33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0453 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0453  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
223 aa  443  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.843154 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  68.06 
 
 
220 aa  285  4e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1685  membrane protein  60.93 
 
 
218 aa  275  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1994  phosphatidate cytidylyltransferase  60.99 
 
 
269 aa  272  3e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0497  phosphatidate cytidylyltransferase  65.16 
 
 
226 aa  264  7e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0500  phosphatidate cytidylyltransferase  60.1 
 
 
211 aa  264  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  61.69 
 
 
206 aa  248  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1186  phosphatidate cytidylyltransferase  37.69 
 
 
204 aa  102  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1936  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  32.51 
 
 
198 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168979  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  29.61 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  25.82 
 
 
227 aa  62.4  0.000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1411  phosphatidate cytidylyltransferase  27.32 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
181 aa  55.8  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1815  phosphatidate cytidylyltransferase  27.6 
 
 
181 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  25.98 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3714  hypothetical protein  27.54 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1450  phosphatidate cytidylyltransferase  31.91 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0625007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  29.85 
 
 
235 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  38.24 
 
 
227 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  29.27 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1986  dolichol kinase-like protein  30.07 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00109651  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03177  phosphatidate cytidylyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G13270)  23.53 
 
 
381 aa  47.8  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0441776  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0072  protein of unknown function DUF205  25.14 
 
 
410 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  36.04 
 
 
444 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0763  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
183 aa  45.4  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149439  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1487  hypothetical protein  23.65 
 
 
215 aa  45.1  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  37.11 
 
 
387 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  27.18 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  26.7 
 
 
225 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  27.59 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  23.03 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  29.5 
 
 
237 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>