More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0242 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0242  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 444 aa  901    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.231209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0278  outer membrane efflux protein  63.26 
 
 		 441 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000626538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0183  outer membrane efflux protein  48.98 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  47.8 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2350  outer membrane efflux protein  49.64 
 
 		 441 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  48.99 
 
 		 445 aa  390  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0122  LipD protein, putative  46.88 
 
 		 413 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  26.99 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  27.15 
 
 		 447 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  26.42 
 
 		 447 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  24.17 
 
 		 441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4230  outer membrane efflux protein  26.97 
 
 		 458 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0431504  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  25.81 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  22.57 
 
 		 458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  24.84 
 
 		 441 aa  111  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  26.16 
 
 		 437 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  27.75 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  27.91 
 
 		 535 aa  109  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 467 aa  106  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3468  outer membrane efflux protein  25.76 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000163735  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 483 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  24.77 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2154  outer membrane protein CyaE, putative  27.94 
 
 		 453 aa  98.6  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  24.22 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0453  Outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 470 aa  98.2  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  26.13 
 
 		 496 aa  97.1  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  27.11 
 
 		 1496 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  25.22 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1162  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 515 aa  94  5e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000199135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.89 
 
 		 455 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1456  outer membrane efflux protein  27.6 
 
 		 446 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.974754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  27.41 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  23.41 
 
 		 463 aa  87  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  22.58 
 
 		 463 aa  86.7  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 431 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  26.23 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0120  outer membrane efflux protein  24.42 
 
 		 448 aa  84.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000165447  hitchhiker  0.000000000000561163 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.44 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  23.5 
 
 		 427 aa  84  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  20.85 
 
 		 438 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.54 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0207  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 523 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0986  outer membrane efflux protein, putative  24.94 
 
 		 484 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1531  outer membrane efflux protein  25.22 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2692  outer membrane efflux protein  25.6 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.922433  normal  0.254416 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 471 aa  77.8  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1665  outer membrane efflux protein  22.63 
 
 		 464 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4294  outer membrane efflux protein  26.78 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0190007  normal  0.396606 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 462 aa  73.2  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22.95 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  23.81 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  21.88 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  25.23 
 
 		 421 aa  71.2  0.00000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1633  outer membrane efflux protein  21.41 
 
 		 470 aa  70.5  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.788464  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1723  outer membrane efflux protein  23.99 
 
 		 436 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  22.25 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1941  outer membrane efflux protein  22.3 
 
 		 432 aa  69.7  0.0000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01115  putative outer membrane transport/efflux protein  21.66 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  22.78 
 
 		 493 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  27.1 
 
 		 455 aa  67.8  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0762  outer membrane efflux protein  24.68 
 
 		 446 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  22.27 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3378  outer membrane efflux protein  23.57 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.106709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1440  outer membrane efflux protein  24.79 
 
 		 503 aa  67  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 463 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  27.4 
 
 		 456 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  23.95 
 
 		 438 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0041  outer membrane protein, putative  23.38 
 
 		 457 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.229451  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2559  outer membrane efflux protein  23.62 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.413213  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  24.78 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  23.01 
 
 		 423 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4505  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 972 aa  65.5  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.300614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  26.26 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  24.14 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2439  TolC family type I secretion outer membrane protein  25 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.690734 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1698  outer membrane efflux protein  25.17 
 
 		 433 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572085  normal  0.0641673 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  20.44 
 
 		 443 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0617  outer membrane efflux protein  20.93 
 
 		 447 aa  62  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1338  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.96 
 
 		 456 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728783  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1015  outer membrane protein  21.35 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.22355e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4306  outer membrane efflux protein  25.12 
 
 		 447 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 447 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2367  outer membrane efflux protein  24.07 
 
 		 495 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  23.89 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1333  outer membrane efflux protein, putative  24.95 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0611  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.92 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  23.2 
 
 		 419 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  24.19 
 
 		 1470 aa  60.5  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0543  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.88 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.991736 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1727  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.08 
 
 		 452 aa  59.7  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1165  Outer membrane efflux protein  25.59 
 
 		 462 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  22.94 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  24.26 
 
 		 447 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.15 
 
 		 463 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  20.64 
 
 		 449 aa  58.9  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>