More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0092 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0092  methionine-R-sulfoxide reductase  100 
 
 
150 aa  312  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  85.71 
 
 
180 aa  263  4e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0065  methionine-R-sulfoxide reductase  84.29 
 
 
177 aa  259  8e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1104  methionine-R-sulfoxide reductase  73.29 
 
 
506 aa  249  8.000000000000001e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000471642  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0090  methionine-R-sulfoxide reductase  72.6 
 
 
190 aa  233  7e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.645705  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6049  methionine-R-sulfoxide reductase  65.07 
 
 
171 aa  209  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0487159  normal  0.218402 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0270  methionine-R-sulfoxide reductase  64.29 
 
 
184 aa  201  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.301923  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7118  methionine-R-sulfoxide reductase  64.03 
 
 
171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0822  methionine-R-sulfoxide reductase  63.16 
 
 
154 aa  191  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000300416  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0083  methionine-R-sulfoxide reductase  56.74 
 
 
189 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2689  methionine-R-sulfoxide reductase  57.14 
 
 
142 aa  154  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0660  protein-methionine-S-oxide reductase  55.2 
 
 
138 aa  154  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.7252  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0845  methionine-R-sulfoxide reductase  54.26 
 
 
139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.686886  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1105  methionine sulfoxide reductase B  54.03 
 
 
132 aa  150  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00407533  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0743  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 
142 aa  149  8.999999999999999e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0998  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 
137 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0872  methionine sulfoxide reductase B  51.56 
 
 
137 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69535  normal  0.693986 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0423  methionine sulfoxide reductase B  49.61 
 
 
133 aa  147  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.249651  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0606  methionine-R-sulfoxide reductase  54.2 
 
 
163 aa  147  5e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.875626 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2571  methionine-R-sulfoxide reductase  54.47 
 
 
183 aa  147  5e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2110  protein-methionine-S-oxide reductase  52.34 
 
 
136 aa  147  7e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0327209  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1007  methionine-R-sulfoxide reductase  50.78 
 
 
147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2816  methionine-R-sulfoxide reductase  53.97 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.10011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1889  methionine sulfoxide reductase B  52.34 
 
 
132 aa  145  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2840  methionine-R-sulfoxide reductase  48.61 
 
 
151 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.795882 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2336  methionine-R-sulfoxide reductase  51.24 
 
 
134 aa  144  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4176  methionine-R-sulfoxide reductase  51.54 
 
 
142 aa  144  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000115767  normal  0.515653 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1841  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 
141 aa  144  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2643  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 
137 aa  144  5e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.427446  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0293  methionine-R-sulfoxide reductase  54.47 
 
 
133 aa  144  5e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2190  methionine sulfoxide reductase B  49.23 
 
 
140 aa  143  6e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.443162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3328  protein-methionine-S-oxide reductase  53.49 
 
 
135 aa  143  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2658  methionine-R-sulfoxide reductase  52.31 
 
 
133 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.173178  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03241  putative methionine sulfoxide reductase family protein  50 
 
 
144 aa  143  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0013  protein-methionine-S-oxide reductase  51.18 
 
 
130 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2728  protein-methionine-S-oxide reductase  49.61 
 
 
135 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3026  methionine-R-sulfoxide reductase  45.8 
 
 
133 aa  141  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2786  protein-methionine-S-oxide reductase  50.79 
 
 
134 aa  142  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1027  methionine sulfoxide reductase B  55 
 
 
161 aa  141  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12453  SelR-like methionine sulfoxide reductase  49.21 
 
 
131 aa  141  4e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.575895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4217  methionine sulfoxide reductase B  47.33 
 
 
148 aa  140  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.117492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1128  methionine sulfoxide reductase B  52.27 
 
 
137 aa  140  6e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3833  methionine sulfoxide reductase B  51.15 
 
 
137 aa  140  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.459209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1981  methionine-R-sulfoxide reductase  52.14 
 
 
185 aa  140  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1801  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 
137 aa  139  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1643  methionine-R-sulfoxide reductase  49.23 
 
 
146 aa  139  9.999999999999999e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.240011  normal  0.30587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1865  methionine sulfoxide reductase B  50.81 
 
