa  145  9e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1640  6-phosphofructokinase  31.74 
 
 
363 aa  145  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0175906  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1829  6-phosphofructokinase  28.43 
 
 
372 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.975855 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  31.35 
 
 
341 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1389  phosphofructokinase family protein  34.15 
 
 
365 aa  143  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  30.81 
 
 
342 aa  142  9e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  33.94 
 
 
344 aa  142  9e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  31.75 
 
 
343 aa  141  2e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  31.61 
 
 
346 aa  141  2e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  32.22 
 
 
342 aa  141  2e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  32.42 
 
 
341 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4086  6-phosphofructokinase  31.49 
 
 
368 aa  140  4e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1703  6-phosphofructokinase  30.17 
 
 
363 aa  140  5e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523045  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1481  6-phosphofructokinase  30.26 
 
 
359 aa  139  6e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0568968  normal  0.256903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2515  6-phosphofructokinase  27.66 
 
 
372 aa  140  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2511  6-phosphofructokinase  29.01 
 
 
364 aa  139  8e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0412016  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  30.45 
 
 
341 aa  139  9e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2143  phosphofructokinase  30.71 
 
 
364 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.85454  hitchhiker  0.00443195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1508  6-phosphofructokinase I  29.93 
 
 
363 aa  139  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.05135e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  31.44 
 
 
344 aa  137  3e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  30.39 
 
 
341 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  30.81 
 
 
370 aa  136  6e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  32.34 
 
 
341 aa  136  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  30.63 
 
 
360 aa  135  1e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1479  6-phosphofructokinase  29.9 
 
 
369 aa  134  2e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.035174  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08980  6-phosphofructokinase  31.13 
 
 
340 aa  134  2e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.955342  normal  0.0435043 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5050  phosphofructokinase  30.75 
 
 
341 aa  134  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  29.5 
 
 
342 aa  133  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  30.18 
 
 
342 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1941  6-phosphofructokinase  29.04 
 
 
351 aa  133  7e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.333925  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2116  6-phosphofructokinase  28.14 
 
 
343 aa  132  1e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  28.24 
 
 
365 aa  131  2e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.13477e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  27.79 
 
 
343 aa  130  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1623  6-phosphofructokinase  32.18 
 
 
399 aa  130  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  27.95 
 
 
345 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  29.24 
 
 
342 aa  130  4e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0412  6-phosphofructokinase  32.32 
 
 
321 aa  130  5e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1892  6-phosphofructokinase  28.05 
 
 
343 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1938  6-phosphofructokinase  28.05 
 
 
343 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.194601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1872  6-phosphofructokinase  28.05 
 
 
343 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  27.87 
 
 
343 aa  129  8e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0296  phosphofructokinase  29.46 
 
 
375 aa  129  8e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2087  6-phosphofructokinase  29.49 
 
 
372 aa  128  2e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4499  6-phosphofructokinase  29.62 
 
 
363 aa  127  4e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  9.80056e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1798  6-phosphofructokinase  29.57 
 
 
358 aa  126  8e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  30.08 
 
 
339 aa  126  8e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  29.16 
 
 
349 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1260  6-phosphofructokinase  29.51 
 
 
336 aa  125  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  8.38364e-10  decreased coverage  4.40972e-10 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1388  6-phosphofructokinase  28.09 
 
 
319 aa  124  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0089995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0777  6-phosphofructokinase  29.97 
 
 
319 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1316  6-phosphofructokinase  30.56 
 
 
320 aa  122  9e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.958753  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1263  6-phosphofructokinase  30.95 
 
 
403 aa  122  1e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  28.9 
 
 
341 aa  122  1e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3643  6-phosphofructokinase  28.68 
 
 
356 aa  122  2e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.124605  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1715  6-phosphofructokinase  28.72 
 
 
320 aa  121  2e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.971383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2934  6-phosphofructokinase  29.08 
 
 
360 aa  121  2e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2529  6-phosphofructokinase  29.85 
 
 
373 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932389  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  30.71 
 
 
342 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3260  6-phosphofructokinase  27.01 
 
 
350 aa  120  4e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0688834 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  29.55 
 
 
368 aa  120  4e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2651  6-phosphofructokinase  31.67 
 
 
355 aa  120  5e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.365456  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5255  6-phosphofructokinase  26.8 
 
 
365 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.306196  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2613  6-phosphofructokinase  27.01 
 
 
350 aa  119  8e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2129  phosphofructokinase  28.75 
 
 
367 aa  119  9e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1258  6-phosphofructokinase  26.65 
 
 
319 aa  118  1e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  1.04743e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4626  6-phosphofructokinase  32.76 
 
 
390 aa  118  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0350  6-phosphofructokinase  29.65 
 
 
319 aa  118  2e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0191  6-phosphofructokinase  31.02 
 
 
390 aa  118  2e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0341  6-phosphofructokinase  29.65 
 
 
319 aa  118  2e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4056  6-phosphofructokinase  28.92 
 
 
320 aa  118  2e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.781005  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  28.41 
 
 
340 aa  117  3e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  29.17 
 
 
341 aa  117  4e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2004  6-phosphofructokinase  29.18 
 
 
319 aa  117  4e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0376827  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0186  6-phosphofructokinase  30.75 
 
 
390 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.404214 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3283  6-phosphofructokinase  28.95 
 
 
319 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2862  6-phosphofructokinase  29.07 
 
 
345 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1542  6-phosphofructokinase  29.36 
 
 
398 aa  116  7e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1047  6-phosphofructokinase  32.02 
 
 
366 aa  116  9e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0940  6-phosphofructokinase  29.91 
 
 
340 aa  115  1e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4391  6-phosphofructokinase  28.92 
 
 
320 aa  115  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.415837 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4279  6-phosphofructokinase  28.92 
 
 
320 aa  115  2e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1831  6-phosphofructokinase  33.67 
 
 
385 aa  115  2e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>