More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0135 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0135  peptidase M22 glycoprotease  100 
 
 
230 aa  460  1e-129  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0096  protease, putative  47.27 
 
 
234 aa  184  7e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.125274  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2665  peptidase M22, glycoprotease  46.67 
 
 
226 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00483372  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0091  peptidase M22 glycoprotease  46.4 
 
 
223 aa  180  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0427385  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0123  peptidase M22 glycoprotease  44.5 
 
 
208 aa  178  7e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000799659  hitchhiker  0.00871269 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0101  peptidase M22 glycoprotease  42.41 
 
 
226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000448145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1986  protease, putative  42.53 
 
 
227 aa  149  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0910  glycoprotease  43.8 
 
 
233 aa  103  2e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004094  peptidase M22  41.84 
 
 
233 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1991  peptidase M22 glycoprotease  30.73 
 
 
233 aa  99  6e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.931611  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01375  hypothetical protein  40.88 
 
 
233 aa  98.6  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1868  metal-dependent protease-like protein  43.51 
 
 
238 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.01917  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2229  peptidase M22 glycoprotease  30.28 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0756732  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1496  glycoprotease family protein  30.39 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1964  glycoprotease family protein  30.39 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1311  glycoprotease family protein  30.39 
 
 
231 aa  96.7  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0611537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0412  peptidase M22, glycoprotease  42.31 
 
 
231 aa  96.3  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1257  peptidase M22 glycoprotease  45.45 
 
 
235 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.924937 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1960  putative M22 peptidase homolog YeaZ  29.9 
 
 
231 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2021  putative M22 peptidase-like protein YeaZ  29.9 
 
 
231 aa  94.7  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  0.532705 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0734  glycoprotease family protein  40.65 
 
 
238 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1381  glycoprotease family protein  30.88 
 
 
231 aa  94  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.132461  normal  0.678308 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2762  peptidase M22 glycoprotease  31.19 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00215046  hitchhiker  0.00129003 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01100  putative glycoprotease family exported protein  31.72 
 
 
222 aa  94.4  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0858  peptidase M22, glycoprotease  43.8 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1574  hypothetical protein  39.86 
 
 
237 aa  92.8  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.366703  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1725  glycoprotease  41.91 
 
 
229 aa  92.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.803312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1934  peptidase M22 glycoprotease  28.9 
 
 
233 aa  92  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.762827  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1836  peptidase M22 glycoprotease  29.9 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000028735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1826  peptidase M22 glycoprotease  29.9 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  0.397097 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2534  glycoprotease family protein  29.9 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.219727  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1895  glycoprotease family protein  29.9 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2033  glycoprotease family protein  29.9 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01777  predicted peptidase  29.9 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2123  peptidase M22, glycoprotease  39.26 
 
 
223 aa  90.5  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5085  peptidase M22 glycoprotease  41.8 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2193  peptidase M22, glycoprotease  39.34 
 
 
247 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00327839 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0400  peptidase M22 glycoprotease  35.71 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0240362 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01765  hypothetical protein  29.9 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.821026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2377  peptidase M22, glycoprotease  29.41 
 
 
231 aa  90.1  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2887  peptidase M22, glycoprotease  42.06 
 
 
235 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2067  glycoprotease family protein  29.41 
 
 
231 aa  89.4  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2016  family M22 nonpeptidase-like protein  31.55 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0164135  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2405  family M22 nonpeptidase-like protein  31.55 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000205018  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2127  peptidase M22 glycoprotease  31.55 
 
 
232 aa  89.4  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0099  M22 family peptidase  27.95 
 
 
225 aa  88.2  9e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00192145 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1896  hypothetical protein  37.3 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2012  peptidase M22 glycoprotease  28.9 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3092  peptidase M22 glycoprotease  39.84 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.492072 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1939  peptidase M22, glycoprotease  35.93 
 
 
282 aa  85.9  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.132529  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0447  glycoprotease family protein  37.59 
 
 
232 aa  85.5  7e-16  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.204444  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1859  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0347  peptidase M22 glycoprotease  38.17 
 
 
241 aa  85.1  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.425571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1886  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.174274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2433  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.774053  normal  0.20354 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1893  peptidase M22 glycoprotease  36.36 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1391  peptidase M22 glycoprotease  32.56 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000832703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0917  peptidase M22, glycoprotease  37.69 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1620  peptidase M22, glycoprotease  39.34 
 
 
234 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0183  peptidase M22 glycoprotease  40 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.128229  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0356  hypothetical protein  40.65 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0444593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2391  peptidase M22, glycoprotease  38.52 
 
 
236 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.949893 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1756  peptidase M22, glycoprotease  36.92 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.206802  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1084  peptidase M22 glycoprotease  37.5 
 
 
211 aa  83.2  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00473352  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1885  hypothetical protein  36.51 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01132  peptidase M22, glycoprotease  37.69 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2259  peptidase M22, glycoprotease  33.33 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1185  putative glycoprotease family protein  36.89 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2233  peptidase  35.88 
 
 
235 aa  82  0.000000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000143948  hitchhiker  0.00000268833 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1410  peptidase M22 glycoprotease  39.39 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3940  peptidase M22, glycoprotease  33.56 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3289  peptidase M22 glycoprotease  33.56 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2528  hypothetical protein  32.79 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.721153  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0927  peptidase M22 glycoprotease  40.68 
 
 
238 aa  81.6  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2182  peptidase M22, glycoprotease  37.7 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1458  non-proteolytic protein, peptidase family M22  38.52 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2015  peptidase M22, glycoprotease  40.77 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.186434  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1527  M22 peptidase homolog yeaZ  38.52 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0306852  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1306  peptidase M22 glycoprotease  34.39 
 
 
246 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0447372  normal  0.269549 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0379  metal-dependent protease-like protein, putative molecular chaperone  34.38 
 
 
241 aa  80.5  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.457617  hitchhiker  0.000000359774 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1673  peptidase M22, glycoprotease  35.16 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1367  putative transmembrane protein  35.09 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.742517  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0784  peptidase M22 glycoprotease  37.5 
 
 
229 aa  79.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.318216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2159  peptidase M22, glycoprotease  47.92 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287799 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3738  peptidase M22 glycoprotease  39.06 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1728  peptidase M22, glycoprotease  37.7 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0976  peptidase M22 glycoprotease  33.33 
 
 
283 aa  78.6  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2586  hypothetical protein  36.89 
 
 
236 aa  79  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01598  glycoprotease family protein  37.01 
 
 
239 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1268  peptidase M22, glycoprotease  36.89 
 
 
223 aa  78.2  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4459  peptidase M22, glycoprotease  35.71 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0293855  normal  0.853274 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2423  glycoprotease family protein  31.79 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2133  glycoprotease family protein  31.21 
 
 
234 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2453  peptidase M22 glycoprotease  34.65 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0944  peptidase M22 glycoprotease  29.44 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1240  peptidase M22 glycoprotease  31.56 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464937  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1098  peptidase M22 glycoprotease  37.69 
 
 
246 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2808  peptidase M22, glycoprotease  32.37 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1939  hypothetical protein  37.19 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.287611  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0872  hypothetical protein  36.72 
 
 
229 aa  77  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000381298  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>