50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0074 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0074  transposase  100 
 
 
157 aa  324  3e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  84.62 
 
 
158 aa  271  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  75.8 
 
 
157 aa  249  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  73.89 
 
 
157 aa  246  9e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  71.97 
 
 
157 aa  233  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  75.36 
 
 
144 aa  217  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  54.14 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  54.14 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  54.14 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  54.14 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  52.87 
 
 
157 aa  170  7.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  51.59 
 
 
157 aa  165  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  65.98 
 
 
97 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  42.55 
 
 
159 aa  103  7e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  38.41 
 
 
375 aa  94.4  6e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  40 
 
 
178 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  35.1 
 
 
390 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  34.46 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  30.57 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4435  transposase  32.9 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.593485  normal  0.0613632 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  35.81 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  39.37 
 
 
125 aa  72  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4542  putative transposase  28.29 
 
 
363 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  29.92 
 
 
362 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5437  tISRso5; ISRSO5-transposase protein  28.48 
 
 
300 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218978  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2127  putative transposase  30.67 
 
 
224 aa  47.4  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5423  putative transposase  27.48 
 
 
366 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.365485  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8357  putative transposase  31.03 
 
 
356 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  27.03 
 
 
363 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  27.03 
 
 
363 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2210  putative transposase  27.03 
 
 
363 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  27.03 
 
 
363 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  27.03 
 
 
363 aa  45.1  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5589  putative transposase  31.03 
 
 
373 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28040  transposase  39.39 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  23.29 
 
 
364 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4122  hypothetical protein  26.4 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2845  hypothetical protein  26.4 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2021  hypothetical protein  26.4 
 
 
356 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.170943  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  27.7 
 
 
346 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  30.4 
 
 
361 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  30.4 
 
 
361 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>