More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0220 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  100 
 
 
163 aa  339  1e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  67.53 
 
 
170 aa  219  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  59.35 
 
 
165 aa  162  3e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  52.74 
 
 
163 aa  153  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  73.91 
 
 
171 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  51.72 
 
 
171 aa  149  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  70 
 
 
150 aa  142  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  64.95 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2367  rare lipoprotein A  62.11 
 
 
128 aa  134  7.000000000000001e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  53.17 
 
 
360 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  64.13 
 
 
342 aa  131  3.9999999999999996e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  53.17 
 
 
360 aa  131  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3150  rare lipoprotein A family protein  64.04 
 
 
211 aa  131  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  55.36 
 
 
335 aa  130  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  65.56 
 
 
167 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2970  rare lipoprotein A family protein  64.04 
 
 
211 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  64.04 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  64.04 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0043  rare lipoprotein A family protein  64.04 
 
 
211 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  66.29 
 
 
122 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  63.44 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  64.04 
 
 
242 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  64.04 
 
 
230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3902  rare lipoprotein A family protein  64.04 
 
 
211 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  62.5 
 
 
121 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  63.04 
 
 
324 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  59.78 
 
 
358 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  64.44 
 
 
121 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4129  rare lipoprotein A  43.75 
 
 
213 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.905636 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  57.58 
 
 
166 aa  124  5e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
119 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0214  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
203 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  63.33 
 
 
163 aa  124  6e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
124 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0200  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
203 aa  123  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3389  rare lipoprotein A  50 
 
 
214 aa  123  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  64.04 
 
 
122 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
124 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  53.06 
 
 
181 aa  122  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0195  rare lipoprotein A  44.6 
 
 
202 aa  123  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489761  hitchhiker  0.00000000287556 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  61.11 
 
 
239 aa  122  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0268  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
203 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.170156 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  57.58 
 
 
371 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0286  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
213 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.838824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
155 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  64.77 
 
 
121 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  63.33 
 
 
186 aa  122  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2820  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
213 aa  121  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  45.04 
 
 
238 aa  121  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
212 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  54.46 
 
 
157 aa  121  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0831  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
198 aa  121  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000124271  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01654  rare lipoprotein A  41.82 
 
 
322 aa  120  5e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000527551  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  57.58 
 
 
367 aa  121  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4680  rare lipoprotein A  44.97 
 
 
199 aa  121  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  47.97 
 
 
179 aa  120  6e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2537  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
243 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.875468  normal  0.18015 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1081  rare lipoprotein A  59.14 
 
 
270 aa  120  7e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.95704  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  49.17 
 
 
127 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0403  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
200 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0301  rare lipoprotein A rlpa  59.34 
 
 
240 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.665029  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  46.4 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0471  putative rare lipoprotein A  58.89 
 
 
263 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000420345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  51.89 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  54.9 
 
 
262 aa  119  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  43.65 
 
 
142 aa  118  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0531  rare lipoprotein A  51.43 
 
 
370 aa  118  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1470  rare lipoprotein A  53.76 
 
 
282 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00612022  normal  0.287685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  58.7 
 
 
125 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3795  rare lipoprotein A  53 
 
 
337 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.443521  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  58.7 
 
 
125 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4315  rare lipoprotein A  57.3 
 
 
200 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12090  RlpA family lipoprotein  56.52 
 
 
341 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751179  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  54.64 
 
 
196 aa  117  6e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1109  putative lipoprotein  56.52 
 
 
342 aa  117  6e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0121  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
199 aa  117  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3488  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
265 aa  117  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000216134 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1133  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
260 aa  117  9e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0478677  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
221 aa  116  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1557  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
321 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000368198  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0696  rare lipoprotein A  53.33 
 
 
270 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  55.32 
 
 
162 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  55.1 
 
 
261 aa  116  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  56.52 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  61.11 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  52.17 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  56.7 
 
 
168 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1579  rare lipoprotein A  56.67 
 
 
408 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00357969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2938  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
265 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000804744  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  61.96 
 
 
124 aa  115  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  55.06 
 
 
114 aa  115  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  59.55 
 
 
124 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0749  rare lipoprotein A  50 
 
 
275 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0714634  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0674  rare lipoprotein A  50 
 
 
266 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.391975  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1353  rare lipoprotein A  50 
 
 
275 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.582482  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2591  rare lipoprotein A  52.43 
 
 
278 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00126384  normal  0.496007 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0823  rare lipoprotein A  58.43 
 
 
281 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0647438  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0265  rare lipoprotein A  55.91 
 
 
286 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0973741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>