More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0510 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0510  signal peptide peptidase SppA, 36K type  100 
 
 
596 aa  1209    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0560  signal peptide peptidase SppA, 67K type  62.75 
 
 
596 aa  742    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.789825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  50.46 
 
 
597 aa  531  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  51.94 
 
 
597 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1631  protease IV  50.19 
 
 
583 aa  510  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  46.45 
 
 
601 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  48.62 
 
 
601 aa  504  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.45 
 
 
598 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.45 
 
 
598 aa  233  9e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.45 
 
 
566 aa  225  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.98 
 
 
590 aa  225  2e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  34.14 
 
 
831 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.06 
 
 
649 aa  221  3e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.52 
 
 
585 aa  220  5e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.32 
 
 
605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.15 
 
 
604 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  31.68 
 
 
608 aa  211  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  33.15 
 
 
617 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.19 
 
 
595 aa  206  8e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  30.54 
 
 
609 aa  206  8e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.09 
 
 
834 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.27 
 
 
617 aa  206  1e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  32.31 
 
 
834 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.5 
 
 
595 aa  204  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  29.58 
 
 
611 aa  203  6e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.9 
 
 
613 aa  203  8e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  31.08 
 
 
593 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.7 
 
 
613 aa  200  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  30.98 
 
 
513 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.31 
 
 
834 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.96 
 
 
587 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  31.55 
 
 
633 aa  196  9e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.62 
 
 
614 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.62 
 
 
614 aa  196  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  29.52 
 
 
612 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.06 
 
 
615 aa  194  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.67 
 
 
629 aa  194  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.41 
 
 
563 aa  193  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30 
 
 
640 aa  193  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  31.07 
 
 
623 aa  193  9e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.81 
 
 
633 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.39 
 
 
614 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.19 
 
 
615 aa  191  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  30.33 
 
 
569 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.77 
 
 
615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.19 
 
 
615 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.67 
 
 
613 aa  190  7e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.67 
 
 
613 aa  190  8e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.69 
 
 
614 aa  189  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  30.6 
 
 
583 aa  189  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.77 
 
 
615 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.36 
 
 
590 aa  188  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.16 
 
 
561 aa  183  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  28.79 
 
 
621 aa  183  9.000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  31.25 
 
 
616 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.39 
 
 
589 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.02 
 
 
626 aa  182  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.82 
 
 
661 aa  182  2e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  30.64 
 
 
555 aa  181  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.75 
 
 
621 aa  180  5.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  30.14 
 
 
616 aa  179  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.5 
 
 
637 aa  179  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.05 
 
 
595 aa  178  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.5 
 
 
570 aa  177  4e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.85 
 
 
562 aa  176  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.76 
 
 
605 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.76 
 
 
605 aa  176  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  30 
 
 
616 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  27.24 
 
 
609 aa  173  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.62 
 
 
571 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.68 
 
 
620 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  30.16 
 
 
610 aa  169  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.83 
 
 
614 aa  169  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.96 
 
 
593 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.96 
 
 
593 aa  168  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.87 
 
 
595 aa  169  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.77 
 
 
613 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.16 
 
 
593 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  25.77 
 
 
588 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  25.15 
 
 
584 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1343  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.93 
 
 
594 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.19865  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  28.49 
 
 
618 aa  164  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  28.31 
 
 
618 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  28.31 
 
 
618 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  28.13 
 
 
618 aa  162  1e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  28.13 
 
 
618 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1744  Acid phosphatase  25.05 
 
 
566 aa  162  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0430811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  28.87 
 
 
617 aa  160  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.93 
 
 
875 aa  160  6e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  26.6 
 
 
616 aa  159  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0963  signal peptide peptidase SppA, 36K type  24.08 
 
 
547 aa  159  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  27.08 
 
 
616 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.91 
 
 
625 aa  158  3e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  26.63 
 
 
616 aa  158  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  26.88 
 
 
618 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  26.8 
 
 
552 aa  155  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  27.69 
 
 
611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  27.03 
 
 
618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  27.03 
 
 
618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  27.03 
 
 
622 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>