More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0494 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 928 aa  645    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 928 aa  645    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.78 
 
 		 915 aa  649    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  43.04 
 
 		 891 aa  687    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  41.35 
 
 		 915 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  42.32 
 
 		 926 aa  689    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  42.64 
 
 		 892 aa  708    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 928 aa  645    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  40.69 
 
 		 906 aa  641    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  41.67 
 
 		 933 aa  676    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  41.15 
 
 		 923 aa  649    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  63.68 
 
 		 944 aa  1181    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  42.95 
 
 		 928 aa  684    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 922 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  41.38 
 
 		 928 aa  642    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  40.54 
 
 		 956 aa  681    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  41.94 
 
 		 915 aa  652    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  42.48 
 
 		 936 aa  707    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  42.39 
 
 		 896 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  42.39 
 
 		 896 aa  670    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 899 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  41.49 
 
 		 928 aa  645    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  41.15 
 
 		 921 aa  649    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 943 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  39.21 
 
 		 941 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  43.6 
 
 		 924 aa  730    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  41.36 
 
 		 929 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 930 aa  670    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  63.04 
 
 		 943 aa  1206    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  41.12 
 
 		 903 aa  667    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  41.72 
 
 		 908 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 918 aa  658    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.59 
 
 		 891 aa  709    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 928 aa  646    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  59.94 
 
 		 945 aa  1138    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  40.81 
 
 		 929 aa  652    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  59.09 
 
 		 924 aa  1098    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  39.66 
 
 		 933 aa  641    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  43.03 
 
 		 892 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  41.13 
 
 		 945 aa  655    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 942 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  42.3 
 
 		 892 aa  663    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 924 aa  657    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  40.69 
 
 		 905 aa  646    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 930 aa  638    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  43.29 
 
 		 892 aa  711    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 928 aa  645    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 949 aa  681    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 890 aa  642    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 945 aa  659    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 934 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.85 
 
 		 926 aa  663    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  43.39 
 
 		 892 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 910 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  44.34 
 
 		 893 aa  692    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  41.15 
 
 		 921 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 899 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.56 
 
 		 928 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  66.63 
 
 		 936 aa  1271    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 934 aa  645    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  39.68 
 
 		 934 aa  648    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  42.49 
 
 		 903 aa  701    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 963 aa  666    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  41.9 
 
 		 888 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  43.91 
 
 		 893 aa  687    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 928 aa  645    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  43.34 
 
 		 946 aa  733    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 932 aa  668    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  40.85 
 
 		 935 aa  649    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 951 aa  640    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  42.22 
 
 		 939 aa  689    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  40.3 
 
 		 922 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 922 aa  645    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  41.77 
 
 		 912 aa  668    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 918 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.82 
 
 		 922 aa  650    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 928 aa  645    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  40.61 
 
 		 930 aa  664    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  41.4 
 
 		 931 aa  656    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  40.71 
 
 		 904 aa  652    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  100 
 
 		 950 aa  1943    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  40.72 
 
 		 921 aa  647    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 939 aa  706    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 911 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  40.78 
 
 		 922 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 893 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  60.98 
 
 		 946 aa  1179    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  41.13 
 
 		 915 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  42.03 
 
 		 908 aa  680    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  39.24 
 
 		 946 aa  635  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 936 aa  634  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 932 aa  633  1e-180  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 928 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 939 aa  634  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 928 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 928 aa  635  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  39.12 
 
 		 928 aa  635  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 928 aa  634  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 932 aa  633  1e-180  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 902 aa  634  1e-180  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>