60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0090 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0090  DNA alkylation repair enzyme  100 
 
 		 234 aa  474  1e-133  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0516  DNA alkylation repair enzyme  70.35 
 
 		 243 aa  328  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1337  hypothetical protein  50.88 
 
 		 232 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0135727  normal  0.552323 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1710  DNA alkylation repair enzyme  50 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01880  DNA alkylation repair enzyme  50.66 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1499  DNA alkylation repair enzyme  52.81 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.812677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3031  DNA alkylation repair enzyme  51.07 
 
 		 236 aa  232  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.479506  normal  0.0579972 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0108  hypothetical protein  51.97 
 
 		 247 aa  231  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.189458  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0285  hypothetical protein  49.33 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0704533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1009  hypothetical protein  53.25 
 
 		 257 aa  228  7e-59  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1822  DNA alkylation repair enzyme  53.98 
 
 		 236 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0011898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4757  DNA alkylation repair enzyme  46.96 
 
 		 234 aa  219  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.725796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0250  DNA alkylation repair enzyme  48.03 
 
 		 235 aa  213  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1248  hypothetical protein  46.67 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2110  DNA alkylation repair enzyme  41.23 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113394  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2880  DNA alkylation repair enzyme  43.54 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000948071 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3784  DNA alkylation repair enzyme  44.39 
 
 		 243 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00121379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2046  glucose/ribitol dehydrogenase  40.35 
 
 		 550 aa  169  4e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.164018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1843  DNA alkylation repair enzyme  40.52 
 
 		 238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.456011 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2401  DNA alkylation repair enzyme  37.61 
 
 		 239 aa  159  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0298  hypothetical protein  30.71 
 
 		 263 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1684  DNA alkylation repair enzyme  29.05 
 
 		 236 aa  87.8  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.128505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0012  hypothetical protein  28.69 
 
 		 241 aa  85.9  5e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1562  hypothetical protein  27.78 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0968542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0896  hypothetical protein  29.91 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.241372  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1238  DNA alkylation repair enzyme  26.09 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4207  hypothetical protein  29.65 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.11764  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0300  hypothetical protein  30.67 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0849732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3708  hypothetical protein  24.17 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0997692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1291  DNA alkylation repair enzyme  26.34 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.454392  normal  0.402353 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2256  hypothetical protein  28.65 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37928  normal  0.0533483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2183  DNA alkylation repair enzyme  25.11 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000603371 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2433  hypothetical protein  27.57 
 
 		 228 aa  57  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.259218  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0726  hypothetical protein  27.27 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2742  DNA-7-methylguanine glycosylase  27.62 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3188  hypothetical protein  22.92 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1083  DNA alkylation repair enzyme  24.55 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4783  hypothetical protein  27.09 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4623  hypothetical protein  27.09 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5145  hypothetical protein  27.09 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5024  hypothetical protein  27.09 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0189  hypothetical protein  27.32 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5052  hypothetical protein  26.6 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6016  DNA alkylation repair enzyme  25.98 
 
 		 261 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.173171  normal  0.636824 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5045  hypothetical protein  27.32 
 
 		 237 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4735  DNA alkylation repair enzyme  27.59 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2073  hypothetical protein  29.94 
 
 		 227 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4645  hypothetical protein  25.98 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5419  hypothetical protein  26.74 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5709  hypothetical protein  25.58 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5330  hypothetical protein  26.74 
 
 		 231 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3013  DNA-7-methylguanine glycosylase  29.12 
 
 		 231 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5057  hypothetical protein  25.62 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2310  hypothetical protein  30.23 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.854868 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1455  hypothetical protein  27.69 
 
 		 224 aa  42.4  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000773968  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4018  DNA alkylation repair enzyme  26.67 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.195765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2054  DNA alkylation repair enzyme  28.17 
 
 		 227 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126826  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1790  DNA alkylation repair enzyme  24.76 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.274753  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2664  hypothetical protein  25 
 
 		 229 aa  42  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1596  hypothetical protein  34.74 
 
 		 232 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.186177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>