85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0199 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0199  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 333 aa  686    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0208  Radical SAM domain protein  85.59 
 
 		 333 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.819308  hitchhiker  0.00109807 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1451  hypothetical protein  74.92 
 
 		 335 aa  531  1e-150  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000857119  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1913  hypothetical protein  64.76 
 
 		 334 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.971358  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3188  radical SAM domain-containing protein  60.18 
 
 		 329 aa  434  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1926  Radical SAM domain protein  45.57 
 
 		 334 aa  290  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1526  hypothetical protein  59.04 
 
 		 84 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0563  biotin synthase  27.51 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.295179  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0821  biotin synthase  23.99 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0695199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1569  biotin synthase  24.83 
 
 		 331 aa  60.8  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.690546 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2972  biotin synthase  24.71 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.138576  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02190  biotin synthase  26.02 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2002  biotin synthase  23.76 
 
 		 335 aa  60.1  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.678074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1331  biotin synthase  25.63 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7724  biotin synthase  25 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3189  biotin synthase  24.1 
 
 		 345 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000310414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0682  biotin synthase  24.25 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1518  biotin synthase  24.83 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000115411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1571  biotin synthase  27.01 
 
 		 411 aa  57  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.598658  normal  0.287862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0422  biotin synthase  25.27 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11991  biotin synthase  22.64 
 
 		 335 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.496147  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1104  biotin synthase  22.64 
 
 		 335 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.915369  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3698  biotin synthase  23.16 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00270895  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11606  biotin synthase  23.76 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00001352  normal  0.936765 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0875  biotin synthase  26.2 
 
 		 356 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12001  biotin synthase  23.27 
 
 		 314 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.678797  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1048  biotin synthase  24.12 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.11115  normal  0.576015 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1244  Radical SAM domain protein  25.28 
 
 		 360 aa  52.4  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1825  biotin synthase  25.36 
 
 		 326 aa  52.4  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0542557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3624  biotin synthase  24.25 
 
 		 331 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.193538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0612  biotin synthase  26.05 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0156  biotin synthase  25.34 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19160  biotin synthase  23.36 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0257647  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11841  biotin synthase  22.69 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.47971  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0107  biotin synthase  25.4 
 
 		 344 aa  50.1  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.156568  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16510  iron-only hydrogenase maturation protein HydE  25.19 
 
 		 351 aa  49.3  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0469  biotin synthase  23.79 
 
 		 354 aa  49.7  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778897 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3644  biotin synthase  26.32 
 
 		 345 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2190  Biotin synthase  23.48 
 
 		 337 aa  49.3  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0506  biotin synthase  25.93 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3763  biotin synthase  24.23 
 
 		 358 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.47987  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02874  biotin synthase  25.68 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0430  biotin synthase  24.76 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.230205  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0271  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 347 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.195415  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0430  biotin synthase  23.19 
 
 		 321 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000207038  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0492  biotin synthase  25.12 
 
 		 328 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1035  biotin synthase  22.43 
 
 		 335 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0231112 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0963  biotin synthase  24.89 
 
 		 326 aa  47.4  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.032686  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0419  biotin synthase  24.64 
 
 		 320 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.22535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_46799  predicted protein  26.7 
 
 		 311 aa  47  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.970391 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0604  biotin synthase  23.22 
 
 		 333 aa  47  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0570  biotin synthase  24.52 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.965755  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2292  biotin synthase  24.11 
 
 		 349 aa  47  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0655  biotin synthase  23.01 
 
 		 345 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.477951  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2916  biotin synthase  27.05 
 
 		 320 aa  46.2  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.431828 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2045  biotin synthase  25.62 
 
 		 350 aa  46.2  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0111965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0492  biotin synthase  25.66 
 
 		 321 aa  46.2  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.395668 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1329  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 346 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8311  Biotin synthase  23.81 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5738  biotin synthase  23.08 
 
 		 347 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14871  biotin synthase  23.01 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.598492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1580  biotin synthase  25 
 
 		 344 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10790  biotin synthase  24.25 
 
 		 338 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0103  biotin synthase  24.05 
 
 		 322 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0757617  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3077  biotin synthase  24.14 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.784786  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0535  biotin synthase  23.58 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.464062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1175  biotin synthase  22.18 
 
 		 328 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0717742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3415  biotin synthase  26.01 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.371377  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0409  biotin synthase  24.14 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0984  biotin synthase  24.32 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00265011 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1855  biotin synthase  25.31 
 
 		 350 aa  44.3  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2017  biotin synthase  24.14 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0371  biotin synthase  25.48 
 
 		 339 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.478786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2269  biotin synthase  24.14 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0337  biotin synthase  24.15 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0388  biotin synthase  24.14 
 
 		 339 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1130  biotin synthase  25.37 
 
 		 352 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000236268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1839  biotin synthase  22 
 
 		 353 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0814889  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1100  Radical SAM domain protein  22.81 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00787041  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0149  biotin synthase  26.06 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.464836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3090  biotin synthase  24.24 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136649 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3133  biotin synthase  24.24 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.628952 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3073  biotin synthase  24.24 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4266  biotin synthase  23.26 
 
 		 360 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0569769 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30955  Biotin synthase  25.99 
 
 		 361 aa  43.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0547155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>