More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0360 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 
281 aa  558  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  52.96 
 
 
277 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  55.3 
 
 
273 aa  265  8.999999999999999e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  53.93 
 
 
274 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  51.87 
 
 
273 aa  237  2e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0362  phosphatidate cytidylyltransferase  51.7 
 
 
284 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  54.37 
 
 
271 aa  234  9e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  36.08 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  34.6 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  37.63 
 
 
281 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  36.68 
 
 
310 aa  125  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  33.46 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
280 aa  124  2e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  36.5 
 
 
281 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  31.21 
 
 
282 aa  122  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  46.05 
 
 
281 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  39.18 
 
 
280 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  35.66 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  36.4 
 
 
341 aa  120  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  31.09 
 
 
269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2800  phosphatidate cytidylyltransferase  35.74 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00280396  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1818  phosphatidate cytidylyltransferase  33 
 
 
332 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955485  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  33.82 
 
 
277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
277 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23590  CDP-diglyceride synthetase  33.72 
 
 
280 aa  116  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0168367 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  34.74 
 
 
293 aa  115  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  31.65 
 
 
271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  34.19 
 
 
271 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
242 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  39.53 
 
 
282 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  34.43 
 
 
271 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  34.19 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0394  phosphatidate cytidylyltransferase  34.29 
 
 
288 aa  113  4.0000000000000004e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  34.19 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2690  phosphatidate cytidylyltransferase  41.89 
 
 
282 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.515203  normal  0.508941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2080  phosphatidate cytidylyltransferase  36.19 
 
 
293 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  34.3 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  34.71 
 
 
285 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4434  phosphatidate cytidylyltransferase  44.9 
 
 
270 aa  112  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000775882 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  29.84 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  43.02 
 
 
285 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2604  phosphatidate cytidylyltransferase  38.33 
 
 
281 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  34.49 
 
 
277 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  28.99 
 
 
306 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1784  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
286 aa  109  5e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0672508  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  39.89 
 
 
233 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1993  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
281 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  31.47 
 
 
284 aa  108  9.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  26.09 
 
 
306 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  32.84 
 
 
264 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  40.38 
 
 
296 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38940  phosphatidate cytidylyltransferase  39.66 
 
 
271 aa  107  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  45.19 
 
 
271 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  44.93 
 
 
285 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  40.74 
 
 
265 aa  107  3e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  44.2 
 
 
285 aa  106  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  29.5 
 
 
275 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  32.36 
 
 
264 aa  105  7e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  32.88 
 
 
282 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  32.88 
 
 
282 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  32.88 
 
 
282 aa  105  8e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  36.36 
 
 
267 aa  105  9e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2580  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
284 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  0.0361828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  32.22 
 
 
246 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  30.92 
 
 
259 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  42.21 
 
 
270 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  31.72 
 
 
303 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1228  phosphatidate cytidylyltransferase  42.95 
 
 
284 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1974  putative phosphatidate cytidylyltransferase membrane protein  43.62 
 
 
279 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.104945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  36.14 
 
 
270 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 
260 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2150  phosphatidate cytidylyltransferase  46.38 
 
 
273 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.74 
 
 
260 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  30.4 
 
 
263 aa  103  3e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  40.97 
 
 
258 aa  103  3e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  44.96 
 
 
276 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0708389 
 
 
-
 
NC_004310  BR1157  phosphatidate cytidylyltransferase  34.14 
 
 
270 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558759  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1114  phosphatidate cytidylyltransferase  34.14 
 
 
278 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  41.01 
 
 
279 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1596  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
271 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.832347 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1558  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
287 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.17407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1559  phosphatidate cytidylyltransferase  42.14 
 
 
285 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000232769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4181  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
271 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  41.72 
 
 
285 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  41.72 
 
 
285 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  41.72 
 
 
285 aa  102  6e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  41.72 
 
 
285 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  41.72 
 
 
285 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  41.72 
 
 
285 aa  102  6e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  46.88 
 
 
283 aa  102  6e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  41.72 
 
 
249 aa  102  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  41.72 
 
 
285 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  42.76 
 
 
271 aa  102  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3206  phosphatidate cytidylyltransferase  34.1 
 
 
262 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000220075  hitchhiker  0.0000000667053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  38.51 
 
 
285 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  35.06 
 
 
267 aa  101  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1151  phosphatidate cytidylyltransferase  44.44 
 
 
271 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1799  phosphatidate cytidylyltransferase  40.37 
 
 
275 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0755576  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  30.13 
 
 
267 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  43.17 
 
 
285 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>