More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0505 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00611  leucyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 		 860 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.197817  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2984  leucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 860 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00147705  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 819 aa  823    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0194  leucyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 		 813 aa  687    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.159225  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2209  leucyl-tRNA synthetase  44.43 
 
 		 824 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 860 aa  654    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  53.61 
 
 		 858 aa  894    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  57.28 
 
 		 804 aa  967    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  40.41 
 
 		 1016 aa  693    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2929  leucyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 863 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.010661 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4882  leucyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 802 aa  963    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1722  leucyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 		 863 aa  660    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3134  leucyl-tRNA synthetase  45.6 
 
 		 824 aa  716    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 		 833 aa  893    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2145  leucyl-tRNA synthetase  44.57 
 
 		 817 aa  662    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.736456  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 859 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  57.53 
 
 		 802 aa  964    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4637  leucyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 802 aa  962    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.802633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4472  leucyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 802 aa  964    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.947334  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  49.82 
 
 		 801 aa  792    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4490  leucyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 802 aa  962    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 859 aa  646    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1302  leucyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 823 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 860 aa  642    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 		 860 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 865 aa  673    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  41.55 
 
 		 904 aa  675    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  0.0000864885 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 971 aa  713    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 		 969 aa  676    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  43.36 
 
 		 872 aa  689    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 		 904 aa  682    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2665  leucyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 819 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.364748  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 874 aa  647    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 851 aa  690    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000816015  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0159  leucyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 813 aa  687    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  80 
 
 		 805 aa  1350    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  42.67 
 
 		 820 aa  640    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  78.26 
 
 		 805 aa  1347    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1848  leucyl-tRNA synthetase  57.16 
 
 		 805 aa  920    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164346  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2300  leucyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 824 aa  706    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.284228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2439  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 829 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 838 aa  669    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4991  leucyl-tRNA synthetase  57.62 
 
 		 802 aa  962    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 865 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1813  leucyl-tRNA synthetase  57.16 
 
 		 805 aa  920    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.682245  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0659  leucyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 804 aa  794    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2915  leucyl-tRNA synthetase  43.76 
 
 		 815 aa  669    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0568  leucyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 829 aa  740    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0938  leucyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 		 807 aa  750    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2727  leucyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 858 aa  687    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354364  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  50.58 
 
 		 879 aa  836    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 868 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  44.75 
 
 		 819 aa  700    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3308  leucyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 		 819 aa  677    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0417159 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0757  leucyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 824 aa  724    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 859 aa  676    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  42.55 
 
 		 820 aa  637    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0797  leucyl-tRNA synthetase  42.03 
 
 		 872 aa  639    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.749816  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  44.35 
 
 		 828 aa  688    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2515  leucyl-tRNA synthetase  44.78 
 
 		 827 aa  698    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000585626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 954 aa  722    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0232  leucyl-tRNA synthetase  40.78 
 
 		 861 aa  654    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1328  leucyl-tRNA synthetase  41.95 
 
 		 856 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0567  leucyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 819 aa  651    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0791746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 874 aa  646    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 971 aa  713    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3202  leucyl-tRNA synthetase  44.19 
 
 		 817 aa  683    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1566  leucyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 870 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.408978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1237  leucyl-tRNA synthetase  46.2 
 
 		 825 aa  739    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0657  leucyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 816 aa  669    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0645  leucyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 		 816 aa  683    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1557  leucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 860 aa  683    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  45.59 
 
 		 814 aa  703    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  43.02 
 
 		 859 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 859 aa  652    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 863 aa  652    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000160913 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 874 aa  646    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1599  leucyl-tRNA synthetase  45.42 
 
 		 824 aa  717    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000190725  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  43.15 
 
 		 949 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 806 aa  913    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000279205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 860 aa  643    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 829 aa  865    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  55.51 
 
 		 829 aa  908    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 		 804 aa  897    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  55.72 
 
 		 808 aa  937    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  52.49 
 
 		 833 aa  890    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  42.43 
 
 		 952 aa  710    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1176  leucyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 894 aa  639    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2084  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 		 829 aa  642    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.276133  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0256  leucyl-tRNA synthetase  45.44 
 
 		 823 aa  711    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 		 859 aa  652    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0771  leucyl-tRNA synthetase  41.76 
 
 		 832 aa  647    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.286234  normal  0.18971 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1731  leucyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 823 aa  697    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.308382  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0551  leucyl-tRNA synthetase  77.41 
 
 		 816 aa  1312    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 860 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 		 864 aa  671    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 971 aa  713    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1191  leucyl-tRNA synthetase  42.54 
 
 		 859 aa  650    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.663748 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  41.8 
 
 		 968 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2744  leucyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 864 aa  655    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>