More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0104 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0834  alpha amylase catalytic region  65.69 
 
 		 650 aa  899    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0104  alpha amylase catalytic region  100 
 
 		 653 aa  1351    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1887  alpha amylase catalytic region  66.1 
 
 		 659 aa  900    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0951  alpha amylase, catalytic region  65.89 
 
 		 655 aa  892    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2636  alpha-amylase family protein  51.38 
 
 		 617 aa  621  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0833  Alpha amylase, catalytic region  49.46 
 
 		 617 aa  597  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72167 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1743  alpha amylase, catalytic region  46.91 
 
 		 619 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5240  alpha amylase catalytic region  35.37 
 
 		 624 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3915  alpha amylase catalytic region  35.4 
 
 		 662 aa  297  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0962846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3722  alpha amylase, catalytic region  34.55 
 
 		 646 aa  289  1e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146408 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0959  a-glucosidase  29.61 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.766487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1890  alpha amylase, catalytic region  28.39 
 
 		 609 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0183  alpha amylase, catalytic region  28.67 
 
 		 600 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4090  alpha amylase catalytic region  27.04 
 
 		 614 aa  157  9e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.904888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2739  alpha amylase, catalytic region  28.62 
 
 		 622 aa  156  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  26.59 
 
 		 1017 aa  155  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  25.91 
 
 		 1005 aa  154  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.66 
 
 		 1891 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0817  alpha amylase, catalytic region  25.86 
 
 		 599 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0197  alpha amylase, catalytic region  27.53 
 
 		 925 aa  146  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1375  alpha amylase, catalytic region  25.97 
 
 		 593 aa  143  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  26.87 
 
 		 1942 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.63 
 
 		 2068 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.65 
 
 		 1855 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.44 
 
 		 1975 aa  137  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0985  putative alpha amylase  25.58 
 
 		 604 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001132  glycosyl hydrolase family 13  25.98 
 
 		 885 aa  133  9e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1683  alpha amylase catalytic region  25.32 
 
 		 836 aa  131  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.332102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1428  alpha amylase catalytic region  25.71 
 
 		 838 aa  127  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.0000263704  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0700  alpha amylase catalytic region  25.96 
 
 		 767 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1502  alpha amylase  26.57 
 
 		 610 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.855853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1746  alpha amylase, catalytic region  37.98 
 
 		 1021 aa  115  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0173524 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1481  alpha amylase catalytic region  25.77 
 
 		 723 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.653482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1180  alpha amylase, catalytic region  25.11 
 
 		 526 aa  110  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000265218  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1317  alpha amylase, catalytic domain protein  26.26 
 
 		 620 aa  107  6e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0953  alpha amylase, catalytic region  23.25 
 
 		 814 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0761659  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0698  alpha amylase catalytic region  35.81 
 
 		 510 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1514  alpha amylase catalytic region  35.81 
 
 		 511 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2667  alpha amylase catalytic region  26.47 
 
 		 853 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.749886 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4068  periplasmic alpha-amylase precursor  27.54 
 
 		 676 aa  98.2  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0660  alpha amylase, catalytic region  36.55 
 
 		 484 aa  96.7  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5853  alpha amylase catalytic region  25.92 
 
 		 742 aa  96.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0389202  normal  0.176008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16160  alpha amylase catalytic region  21.76 
 
 		 582 aa  96.3  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.135656  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0440  maltodextrin glucosidase  24.56 
 
 		 605 aa  95.5  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0446  maltodextrin glucosidase  24.28 
 
 		 605 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4947  periplasmic alpha-amylase precursor  27.25 
 
 		 676 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.876495  normal  0.214816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3878  periplasmic alpha-amylase precursor  26.61 
 
 		 675 aa  95.1  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4048  periplasmic alpha-amylase precursor  26.89 
 
 		 675 aa  95.5  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.555384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2579  alpha amylase catalytic region  23.6 
 
 		 576 aa  94.4  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000456037  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0501  maltodextrin glucosidase  24.28 
 
