22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0274 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2693  photosystem P840 reaction center, large subunit  84.54 
 
 
731 aa  1315  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00010493  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0274  photosystem P840 reaction center, large subunit  100 
 
 
731 aa  1496  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  5.80216e-08  unclonable  3.20304e-06 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0305  photosystem P840 reaction center, large subunit  93.45 
 
 
733 aa  1386  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464493 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0182  photosystem P840 reaction center, large subunit  85.09 
 
 
731 aa  1320  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  1.0763e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0219  photosystem P840 reaction center, large subunit  86.46 
 
 
731 aa  1344  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118063  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1976  photosystem P840 reaction center, large subunit  85.15 
 
 
734 aa  1319  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  3.29009e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0343  photosystem P840 reaction center, large subunit  83.58 
 
 
731 aa  1306  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  2.49067e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19571  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  24.88 
 
 
768 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.300705  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1082  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  24.88 
 
 
768 aa  48.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0332  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  26.84 
 
 
737 aa  47.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0306945  normal  0.0992407 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4104  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  35 
 
 
742 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4143  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  35 
 
 
742 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00848687  normal  0.293188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4668  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  33.75 
 
 
738 aa  45.8  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.0126467 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2048  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  33.75 
 
 
734 aa  45.4  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.55767  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0402  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  33.75 
 
 
742 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.671863 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1994  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  27.27 
 
 
735 aa  45.4  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.28805  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0399  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  33.75 
 
 
738 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.992775 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23481  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1  26.17 
 
 
776 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.735278 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0547  photosystem I core protein PsaA  23.91 
 
 
752 aa  44.7  0.007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483497  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17151  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  33.75 
 
 
742 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17271  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  33.75 
 
 
742 aa  44.3  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2406  photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2  31.25 
 
 
741 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185378  hitchhiker  4.43533e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>