More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0159 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0159  single-strand binding protein  100 
 
 
156 aa  327  3e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  3.21111e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0108  single-strand binding protein  88.61 
 
 
157 aa  286  7e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  3.26316e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0148  single-strand binding protein  86.71 
 
 
157 aa  286  8e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  6.762e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2511  single-strand binding protein  87.34 
 
 
157 aa  282  2e-75  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000121094  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0115  single-strand binding protein  84.18 
 
 
158 aa  274  3e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0163  single-strand binding protein  81.99 
 
 
160 aa  273  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  8.10976e-07  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0095  single-strand binding protein  84.97 
 
 
152 aa  265  1e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  41.28 
 
 
151 aa  94  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  41.28 
 
 
152 aa  94  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  40.52 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  5.49741e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  43.52 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  40.68 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.24693e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  41.82 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2096  single-strand binding protein  40.54 
 
 
161 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.79273e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.19 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0045  single-strand binding protein  45.37 
 
 
141 aa  87.8  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  37.61 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.43406e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  37.39 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  3.5303e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  36.04 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  36.04 
 
 
146 aa  85.9  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  1.56614e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  39.81 
 
 
166 aa  85.5  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2915  single-strand binding protein  37.74 
 
 
148 aa  84.7  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.23705e-09  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4935  single-strand binding protein  41.67 
 
 
137 aa  84  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.13626e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  37.59 
 
 
134 aa  84  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  2.3456e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  36.97 
 
 
180 aa  83.2  1e-15  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
173 aa  82.4  2e-15  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.22021e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
172 aa  82.4  2e-15  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.0973e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5583  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
173 aa  82.4  2e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12199e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
172 aa  82.4  2e-15  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5600  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
170 aa  82.4  2e-15  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0046868  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3416  single-strand binding protein  39.81 
 
 
164 aa  82  2e-15  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.39016e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  38.89 
 
 
166 aa  82.4  2e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
169 aa  82.4  2e-15  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.2759e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4013  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
164 aa  82.8  2e-15  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
173 aa  82.4  2e-15  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.26746e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0129  single-strand binding protein  37.74 
 
 
154 aa  82.4  2e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000140231  normal  0.824498 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5326  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
173 aa  82.4  2e-15  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105946  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  37.04 
 
 
147 aa  82  3e-15  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.41012e-07  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  37.04 
 
 
146 aa  82  3e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  36.28 
 
 
175 aa  82  3e-15  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
173 aa  81.6  4e-15  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  38.94 
 
 
172 aa  81.6  4e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.80691e-06  hitchhiker  4.31686e-07 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  38.46 
 
 
176 aa  81.3  5e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3011  single-strand binding protein  39.64 
 
 
156 aa  81.3  5e-15  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  37.8 
 
 
174 aa  81.3  5e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  36.61 
 
 
150 aa  81.3  5e-15  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  9.4495e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  36.7 
 
 
146 aa  80.9  6e-15  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  39.09 
 
 
171 aa  80.9  6e-15  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  34.53 
 
 
135 aa  80.9  7e-15  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  1.99282e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  33.81 
 
 
135 aa  80.9  7e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  3.83918e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  36.76 
 
 
133 aa  80.5  7e-15  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  9.00407e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  36.28 
 
 
165 aa  80.5  9e-15  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5911  single-strand binding protein  31.85 
 
 
157 aa  80.1  1e-14  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2215  single-strand binding protein  37.5 
 
 
142 aa  79.7  1e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23350  single-strand binding protein  38.35 
 
 
133 aa  79.7  1e-14  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.67815e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  37.84 
 
 
172 aa  79.7  1e-14  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  34.78 
 
 
161 aa  79.7  1e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  41.67 
 
 
168 aa  79.7  1e-14  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  4.529e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  38.18 
 
 
135 aa  80.1  1e-14  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  2.32202e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3545  single-strand binding protein  38.89 
 
 
164 aa  79.3  2e-14  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  38.94 
 
 
157 aa  79.3  2e-14  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  36.45 
 
 
150 aa  79  2e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  2.17555e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  35.71 
 
 
160 aa  78.6  3e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  37.04 
 
 
167 aa  78.2  4e-14  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0056  single-strand binding protein  36.7 
 
 
142 aa  78.2  4e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.53861e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  36.28 
 
 
166 aa  78.2  4e-14  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  41.18 
 
 
147 aa  77.4  6e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  36.45 
 
 
137 aa  77.4  6e-14  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  32.79 
 
 
139 aa  76.6  1e-13  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  33.09 
 
 
152 aa  76.6  1e-13  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  6.2046e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  35.14 
 
 
143 aa  75.9  2e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  8.57397e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  38.26 
 
 
188 aa  75.9  2e-13  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  37.04 
 
 
156 aa  75.9  2e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  37.04 
 
 
156 aa  75.9  2e-13  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  36.29 
 
 
192 aa  75.5  3e-13  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  31.54 
 
 
238 aa  75.1  3e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  36.94 
 
 
163 aa  75.1  3e-13  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  36.94 
 
 
158 aa  75.1  3e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1357  single-strand binding protein  34.82 
 
 
144 aa  75.1  3e-13  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  34.21 
 
 
139 aa  75.1  3e-13  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  5.67752e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  32.79 
 
 
139 aa  75.5  3e-13  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  30.22 
 
 
139 aa  75.1  3e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0165  single-strand binding protein  36.45 
 
 
301 aa  74.7  4e-13  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  7.79972e-05  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  35.19 
 
 
163 aa  74.7  4e-13  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  39.62 
 
 
185 aa  74.7  5e-13  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  38.1 
 
 
186 aa  74.7  5e-13  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  36.04 
 
 
156 aa  73.9  7e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  36.04 
 
 
156 aa  73.9  7e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  36.04 
 
 
156 aa  73.9  7e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  36.04 
 
 
156 aa  73.9  7e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  32.74 
 
 
150 aa  73.6  9e-13  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  34.55 
 
 
140 aa  73.9  9e-13  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0045  single-stranded DNA-binding protein  37.96 
 
 
169 aa  73.2  1e-12  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  35.4 
 
 
156 aa  73.6  1e-12  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  37.61 
 
 
160 aa  73.6  1e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1218  single-stranded DNA-binding protein  41.24 
 
 
218 aa  72.4  2e-12  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  33.33 
 
 
175 aa  72.8  2e-12  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0828  single-strand binding protein  39.05 
 
 
275 aa  72.4  2e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.333907  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  38.53 
 
 
175 aa  72.8  2e-12  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  2.69191e-15  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4354  single-strand binding protein  36.04 
 
 
148 aa  72.8  2e-12  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>