More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0157 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0157  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 258 aa  527  1e-149  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00989742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0161  exodeoxyribonuclease III Xth  65.89 
 
 		 256 aa  361  6e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.011362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0146  exodeoxyribonuclease III Xth  63.78 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00325986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2513  exodeoxyribonuclease III Xth  62.79 
 
 		 256 aa  338  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.120216  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0113  AP endonuclease  57.69 
 
 		 267 aa  311  9e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4139  exodeoxyribonuclease III Xth  40.16 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000428819 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0459  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0431  exodeoxyribonuclease III  39.53 
 
 		 262 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0460  exodeoxyribonuclease III Xth  39.76 
 
 		 264 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0551  exodeoxyribonuclease III  34.38 
 
 		 336 aa  155  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0958  exodeoxyribonuclease III Xth  36.54 
 
 		 253 aa  152  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0045  exodeoxyribonuclease III  35.02 
 
 		 252 aa  152  7e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1258  exodeoxyribonuclease III Xth  34.23 
 
 		 257 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0305  exodeoxyribonuclease III  35.41 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.859926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4586  exodeoxyribonuclease III Xth  35.77 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000013952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3839  exodeoxyribonuclease III  34.63 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0282  exodeoxyribonuclease III  34.63 
 
 		 259 aa  148  7e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3496  exodeoxyribonuclease III  34.63 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0181471  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  33.83 
 
 		 279 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0254  exodeoxyribonuclease III  34.24 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2159  exodeoxyribonuclease III Xth  35 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2415  exodeoxyribonuclease III Xth  36.4 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1064  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0288989 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1460  exodeoxyribonuclease III  34.24 
 
 		 252 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000456655 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1722  exodeoxyribonuclease III  33.07 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0353  exodeoxyribonuclease III Xth  33.59 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.740813  normal  0.996047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1451  exodeoxyribonuclease III Xth  33.85 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.991336  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0174  exodeoxyribonuclease III  33.59 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.100757  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0823  exodeoxyribonuclease III  35.8 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0089  exodeoxyribonuclease III  32.81 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0647861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0521  exodeoxyribonuclease III Xth  33.07 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000060728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  33.96 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0541  exodeoxyribonuclease III  34.24 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.50716  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3584  exodeoxyribonuclease III  33.85 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  34.88 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3868  exodeoxyribonuclease III  33.85 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3750  exodeoxyribonuclease III  33.85 
 
 		 252 aa  143  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000021797 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2145  exodeoxyribonuclease III  32.53 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3507  exodeoxyribonuclease III Xth  33.07 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0122233  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  35.34 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  35.82 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3484  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 252 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.385947  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1192  exodeoxyribonuclease III  33.73 
 
 		 250 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0173462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0130  exodeoxyribonuclease III  33.85 
 
 		 257 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4271  exodeoxyribonuclease III Xth  34.36 
 
 		 256 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1799  exodeoxyribonuclease III  32.42 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.123762  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  35.5 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2271  exodeoxyribonuclease III Xth  33.07 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0696  exodeoxyribonuclease III Xth  34.36 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0151551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0949  exodeoxyribonuclease III  34.11 
 
 		 251 aa  139  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0377  exodeoxyribonuclease III Xth  33.07 
 
 		 255 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  33.46 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1629  exodeoxyribonuclease III  34.24 
 
 		 251 aa  139  4.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3497  exodeoxyribonuclease III  33.2 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1377  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 250 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00689884  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  32.33 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  32.33 
 
 		 262 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3322  exodeoxyribonuclease III Xth  32.94 
 
 		 253 aa  138  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000530541  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2008  exodeoxyribonuclease III Xth  34.24 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0832  exodeoxyribonuclease III Xth  32.55 
 
 		 253 aa  138  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808552  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1210  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.47 
 
 		 237 aa  138  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0491626  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0881  exodeoxyribonuclease III Xth  31.09 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  34.07 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0982  exodeoxyribonuclease III  31.64 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1725  exodeoxyribonuclease III Xth  33.85 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.569641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3242  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.55 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0851525 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  33.08 
 
 		 282 aa  136  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0321  exodeoxyribonuclease III  33.98 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.323864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2456  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 259 aa  135  5e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0269  exodeoxyribonuclease III  33.59 
 
 		 254 aa  135  6.0000000000000005e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  34.73 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  33.08 
 
 		 260 aa  135  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3378  exodeoxyribonuclease III Xth  34.73 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0851015 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  32.95 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  33.33 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0339  exodeoxyribonuclease III Xth  32.28 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.361272  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0702  hypothetical protein  33.71 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0684  hypothetical protein  33.71 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  32.56 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  32.2 
 
 		 260 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  33.33 
 
 		 258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0254  exodeoxyribonuclease III Xth  33.33 
 
 		 249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.345857  normal  0.41311 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1247  exodeoxyribonuclease III Xth  33.2 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  32.56 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0582  exodeoxyribonuclease III Xth  31.35 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.24337  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0890  exodeoxyribonuclease III Xth  31.78 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  35.5 
 
 		 269 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0541  exodeoxyribonuclease III  34.6 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.008532  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  33.21 
 
 		 267 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  34.08 
 
 		 264 aa  132  6e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0350  exodeoxyribonuclease III Xth  31.52 
 
 		 269 aa  131  9e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0362795  normal  0.625114 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1734  exodeoxyribonuclease III  31.01 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00350824  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0123  AP endonuclease  33.72 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  32.18 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0946  exodeoxyribonuclease III Xth  33.97 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.416202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0254  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.91 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0458  exodeoxyribonuclease III Xth  32.42 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>