More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0487 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0487  phosphoribosylamine--glycine ligase  100 
 
 
427 aa  857    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.493201  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0465  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.68 
 
 
435 aa  582  1.0000000000000001e-165  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0528  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.45 
 
 
427 aa  575  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0532  phosphoribosylamine--glycine ligase  67.21 
 
 
426 aa  567  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0171  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.87 
 
 
428 aa  565  1e-160  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1653  phosphoribosylamine--glycine ligase  64.17 
 
 
427 aa  551  1e-156  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0647  phosphoribosylamine--glycine ligase  63 
 
 
426 aa  537  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0115748  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4508  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.96 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0778373 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4419  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.96 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.160091  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4506  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.96 
 
 
429 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0278032 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4386  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.96 
 
 
429 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.677738 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4582  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.73 
 
 
429 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.213422  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0215  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.04 
 
 
430 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0406099  normal  0.0125796 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03882  phosphoribosylamine-glycine ligase  51.27 
 
 
429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000860274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03835  hypothetical protein  51.27 
 
 
429 aa  396  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000931477  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4020  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.27 
 
 
429 aa  396  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000927217  normal  0.0101467 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4239  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.04 
 
 
429 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00124381  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4453  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.04 
 
 
429 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  hitchhiker  0.000392069 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4548  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.27 
 
 
429 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000304372  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1540  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.58 
 
 
433 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.427577  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3988  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.58 
 
 
429 aa  392  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0361396  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4496  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 
429 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000225394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2231  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 
423 aa  394  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0266  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
427 aa  394  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000213794  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1626  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.92 
 
 
432 aa  394  1e-108  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5474  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.58 
 
 
429 aa  394  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.13476  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3451  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.36 
 
 
428 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.264337  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1338  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.57 
 
 
430 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2652  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.15 
 
 
429 aa  391  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0224  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.69 
 
 
428 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0267401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0784  phosphoribosylamine--glycine ligase  51.04 
 
 
422 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.110869  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0292  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.38 
 
 
427 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00181025  normal  0.0133648 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3202  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.11 
 
 
426 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.462795  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06541  phosphoribosylamine-glycine ligase (Eurofung)  45.58 
 
 
809 aa  386  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0610  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
423 aa  385  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00101284  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4823  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
431 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2065  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 
425 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.19426 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1899  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.43 
 
 
428 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.543102  normal  0.253787 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002184  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.69 
 
 
429 aa  385  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.25624  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3708  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.92 
 
 
428 aa  386  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0202463  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0228  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.69 
 
 
428 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0316556  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1952  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.92 
 
 
427 aa  388  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4613  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
431 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.302277 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1704  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.43 
 
 
428 aa  388  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.382123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4698  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
430 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.744432  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5575  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
429 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2342  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.29 
 
 
428 aa  387  1e-106  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.51337  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00211  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.99 
 
 
429 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1427  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
591 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0983  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.19 
 
 
425 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0720926  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4407  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
431 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.357121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2212  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.31 
 
 
426 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5622  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.08 
 
 
425 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0707  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.31 
 
 
429 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0348  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.42 
 
 
422 aa  382  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0909  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
432 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0735  phosphoribosylamine/glycine ligase  50.12 
 
 
425 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.525706  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2843  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.32 
 
 
430 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.294227  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3665  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.77 
 
 
428 aa  382  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64220  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 
429 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.88359  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4876  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 
431 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0361  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.07 
 
 
427 aa  380  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.292405  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2191  phosphoribosylamine--glycine ligase  50 
 
 
422 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0464  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.88 
 
 
428 aa  379  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00032027  normal  0.0111484 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2318  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.66 
 
 
426 aa  378  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57608 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4867  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
431 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3844  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.88 
 
 
428 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000315171  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2827  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.69 
 
 
437 aa  378  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000587328  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0612  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.3 
 
 
430 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.147919  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1230  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 
425 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0617  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.16 
 
 
425 aa  381  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1014  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 
425 aa  379  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02964  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
429 aa  381  1e-104  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1969  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.83 
 
 
433 aa  379  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.949647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3260  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
432 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.207571  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1300  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.65 
 
 
432 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.617554  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0356  phosphoribosylamine--glycine ligase  46.88 
 
 
428 aa  379  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0104682  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1238  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.38 
 
 
425 aa  379  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06880  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.53 
 
 
426 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.285428  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2333  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.54 
 
 
426 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0928506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1729  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.84 
 
 
430 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2684  phosphoribosylamine/glycine ligase  48.97 
 
 
432 aa  378  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0337126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23090  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.31 
 
 
425 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.121893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1245  phosphoribosylamine--glycine ligase  45.18 
 
 
419 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.495633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0394  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.18 
 
 
431 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2988  phosphoribosylamine--glycine ligase  47.66 
 
 
428 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0555  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.14 
 
 
431 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1885  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.49 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2389  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.49 
 
 
422 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2523  phosphoribosylamine--glycine ligase  50.35 
 
 
422 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1384  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.72 
 
 
425 aa  378  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.563842  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1074  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.49 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.497421  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0438  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.02 
 
 
430 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0875  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.02 
 
 
430 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.712895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0312  phosphoribosylamine/glycine ligase  51.76 
 
 
426 aa  377  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0793  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.49 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.296273  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0357  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.49 
 
 
425 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.659716  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1989  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.84 
 
 
422 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2295  phosphoribosylamine--glycine ligase  49.43 
 
 
426 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2759  phosphoribosylamine--glycine ligase  48.6 
 
 
424 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000179977  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>