 
135 aa  139  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.301836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1923  methionine sulfoxide reductase B  46.72 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0450634  normal  0.625743 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0863  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
136 aa  139  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.121954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1426  methionine-R-sulfoxide reductase  48.06 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.118161  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2582  protein-methionine-S-oxide reductase  49.24 
 
 
136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0557038 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2277  methionine sulfoxide reductase B  48.46 
 
 
140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.167687 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0248  methionine-R-sulfoxide reductase  54.7 
 
 
180 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000151138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0263  methionine-R-sulfoxide reductase  54.7 
 
 
180 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1894  methionine-R-sulfoxide reductase  49.64 
 
 
140 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.320729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1747  methionine sulfoxide reductase B  48.39 
 
 
128 aa  137  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0864529  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0697  methionine-R-sulfoxide reductase  49.19 
 
 
135 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1457  methionine sulfoxide reductase B  50.83 
 
 
128 aa  137  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00518905  hitchhiker  0.000051953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2777  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 
140 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1498  methionine sulfoxide reductase B  50.83 
 
 
128 aa  136  7.999999999999999e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.0060677  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1482  methionine sulfoxide reductase B  48.09 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3669  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
133 aa  136  7.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.947591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1395  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
136 aa  136  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15440  methionine sulfoxide reductase B  48.85 
 
 
133 aa  135  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.141406  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2257  methionine sulfoxide reductase B  48.74 
 
 
133 aa  136  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.619242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1499  methionine-R-sulfoxide reductase  50.39 
 
 
159 aa  135  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01256  methionine sulfoxide reductase B  48.41 
 
 
142 aa  136  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.779389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1835  methionine-R-sulfoxide reductase  47.73 
 
 
136 aa  135  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.462521 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1780  PilB-related protein  52.99 
 
 
131 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4073  methionine-R-sulfoxide reductase  47.24 
 
 
177 aa  135  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000057525  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2319  methionine-R-sulfoxide reductase  52.42 
 
 
131 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.69896  normal  0.111888 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1317  methionine-R-sulfoxide reductase  48.82 
 
 
134 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.145812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2627  methionine-R-sulfoxide reductase  50 
 
 
136 aa  135  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.277502  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2268  protein-methionine-S-oxide reductase  49.62 
 
 
139 aa  135  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000330807  hitchhiker  0.00194582 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1612  methionine-R-sulfoxide reductase  48 
 
 
130 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0472443  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3073  methionine-R-sulfoxide reductase  48.76 
 
 
155 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.833991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1286  methionine sulfoxide reductase B  48.36 
 
 
141 aa  135  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1638  methionine-R-sulfoxide reductase  46.4 
 
 
127 aa  135  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33670  methionine-R-sulfoxide reductase  54.1 
 
 
131 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.263102  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2960  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.165913  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2936  methionine-R-sulfoxide reductase  48.48 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.509394  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1518  methionine sulfoxide reductase B  50.38 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2824  methionine-R-sulfoxide reductase  52.71 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00783664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2451  PilB-related protein  50 
 
 
137 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3916  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 
136 aa  134  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158974  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1459  methionine sulfoxide reductase B  49.62 
 
 
137 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1895  methionine-R-sulfoxide reductase  51.15 
 
 
146 aa  134  5e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1796  methionine sulfoxide reductase B  50.39 
 
 
164 aa  134  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12689  hypothetical protein  51.18 
 
 
136 aa  134  5e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.09651e-60  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2216  protein-methionine-S-oxide reductase  51.18 
 
 
136 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2262  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 
136 aa  134  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.42981  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2948  methionine-R-sulfoxide reductase  48.12 
 
 
137 aa  134  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4603  methionine sulfoxide reductase B  50 
 
 
138 aa  133  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2205  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 
136 aa  133  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.346022  normal  0.461417 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1595  methionine-R-sulfoxide reductase  46.92 
 
 
134 aa  133  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.470278  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2487  methionine-R-sulfoxide reductase  51.18 
 
 
136 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.323665 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0972  methionine-R-sulfoxide reductase  48.82 
 
 
134 aa  133  8e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5464  methionine-R-sulfoxide reductase  50.41 
 
 
135 aa  133  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2267  methionine-R-sulfoxide reductase  52.38 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0348  methionine-R-sulfoxide reductase  51.56 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>