44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0398 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0398  surface antigen msp4 family protein  100 
 
 		 237 aa  466  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000765073  hitchhiker  0.0000318846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0433  hypothetical protein  56.72 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000321544  normal  0.196957 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0396  hypothetical protein  47.24 
 
 		 243 aa  202  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.000000219065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0399  hypothetical protein  48.18 
 
 		 234 aa  201  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000921027  unclonable  0.00000218864 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0432  porin, opacity type  46.98 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000490319  normal  0.0458911 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0329  surface antigen msp4 family protein  47.98 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0226  surface antigen msp4 family protein  40.25 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000460026  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1752  hypothetical protein  40.34 
 
 		 194 aa  139  3e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0180412  normal  0.316081 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1552  hypothetical protein  35.85 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000499206  hitchhiker  0.000157671 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2135  surface antigen msp4 family protein  36.36 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.704163  normal  0.0230075 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1932  surface antigen msp4 family protein  34.68 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.687868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1916  porin opacity type  32.64 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2205  porin, opacity type  34.27 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.570282  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0250  surface antigen msp4 family protein  32.64 
 
 		 215 aa  98.2  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000237774  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2118  outer surface protein, putative  32.92 
 
 		 202 aa  97.1  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000793309  decreased coverage  0.0018778 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0302  outer surface protein, putative  29.36 
 
 		 195 aa  95.9  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000982114  unclonable  0.000000660987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1171  outer surface protein, putative  29.83 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0200976  normal  0.389848 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2117  surface antigen msp4 family protein  30.29 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000016508  decreased coverage  0.00195302 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2083  outer surface protein, putative  30.7 
 
 		 195 aa  85.9  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0262207  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0309  outer surface protein, putative  30.54 
 
 		 190 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.0000000102603  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1545  surface antigen msp4 family protein  30.83 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000466058 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1435  outer surface protein, putative  25.96 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1081  surface antigen msp4 family protein  33.02 
 
 		 190 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000433571  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3431  surface antigen msp4 family protein  29.32 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.791254  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0394  outer surface protein, putative  31.22 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000583804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0767  tia invasion determinant-related protein  29.39 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.111069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1755  outer surface protein, putative  27.31 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.793879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2636  surface antigen msp4 family protein  31.22 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2694  surface antigen msp4 family protein  28.03 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000777895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0802  tia invasion determinant-related protein  28.05 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2487  outer surface protein, putative  23.94 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0335  hypothetical protein  29.28 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.294992  normal  0.308689 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0354  putative outer membrane adhesin  29.28 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.408494 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0347  hypothetical protein  29.28 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.079065 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0344  putative outer membrane adhesin  28.83 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0902734 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0853  OmpA/MotB domain-containing protein  31.32 
 
 		 373 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.452526 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0339  putative outer membrane adhesin  28.83 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  30 
 
 		 357 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  29.38 
 
 		 409 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  28.21 
 
 		 373 aa  50.4  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4218  porin opacity type  28.42 
 
 		 238 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.528572  normal  0.904253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  24.36 
 
 		 401 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0389  heat resistant agglutinin  24.88 
 
 		 181 aa  46.2  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1789  opacity family porin protein  31.34 
 
 		 181 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>