More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0417 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0417  ABC transporter related  100 
 
 
301 aa  612  9.999999999999999e-175  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0454  ABC transporter-related protein  73.09 
 
 
301 aa  451  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.457213  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1712  ATPase  50.17 
 
 
299 aa  300  2e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0438  ABC transporter related  49.66 
 
 
289 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0371  ABC transporter related  47.96 
 
 
302 aa  286  4e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1995  ABC transporter related  48.62 
 
 
289 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0582  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  47.6 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2281  RNA pseudouridine synthase  48.24 
 
 
285 aa  276  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1716  ABC transporter related protein  49.65 
 
 
286 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.604131  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0680  ABC transporter related  44.07 
 
 
309 aa  256  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0926  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 
290 aa  250  2e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00057204  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0315  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA (Sulfate-transporting ATPase)  45.13 
 
 
284 aa  246  2e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.599525  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1284  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
289 aa  246  3e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0360  molybdenum transport ATP-binding protein  43.6 
 
 
283 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0345  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
294 aa  228  7e-59  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.127515  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0322  molybdenum ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
296 aa  228  7e-59  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2671  ABC transporter related  45.77 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452313  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1442  ABC transporter related  40.57 
 
 
315 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3143  ABC transporter related  42.03 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2342  ABC transporter related protein  47.57 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477655  normal  0.561455 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2243  ABC transporter related  43.17 
 
 
281 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1642  ABC-type sugar transport system, ATPase component  44.08 
 
 
361 aa  179  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174606  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1484  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  41.13 
 
 
343 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  0.0950127 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4297  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.62 
 
 
364 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1047  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 
345 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.330018  normal  0.45373 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1551  ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
366 aa  176  3e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.206455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3645  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.3 
 
 
342 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3817  polyamine ABC transporter ATP-binding protein  42.92 
 
 
382 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217368  normal  0.691578 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2383  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 
363 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
353 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1090  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.75 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4237  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44 
 
 
343 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.391608  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
353 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2088  ABC transporter related  42.92 
 
 
382 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.619396  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.76 
 
 
353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  36.88 
 
 
359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  42.65 
 
 
365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2371  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.33 
 
 
393 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3469  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 
393 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.647978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4133  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2147  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.08 
 
 
371 aa  172  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2664  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 
384 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0379028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3138  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.2 
 
 
423 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.69 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3387  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.2 
 
 
373 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.397374  normal  0.592219 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1337  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
327 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.819184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4007  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
327 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124331  hitchhiker  0.00000000114894 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1952  ABC transporter related  42.47 
 
 
382 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.93 
 
 
332 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1007  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 
327 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0781  ABC transporter related  40.66 
 
 
368 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000566525  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6039  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.89 
 
 
395 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292434  hitchhiker  0.00935557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3307  ABC transporter related  41.89 
 
 
350 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0562  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
374 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4615  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  37.14 
 
 
374 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.268203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0224  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.81 
 
 
359 aa  171  2e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0442  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.22 
 
 
374 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.826065  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3716  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.03 
 
 
355 aa  170  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.841303  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.41 
 
 
364 aa  170  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2621  ABC transporter-related protein  41.07 
 
 
353 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.295311  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2218  ABC transporter related  43.69 
 
 
337 aa  170  3e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.905412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1720  ABC transporter related  44.84 
 
 
342 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.555926  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1620  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
337 aa  170  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1932  ABC transporter related  42.01 
 
 
382 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0195576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2046  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
337 aa  170  3e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000987436 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0517  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
356 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.105133  normal  0.328539 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4791  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.22 
 
 
374 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1733  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
337 aa  170  3e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000359777 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1525  ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
337 aa  170  3e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.78 
 
 
367 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01398  predicted spermidine/putrescine transporter subunit  43.69 
 
 
337 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2205  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
337 aa  169  4e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0635476  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.17 
 
 
355 aa  169  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01409  hypothetical protein  43.69 
 
 
337 aa  169  4e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2789  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.81 
 
 
337 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.669148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3244  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.99 
 
 
384 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.290922  normal  0.910388 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1862  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.78 
 
 
371 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1266  ABC transporter related  36.81 
 
 
365 aa  169  4e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358849  normal  0.95628 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.25 
 
 
353 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1201  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.41 
 
 
327 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 
355 aa  169  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0411  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase  40.41 
 
 
374 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0445  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.41 
 
 
374 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.467134 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0094  ABC transporter-related protein  41.85 
 
 
369 aa  169  5e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0404805  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1034  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  42.19 
 
 
359 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.330861  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1804  ABC-type spermidine/putrescine transport systems ATPase components-like protein  42.99 
 
 
527 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0746  ABC transporter related  41.36 
 
 
380 aa  169  8e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  39.11 
 
 
357 aa  168  9e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.85 
 
 
352 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1398  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
327 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.240911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1177  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
331 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1179  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
331 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00519424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2398  ABC transporter  43.54 
 
 
384 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0142955  normal  0.636582 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0163  ABC transporter related  40.68 
 
 
383 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.283601  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4198  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.61 
 
 
356 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.722311 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1439  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
327 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000273581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1375  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
327 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000557634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.24 
 
 
344 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1289  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.25 
 
 
378 aa  167  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2477  putrescine/spermidine ABC transporter ATPase protein  40.25 
 
 
378 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0899476  normal  0.634641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>