More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0129 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0129  nitrogen regulatory protein P-II  100 
 
 
113 aa  224  3e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0837985  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0108  nitrogen regulatory protein P-II  83.19 
 
 
113 aa  192  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.834215 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0087  nitrogen regulatory protein P-II  76.11 
 
 
113 aa  183  6e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0095  nitrogen regulatory protein P-II  75.22 
 
 
113 aa  183  7e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0163432  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2671  nitrogen regulatory protein P-II  75.22 
 
 
113 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000399348  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1998  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  72.57 
 
 
113 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0090  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  73.45 
 
 
113 aa  176  1e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2055  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3819  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2709  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 
112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000195324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2044  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0437  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2783  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.190051  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2252  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0233324  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2877  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.58077  normal  0.596742 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2921  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0772673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2866  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
136 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00138557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0240  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  50 
 
 
112 aa  108  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1507  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 
112 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0256  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4190  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.959597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0525  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.887906  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1957  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  107  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1116  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  106  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0342  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  50 
 
 
112 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3119  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0302  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0815  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
136 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3161  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  105  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0791702  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1181  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3218  P-II family regulatory protein  49.12 
 
 
112 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0651  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.888486  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6195  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
136 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1400  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0487  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0407  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.32852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0193  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.431486  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2827  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.994537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3163  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  105  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105283  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0485  nitrogen regulatory protein P-II  52.63 
 
 
112 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.65619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0468  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.409463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03567  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
114 aa  104  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.918332  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0291  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0110  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0179377 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3366  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  104  5e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0173  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000293377  normal  0.353092 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0217  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  103  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000368327 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0198  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  103  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.485304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0080  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  103  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.416357  normal  0.780104 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0472  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  103  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0782781  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0195  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  103  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.863029 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1291  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  103  8e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.230659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0120  nitrogen regulatory protein P-II  50 
 
 
112 aa  102  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0723912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0694  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.804518  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1499  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.12 
 
 
112 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0232  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0312248  normal  0.530475 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0433  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0037358  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2560  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24557  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2156  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0805697  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2478  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  102  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  0.572942 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3159  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0683  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.173796  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0523  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  101  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.278087  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2590  nitrogen regulatory protein P-II  50.88 
 
 
112 aa  101  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0641  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.252116  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3314  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  101  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.258343  normal  0.0812118 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1861  nitrogen regulatory protein P-II  46.79 
 
 
112 aa  101  3e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.751643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5499  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.118454 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2137  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  101  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.573897  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3942  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  100  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2050  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  101  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.885894  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0472  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2513  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  101  4e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00284343  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3770  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
116 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.929056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0779  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0451  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.164177  normal  0.269933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4094  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
116 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.52607  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0808  nitrogen regulatory protein P-II  51.75 
 
 
112 aa  101  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3026  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 
112 aa  100  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.522952  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0935  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  100  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0360863  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0171  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.138781  normal  0.605066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1885  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  46.49 
 
 
112 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.614675  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0115  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
116 aa  100  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0778651  normal  0.359579 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2346  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  49.12 
 
 
112 aa  100  6e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.235899 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2733  nitrogen regulatory protein P-II  48.62 
 
 
112 aa  100  7e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.122931 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2345  nitrogen regulatory P-II transcription regulator protein  46.49 
 
 
112 aa  100  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.782832  normal  0.263317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0295  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  100  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.886213  normal  0.678271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0234  nitrogen regulatory protein P-II  43.86 
 
 
112 aa  100  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000834653  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0269  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.74 
 
 
112 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76816  normal  0.184312 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0218  nitrogen regulatory protein P-II  48.25 
 
 
112 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.601689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1818  nitrogen regulatory protein P-II  48.15 
 
 
112 aa  100  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900474  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2374  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  100  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.35771 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0183  nitrogen regulatory protein P-II  47.37 
 
 
112 aa  100  9e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320277  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2098  nitrogen regulatory protein P-II  45.61 
 
 
112 aa  100  9e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.221402  hitchhiker  0.00315077 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2043  nitrogen regulatory protein P-II  49.12 
 
 
112 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.242523  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5933  nitrogen regulatory protein P-II  42.11 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0371  nitrogen regulatory protein P-II (GlnB, GlnK)  44.74 
 
 
112 aa  99.4  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7999  nitrogen regulatory protein P-II  44.74 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4445  nitrogen regulatory protein P-II, GlnB, GlnK  46.49 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3656  nitrogen regulatory protein P-II  46.49 
 
 
112 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>