99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0182 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0182  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  100 
 
 
365 aa  746    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.630616  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0192  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  45.81 
 
 
354 aa  316  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000042827  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1037  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.95 
 
 
227 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17094  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3411  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.95 
 
 
227 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1090  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.95 
 
 
227 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.930718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.19 
 
 
233 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.31 
 
 
233 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.75 
 
 
233 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0731  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.07 
 
 
232 aa  87  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.675493  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  26.87 
 
 
233 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  26.87 
 
 
233 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0115  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.72 
 
 
478 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0115  hypothetical protein  25.72 
 
 
478 aa  86.7  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.3697  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.88 
 
 
236 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.45 
 
 
236 aa  86.3  8e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.45 
 
 
236 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  27.35 
 
 
236 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.35 
 
 
236 aa  84  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.02 
 
 
236 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.02 
 
 
236 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  28.26 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.451187 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  26.94 
 
 
236 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.9 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579479  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  33.52 
 
 
229 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.29 
 
 
148 aa  74.7  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.952791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  29.49 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0508  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.75 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0260  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.05 
 
 
206 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.77 
 
 
278 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2470  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.41 
 
 
282 aa  63.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0121591  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2320  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.55 
 
 
165 aa  63.2  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0137  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.0000000000209855  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1402  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.17 
 
 
146 aa  59.3  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.418877  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5095  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.58 
 
 
150 aa  58.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.760748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1548  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  33.04 
 
 
305 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2713  hypothetical protein  39.24 
 
 
269 aa  57  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  47.54 
 
 
151 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.540401  normal  0.154785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3147  hypothetical protein  31.07 
 
 
246 aa  55.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.075945  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0254  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  40.74 
 
 
266 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3124  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  32.35 
 
 
143 aa  54.3  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000058993  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1051  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.51 
 
 
524 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.488391  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0603  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  44.64 
 
 
220 aa  53.5  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112924  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0135  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  30.56 
 
 
397 aa  53.1  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000192889  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0238  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  34.34 
 
 
204 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.282417  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1384  hypothetical protein  37.88 
 
 
281 aa  53.1  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0928654  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0798  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.19 
 
 
273 aa  52.8  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.146449  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2944  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  47.46 
 
 
154 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3930  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  29.46 
 
 
274 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0748  hypothetical protein  33.75 
 
 
275 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.455346  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3278  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  29.46 
 
 
280 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2088  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.52 
 
 
197 aa  52  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.162999  normal  0.076046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2578  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  25.64 
 
 
279 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0644  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  42.86 
 
 
226 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.143261 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0957  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  33.68 
 
 
181 aa  50.4  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2054  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.15 
 
 
234 aa  50.1  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  0.117423 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1558  putative heat shock protein  32.04 
 
 
170 aa  49.7  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0443108  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1135  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  37.35 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.566591  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3439  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.95 
 
 
258 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2665  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.58 
 
 
335 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2239  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  36.08 
 
 
181 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.393899  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1424  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.36 
 
 
152 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2359  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  34.74 
 
 
181 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.714187  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2343  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  35.16 
 
 
181 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0123815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1708  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.16 
 
 
181 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2320  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.16 
 
 
181 aa  48.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0410  hypothetical protein  32.5 
 
 
192 aa  47.8  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542027  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1816  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  40.28 
 
 
242 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5662  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  35.16 
 
 
181 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938365  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2526  copper resistance lipoprotein NlpE  27.92 
 
 
148 aa  47.4  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4623  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.87 
 
 
257 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0179388  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2878  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.17 
 
 
241 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0977  hypothetical protein  32.97 
 
 
187 aa  47.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3498  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  28.85 
 
 
221 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1050  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.51 
 
 
283 aa  46.6  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3143  hypothetical protein  30.95 
 
 
203 aa  46.6  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  26.11 
 
 
150 aa  46.6  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1186  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323907  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1348  hypothetical protein  31.87 
 
 
224 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1923  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.87534  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1194  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.121272  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0834  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.653609  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1033  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.365055  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0316  hypothetical protein  31.87 
 
 
182 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00587093  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2405  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  27.72 
 
 
138 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.437003  hitchhiker  0.00230018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0694  hypothetical protein  39.29 
 
 
246 aa  45.1  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00754314  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  25.93 
 
 
168 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1244  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30.43 
 
 
183 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.603755 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2958  hypothetical protein  28.08 
 
 
171 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3302  hypothetical protein  31.52 
 
 
179 aa  44.3  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0761077  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  25.93 
 
 
170 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0787  heat shock protein  33.06 
 
 
166 aa  44.3  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0351684 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  28.43 
 
 
168 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1727  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.17 
 
 
132 aa  43.9  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000179415  normal  0.7023 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3778  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.76 
 
 
251 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2593  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  30 
 
 
267 aa  43.9  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3829  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.76 
 
 
251 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.238028  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0695  hypothetical protein  35.71 
 
 
267 aa  43.1  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  25.17 
 
 
149 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4523  protein of unknown function DUF306 Meta and HslJ  31.82 
 
 
139 aa  42.7  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.207196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>