29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0063 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0063  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1467  transposase  81.44 
 
 
157 aa  158  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1252  transposase  79.38 
 
 
157 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295844 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0539  transposase  76.29 
 
 
157 aa  150  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1478  transposase  84.42 
 
 
144 aa  141  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2625  transposase  66.32 
 
 
158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0074  transposase  65.98 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.509194  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25480  transposase  54.17 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13600  transposase  54.17 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13510  transposase  54.17 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16510  transposase  54.17 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20700  transposase  54.17 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24580  transposase  54.17 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30780  transposase  54.17 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41580  transposase  54.17 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4009  transposase  52.08 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.275389  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2996  transposase  52.08 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.277448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2900  transposase  52.08 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.020589 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4725  transposase  52.08 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49710  transposase  54.17 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4506  transposase  51.04 
 
 
157 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0966  transposase  44.59 
 
 
159 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.281851  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3846  transposase  42.67 
 
 
375 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.567851  normal  0.231894 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0630  hypothetical protein  55.81 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.288835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1402  putative transposase  40 
 
 
390 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.184184 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0774  transposase  33.33 
 
 
163 aa  45.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2935  hypothetical protein  41.27 
 
 
178 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1012  transposase  33.72 
 
 
143 aa  43.9  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4308  hypothetical protein  46.81 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0140244  normal  0.688879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>