More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0056 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
951 aa  1978    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  76.1 
 
 
955 aa  1568    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  58.05 
 
 
1016 aa  1155    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  75.76 
 
 
952 aa  1558    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0500  twin-arginine translocation pathway signal  38.1 
 
 
1127 aa  645    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  55.58 
 
 
977 aa  1081    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  58.03 
 
 
1014 aa  1143    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  43.76 
 
 
1073 aa  781    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  59.23 
 
 
967 aa  1166    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  77.42 
 
 
953 aa  1595    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  76.79 
 
 
953 aa  1585    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  56.34 
 
 
953 aa  1087    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  58.24 
 
 
994 aa  1173    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 
879 aa  413  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  32.14 
 
 
879 aa  405  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1062  molydopterin dinucleotide-binding region  27.85 
 
 
1318 aa  215  2.9999999999999995e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.667972  normal  0.812016 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1988  molydopterin dinucleotide-binding region  27.69 
 
 
1320 aa  210  8e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.447837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.82 
 
 
695 aa  191  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  25.64 
 
 
731 aa  189  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  28.08 
 
 
722 aa  181  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.13 
 
 
760 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  28.17 
 
 
807 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  24.34 
 
 
764 aa  165  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  24.2 
 
 
764 aa  164  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  24.2 
 
 
764 aa  163  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.03 
 
 
808 aa  163  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  24.91 
 
 
808 aa  162  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  24.91 
 
 
808 aa  162  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  23.88 
 
 
760 aa  162  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  24.35 
 
 
808 aa  160  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.53 
 
 
808 aa  160  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.53 
 
 
808 aa  160  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.56 
 
 
814 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.26 
 
 
814 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  24.5 
 
 
808 aa  159  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  24.61 
 
 
808 aa  159  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.26 
 
 
814 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.26 
 
 
814 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  27.95 
 
 
731 aa  158  5.0000000000000005e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.32 
 
 
814 aa  158  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  24.79 
 
 
808 aa  157  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.4 
 
 
734 aa  157  9e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  26.26 
 
 
731 aa  157  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  23.9 
 
 
758 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  23.9 
 
 
758 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  23.9 
 
 
758 aa  156  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 
764 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 
764 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  23.9 
 
 
758 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  23.9 
 
 
758 aa  155  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  24.57 
 
 
760 aa  154  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  26.76 
 
 
732 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 
695 aa  154  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.27 
 
 
730 aa  153  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  24.29 
 
 
812 aa  153  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  23.61 
 
 
760 aa  151  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.97 
 
 
811 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 
738 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 
737 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.59 
 
 
811 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.66 
 
 
817 aa  149  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 
733 aa  149  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.37 
 
 
781 aa  149  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  24.64 
 
 
760 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.47 
 
 
811 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.47 
 
 
811 aa  148  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 
731 aa  147  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.43 
 
 
816 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 
739 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  27.39 
 
 
700 aa  147  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.6 
 
 
793 aa  147  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.31 
 
 
811 aa  147  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  24.52 
 
 
729 aa  145  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 
759 aa  145  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  24.36 
 
 
709 aa  145  4e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  29.95 
 
 
843 aa  144  7e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 
744 aa  144  9e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.5 
 
 
730 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  24.35 
 
 
866 aa  143  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  26.75 
 
 
731 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  25.95 
 
 
711 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  23.04 
 
 
760 aa  142  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 
817 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.05 
 
 
739 aa  141  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.7 
 
 
798 aa  141  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  25.7 
 
 
807 aa  141  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.7 
 
 
798 aa  141  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.7 
 
 
807 aa  141  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  25.7 
 
 
807 aa  141  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.7 
 
 
807 aa  141  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 
698 aa  141  6e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.7 
 
 
807 aa  141  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.75 
 
 
935 aa  140  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  23.04 
 
 
932 aa  140  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  25.39 
 
 
826 aa  140  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  22.01 
 
 
855 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.04 
 
 
806 aa  140  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  25.8 
 
 
741 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  24.85 
 
 
747 aa  139  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.05 
 
 
974 aa  138  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>