More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0497 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0497  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 187 aa  383  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.655461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0543  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  66.13 
 
 		 186 aa  258  4e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0539  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.55 
 
 		 187 aa  202  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  53.44 
 
 		 191 aa  201  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.21 
 
 		 192 aa  201  5e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0476  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  52.91 
 
 		 190 aa  197  5e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  51.06 
 
 		 191 aa  185  3e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2183  Holliday junction resolvase  36.76 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.198911 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  44.67 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1243  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.48 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.91 
 
 		 187 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.1 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.553379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0995  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.62 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.410626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  37.33 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2240  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.22 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1324  Holliday junction resolvase  35.83 
 
 		 189 aa  123  1e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0740  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 173 aa  124  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.100777  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 164 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1221  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44 
 
 		 165 aa  122  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.69785  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01598  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0079  Holliday junction resolvase  32.43 
 
 		 181 aa  122  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.33 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  42.76 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  36.97 
 
 		 166 aa  118  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1270  Holliday junction resolvase  42 
 
 		 174 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.460583  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0769  Holliday junction resolvase  33.87 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1887  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2493  Holliday junction resolvase  45.38 
 
 		 165 aa  117  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  37.42 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1747  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.607448  normal  0.595925 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.33 
 
 		 173 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00124897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 164 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2354  Holliday junction resolvase  40.52 
 
 		 180 aa  115  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.542113 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1706  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.75 
 
 		 175 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0826466  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  40.79 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  38.67 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1408  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 174 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0741674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.27 
 
 		 163 aa  114  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  36.67 
 
 		 165 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2211  Holliday junction resolvase  44.27 
 
 		 167 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3979  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.72 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2336  Holliday junction resolvase  41.56 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0868617  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.6 
 
 		 164 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.67 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2364  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00103097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1438  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000786785  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0716  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.33 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.075927  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2778  Holliday junction resolvase  41.98 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426005  normal  0.0283844 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  30.27 
 
 		 184 aa  111  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 181 aa  111  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51800  Holliday junction resolvase  40 
 
 		 174 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000486306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4000  Holliday junction resolvase  43.33 
 
 		 174 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0486  Holliday junction resolvase  39.07 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2104  Holliday junction resolvase  34.67 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1480  Holliday junction resolvase  39.61 
 
 		 182 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0482  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 184 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464061 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2077  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.414118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0314  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.75 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.290454  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0509  Holliday junction resolvase  41.35 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  38.26 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2157  Holliday junction resolvase  42.34 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2259  Holliday junction resolvase  40.88 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2145  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.25841  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1846  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.75 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.018832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2423  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0385722  normal  0.655907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2032  Holliday junction resolvase  41.61 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000234301  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2236  Crossover junction endodeoxyribonuclease  39.85 
 
 		 179 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  34.87 
 
 		 160 aa  108  5e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36 
 
 		 162 aa  108  5e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0930  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 182 aa  108  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.515185  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36 
 
 		 167 aa  108  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1244  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 174 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.61539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2946  Holliday junction resolvase  39.69 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.185202  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1215  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0458654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4203  Holliday junction resolvase  42.67 
 
 		 174 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0438295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.88 
 
 		 175 aa  107  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0138  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.18 
 
 		 174 aa  107  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1841  Holliday junction resolvase  43.08 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291427 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4409  Holliday junction resolvase  40.4 
 
 		 175 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.049138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  40.67 
 
 		 171 aa  107  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  34 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2535  Holliday junction resolvase  41.22 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.278528 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2057  Holliday junction resolvase  38.56 
 
 		 157 aa  106  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1249  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0421  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.07 
 
 		 158 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300701  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3364  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2431  Holliday junction resolvase  40.15 
 
 		 173 aa  106  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0114674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0478  Holliday junction endonuclease RuvC  39.74 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000177165  normal  0.867612 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0268  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 284 aa  106  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2573  Holliday junction resolvase  39.74 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00104649  hitchhiker  0.00130455 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3405  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2534  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3399  Holliday junction resolvase  38.41 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2968  Holliday junction resolvase  38.22 
 
 		 186 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>