160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0073 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0073  transposase  100 
 
 
186 aa  387  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.748359  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1251  transposase  69.8 
 
 
205 aa  287  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2626  transposase  73.22 
 
 
186 aa  268  2.9999999999999997e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1466  transposase  62.75 
 
 
207 aa  259  2e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4724  transposase  56.1 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2901  transposase  56.1 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0114353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2997  transposase  56.1 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.894838  normal  0.434807 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4008  transposase  56.1 
 
 
220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.227773  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4505  transposase  55.61 
 
 
220 aa  231  5e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0540  transposase  62.5 
 
 
187 aa  230  1e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  48.08 
 
 
390 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0967  transposase  44.55 
 
 
207 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.805263  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1560  transposase  46.6 
 
 
206 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0744528 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  45.15 
 
 
375 aa  167  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1324  hypothetical protein  42.93 
 
 
205 aa  167  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527658  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0631  hypothetical protein  40.59 
 
 
215 aa  143  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.290369 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0065  transposase  76.14 
 
 
90 aa  143  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2163  transposase  65.69 
 
 
105 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281917  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0773  transposase  36.89 
 
 
223 aa  123  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000122901 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1010  transposase  45.45 
 
 
146 aa  105  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2698  transposase  37.04 
 
 
172 aa  99  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573228 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2350  transposase  70.15 
 
 
67 aa  99  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00203316  normal  0.0195655 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0064  transposase  70.49 
 
 
105 aa  95.1  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2934  putative transposase  31.69 
 
 
171 aa  83.2  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0135  hypothetical protein  29.63 
 
 
377 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2513  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  0.0151608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2472  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013667 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1423  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1902  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.261334 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1859  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.635935  normal  0.851625 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1852  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.824218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2211  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0121228  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2531  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0152196  normal  0.0642139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3926  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203857  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1043  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0147  hypothetical protein  30.69 
 
 
377 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4571  putative transposase  26.19 
 
 
362 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3576  putative transposase  26.19 
 
 
362 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.552369  hitchhiker  0.000751962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1649  putative transposase  26.19 
 
 
362 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0971909  normal  0.0360838 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2285  putative transposase  26.19 
 
 
362 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.347979  normal  0.0281996 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3107  putative transposase  26.19 
 
 
362 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0260258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3178  putative transposase  26.19 
 
 
362 aa  61.2  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2745  putative transposase  26.86 
 
 
376 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.586964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0804  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  57.8  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3532  ISMsm5, transposase  29.11 
 
 
370 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0556834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1349  putative transposase  27.13 
 
 
364 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2887  putative transposase  26.6 
 
 
391 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1754  putative transposase  27.5 
 
 
361 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.382325  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1863  putative transposase  27.5 
 
 
361 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.560784  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2957  putative transposase  26.32 
 
 
362 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4461  putative transposase  26.32 
 
 
362 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7094  putative transposase  26.32 
 
 
362 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2758  putative transposase  26.32 
 
 
389 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.90669 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4599  putative transposase  26.44 
 
 
354 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4130  putative transposase  25.86 
 
 
356 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2794  feruloyl esterase  22.69 
 
 
374 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1050  transposase  41.67 
 
 
62 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2536  putative transposase  25.14 
 
 
366 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000586897  hitchhiker  0.000186966 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2587  putative transposase  25.15 
 
 
355 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.214458  normal  0.439073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2061  IS630 family transposase  23.04 
 
 
365 aa  52  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.289614  normal  0.0326995 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1872  IS630 family transposase  23.04 
 
 
376 aa  52  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.226445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3516  putative transposase  26.88 
 
 
356 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5661  transposase  29.49 
 
 
361 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.452686  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4241  transposase  29.49 
 
 
361 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.558775  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5727  transposase  29.49 
 
 
361 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.250795  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4241  putative transposase  25.29 
 
 
356 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0412  ISBmu8 transposase  28.37 
 
 
379 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0822678  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2326  putative transposase  23.24 
 
 
351 aa  50.4  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.629332  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4685  putative transposase  27.59 
 
 
365 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133454  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2258  Integrase catalytic region  24.21 
 
 
363 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4423  putative transposase  26.19 
 
 
363 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0109632 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4284  ISRSO5-transposase protein  26.9 
 
 
357 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.54842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1307  ISRSO5-transposase protein  26.9 
 
 
357 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4695  ISRSO5-transposase protein  26.9 
 
 
357 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5839  putative transposase  24.52 
 
 
363 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4635  putative transposase  24.52 
 
 
363 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.698522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4380  ISRSO5-transposase protein  26.9 
 
 
357 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2329  hypothetical protein  22.28 
 
 
353 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0623  ISRSO5-transposase protein  26.9 
 
 
357 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0178  ISRSO5-transposase protein  26.44 
 
 
360 aa  48.9  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36604  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2484  putative transposase  22.47 
 
 
194 aa  48.9  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.350833  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2039  putative transposase  25.12 
 
 
346 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0404689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3763  putative transposase  26.92 
 
 
362 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.397768  normal 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6392  putative transposase  29.19 
 
 
359 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4459  transposase, putative  27.08 
 
 
365 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1849  putative transposase  24.49 
 
 
363 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.739545  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2921  putative transposase  24.49 
 
 
363 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0648  transposase protein  25.11 
 
 
365 aa  47.4  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4767  putative transposase  24.49 
 
 
363 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177268  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2393  putative transposase  25.61 
 
 
363 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0909  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1062  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118362  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1379  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.618828  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1380  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.760309  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1751  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.353562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1752  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1874  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.582444  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1924  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0504848  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2613  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.026519  normal  0.14211 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2865  integrase catalytic subunit  26.47 
 
 
359 aa  47  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>