More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0049 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0049  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  100 
 
 
88 aa  176  8e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.116999  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2015  ATP synthase F1, epsilon subunit  73.86 
 
 
88 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0048  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  70.45 
 
 
88 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0030  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  70.45 
 
 
88 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00561191  normal  0.882026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0020  ATP synthase F1, epsilon subunit  73.86 
 
 
88 aa  135  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.118966 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0028  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  71.59 
 
 
88 aa  134  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0047  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  63.64 
 
 
88 aa  114  3e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3764  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.75 
 
 
80 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3416  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  45.57 
 
 
80 aa  71.6  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7072  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  43.42 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.689202  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.11 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2381  ATP synthase F1, epsilon subunit  40.24 
 
 
137 aa  70.1  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5126  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  41.03 
 
 
81 aa  70.1  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.285472  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  42.31 
 
 
134 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1028  hypothetical protein  39.74 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0565  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.74 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0014162  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_504  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.74 
 
 
140 aa  65.5  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000115824  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  42.5 
 
 
132 aa  64.7  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0539  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.46 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000746068  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21390  F0F1-type ATP synthase, epsilon subunit  42.86 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0337  H+-transporting two-sector ATPase, epsilon subunit  41.03 
 
 
80 aa  63.5  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4347  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.71 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4502  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.71 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4483  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.71 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0818  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  35.16 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.97 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  41.98 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3283  ATP synthase F1, epsilon subunit  39.24 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.74 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0344  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.18 
 
 
133 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0213495 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0115  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.5 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01405  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.78 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.913461  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4164  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.59 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000197005  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1798  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.25 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1106  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.25 
 
 
135 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  37.84 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1739  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.577687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0013  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.46 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3021  ATP synthase F1, epsilon subunit  27.06 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0911  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  38.16 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1227  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  34.62 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3628  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  35.71 
 
 
94 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.160412  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1046  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.71 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.100266 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
140 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.57 
 
 
137 aa  57.8  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3219  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.75 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.816212  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.67 
 
 
139 aa  57.8  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2796  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.44 
 
 
140 aa  57  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1731  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.41 
 
 
138 aa  57.4  0.00000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.74 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1050  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.62 
 
 
132 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0918  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0350639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3073  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  34.62 
 
 
140 aa  57  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.26 
 
 
139 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0409  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.384593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3510  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.58 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1742  H+-transporting two-sector ATPase, delta/epsilon subunit  39.24 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.340723 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4606  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.51 
 
 
144 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2609  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.18 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2800  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.73 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.694074  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.16 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4010  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  33.33 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000597874 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3052  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.77 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  43.21 
 
 
142 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.9 
 
 
135 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.94 
 
 
139 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.16 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.18 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0464757  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1308  H+transporting two-sector ATPase delta/epsilon subunit  33.75 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279861  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3874  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.53 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0309  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0959525 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2909  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.77 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4869  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.77 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0516  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.05 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0560  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.52 
 
 
151 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  44.12 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0304  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 
138 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.799769  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0217  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.812773  normal  0.0791125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3939  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  40.79 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.26 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0602  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0804417  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2326  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.35 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.701275  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1672  ATP synthase epsilon subunit  36.25 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485979 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4258  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
139 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1563  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.5 
 
 
134 aa  54.3  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000113638  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0194  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.88 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0438169  normal  0.0198607 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1122  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.76 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0173  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.33 
 
 
135 aa  53.9  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.77 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4868  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.05 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0373  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.89 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>