More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0114 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1750  asparagine synthetase  56.02 
 
 
595 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0957205  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0114  asparagine synthase family amidotransferase  100 
 
 
592 aa  1232    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5099  asparagine synthase family amidotransferase  54.81 
 
 
594 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0816  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  59.97 
 
 
590 aa  745    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.816546  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1633  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  55.14 
 
 
590 aa  671    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3964  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.02 
 
 
595 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.414023  normal  0.0298068 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2962  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.38 
 
 
600 aa  724    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.471232  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3398  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.67 
 
 
594 aa  702    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.108074  normal  0.978255 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3642  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.52 
 
 
591 aa  721    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4868  asparagine synthase amidotransferase  57.6 
 
 
589 aa  707    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.307974  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3747  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  55.65 
 
 
590 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0137323 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2955  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.74 
 
 
589 aa  662    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0385583 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5018  asparagine synthase family amidotransferase  60.03 
 
 
593 aa  734    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.197798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5353  asparagine synthase family amidotransferase  57.77 
 
 
589 aa  710    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0060  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  54.5 
 
 
588 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.157876  normal  0.58042 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2276  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.39 
 
 
601 aa  722    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.315443  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3188  asparagine synthase amidotransferase  57.77 
 
 
589 aa  705    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227192  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4100  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  56.49 
 
 
590 aa  693    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.806427 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4066  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.72 
 
 
601 aa  721    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0860  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.34 
 
 
594 aa  697    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0424562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3531  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.82 
 
 
596 aa  701    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0213452  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5410  asparagine synthase family amidotransferase  56.76 
 
 
589 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.360924  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34960  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.78 
 
 
589 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2101  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.56 
 
 
601 aa  717    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.994358  normal  0.105785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1989  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  57.67 
 
 
591 aa  700    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2293  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  57.67 
 
 
593 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00195658  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2910  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  58.38 
 
 
594 aa  689    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0917  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.01 
 
 
594 aa  702    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.228251 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.69 
 
 
590 aa  687    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0142  asparagine synthase family amidotransferase  62.16 
 
 
590 aa  777    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0588532  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3652  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  53.79 
 
 
595 aa  643    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2038  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  58.56 
 
 
601 aa  717    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0408411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2461  Asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  55.33 
 
 
593 aa  684    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  56.54 
 
 
599 aa  683    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3771  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  57.31 
 
 
598 aa  688    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.452374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2055  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  58.56 
 
 
601 aa  717    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.559869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  60.37 
 
 
591 aa  746    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19370  putative asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  58.11 
 
 
589 aa  675    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.826487  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1342  asparagine synthase amidotransferase  56.02 
 
 
595 aa  666    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371916  normal  0.923546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1300  asparagine synthase amidotransferase  56.69 
 
 
595 aa  668    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1668  asparagine synthase  57.94 
 
 
589 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.169203  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0216  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  56.47 
 
 
598 aa  677    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2680  asparagine synthase amidotransferase  61.66 
 
 
590 aa  775    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0122276  normal  0.763005 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7206  putative asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  53.44 
 
 
569 aa  633  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4494  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.61 
 
 
610 aa  623  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.210127  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2541  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  53.31 
 
 
621 aa  620  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.800468  normal  0.489677 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2728  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  52.63 
 
 
593 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.889293  normal  0.206697 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0595  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  50.83 
 
 
602 aa  606  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.957745  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0742  asparagine synthase family amidotransferase  50.42 
 
 
592 aa  590  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1756  asparagine synthase family amidotransferase  50.84 
 
 
594 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3584  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.41 
 
 
628 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3710  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.23 
 
 
633 aa  310  4e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0641496  normal  0.029694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0671  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.65 
 
 
619 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.403127  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0346  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.52 
 
 
610 aa  308  2.0000000000000002e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0058  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  32.18 
 
 
629 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2055  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.64 
 
 
646 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2095  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.97 
 
 
633 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000747097  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2035  asparagine synthase  32.97 
 
 
633 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000174005  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2033  asparagine synthase  32.97 
 
 
633 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000200713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2251  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.97 
 
 
633 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000160892  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2233  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.97 
 
 
633 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000376097  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2361  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.97 
 
 
633 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000107333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2276  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.97 
 
 
633 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.55004e-60 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1580  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.95 
 
 
634 aa  302  1e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1194  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.44 
 
 
634 aa  302  1e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3091  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  32.97 
 
 
633 aa  301  2e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000126358  unclonable  6.2854299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1119  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing  31.11 
 
 
632 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.39 
 
 
633 aa  300  4e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000197095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6500  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.28 
 
 
638 aa  300  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2280  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.39 
 
 
605 aa  298  2e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000628708  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01303  Asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.66 
 
 
632 aa  298  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0896  asparagine synthetase [glutamine-hydrolyzing]  30.79 
 
 
632 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2408  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.31 
 
 
635 aa  297  4e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.65 
 
 
633 aa  297  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000133092  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2515  exosortase 1 system-associated amidotransferase 1  32.51 
 
 
643 aa  291  2e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0685531 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3874  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.91 
 
 
632 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0230  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.17 
 
 
658 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0292  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.82 
 
 
639 aa  291  3e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.216365  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4592  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.4 
 
 
645 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.65001  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.75 
 
 
627 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3751  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.33 
 
 
655 aa  289  8e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0335883 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1975  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.15 
 
 
643 aa  288  1e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0254  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.64 
 
 
622 aa  288  1e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  34.79 
 
 
592 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0669  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.05 
 
 
641 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4039  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.23 
 
 
633 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.354675  normal  0.528504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1389  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.27 
 
 
625 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1512  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.16 
 
 
637 aa  287  5e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386079  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0905  asparagine synthetase family protein  29.69 
 
 
637 aa  286  5.999999999999999e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0241  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.05 
 
 
654 aa  286  7e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.148011 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1053  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.74 
 
 
649 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000122454  hitchhiker  0.00273706 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1110  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.38 
 
 
637 aa  285  1.0000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1778  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.05 
 
 
629 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1919  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.23 
 
 
631 aa  284  3.0000000000000004e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.49 
 
 
635 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0959  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.77 
 
 
635 aa  281  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0665  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  29.37 
 
 
623 aa  280  6e-74  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0824019  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2339  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.8 
 
 
639 aa  280  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.795917  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2469  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.2 
 
 
629 aa  279  9e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2776  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.63 
 
 
632 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000288023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>