 		 605 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.524518  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03423  periplasmic alpha-amylase precursor  26.67 
 
 		 676 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0139  alpha amylase catalytic region  26.67 
 
 		 676 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3774  periplasmic alpha-amylase precursor  26.67 
 
 		 676 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03374  hypothetical protein  26.67 
 
 		 676 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0143  periplasmic alpha-amylase precursor  26.67 
 
 		 676 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3894  periplasmic alpha-amylase precursor  27.83 
 
 		 676 aa  93.6  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3951  periplasmic alpha-amylase precursor  26.96 
 
 		 676 aa  92.8  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 878 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  34.68 
 
 		 2638 aa  92.8  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1454  alpha amylase, catalytic region  22.43 
 
 		 739 aa  92.8  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.137251  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0150  periplasmic alpha-amylase precursor  28.07 
 
 		 676 aa  92.8  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0459  maltodextrin glucosidase  24.18 
 
 		 605 aa  92  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  25.17 
 
 		 878 aa  91.7  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2289  alpha amylase, catalytic region  21.54 
 
 		 765 aa  91.7  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3987  periplasmic alpha-amylase precursor  26.49 
 
 		 675 aa  91.3  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3862  periplasmic alpha-amylase precursor  26.49 
 
 		 675 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3942  periplasmic alpha-amylase precursor  26.49 
 
 		 675 aa  91.3  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.973795 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2969  alpha amylase catalytic region  35.33 
 
 		 524 aa  90.5  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0795  alpha amylase, catalytic region  33.75 
 
 		 575 aa  90.5  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  23.54 
 
 		 499 aa  90.1  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001107  periplasmic alpha-amylase  26.02 
 
 		 686 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0600503  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  24.48 
 
 		 1307 aa  89.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2083  alpha amylase catalytic region  23.43 
 
 		 778 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4138  periplasmic alpha-amylase precursor  27.2 
 
 		 687 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0054  periplasmic alpha-amylase precursor  25.39 
 
 		 688 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002001  periplasmic alpha-amylase  27.49 
 
 		 694 aa  89  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2302  alpha amylase catalytic region  23.28 
 
 		 786 aa  89  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.073428 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1187  alpha amylase, catalytic region  34.13 
 
 		 574 aa  88.2  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.649745  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0794  alpha amylase catalytic region  31.79 
 
 		 562 aa  87.8  5e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3271  maltodextrin glucosidase  23.05 
 
 		 609 aa  87.8  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3133  periplasmic alpha-amylase precursor  29.3 
 
 		 687 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.21513  normal  0.0265446 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03307  alpha-1,3 glucan synthases (Eurofung)  25.44 
 
 		 2444 aa  87.4  7e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3131  maltodextrin glucosidase  23.05 
 
 		 609 aa  87.4  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1398  alpha amylase, catalytic region  26.11 
 
 		 553 aa  87.4  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0948  alpha amylase domain-containing protein  33.73 
 
 		 752 aa  87  8e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.216997  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4269  alpha amylase catalytic region  35.54 
 
 		 528 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4622  alpha amylase catalytic region  23.16 
 
 		 649 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00204986 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0871  maltodextrin glucosidase  24.13 
 
 		 605 aa  87  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4065  alpha-amylase  27.75 
 
 		 586 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00857502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3755  neopullulanase  31.87 
 
 		 586 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000420185  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2036  cyclomaltodextrinase  33.33 
 
 		 774 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.47115  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0573  alpha-amylase G-6 precursor  33.76 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.11522 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0729  amylopullulanase  23.19 
 
 		 600 aa  86.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00401162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  42.68 
 
 		 815 aa  86.3  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0016  periplasmic alpha-amylase precursor  30.99 
 
 		 687 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.24938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4291  alpha amylase catalytic region  34.94 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.57141  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2031  alpha amylase, catalytic region  35.48 
 
 		 641 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3790  periplasmic alpha-amylase precursor  30.99 
 
 		 687 aa  85.5  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3073  alpha amylase catalytic region  34.27 
 
 		 477 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  25.31 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>