More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0043 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0709  uroporphyrin-III C-methyltransferase  70.07 
 
 
458 aa  661    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0043  uroporphyrin-III C-methyltransferase  100 
 
 
462 aa  954    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0142  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  68.23 
 
 
462 aa  633  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0050  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  62.05 
 
 
467 aa  586  1e-166  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.929104 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1843  uroporphyrin-III C-methyltransferase  57.68 
 
 
451 aa  528  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.572708  normal  0.146892 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2306  uroporphyrin-III C-methyltransferase  75.09 
 
 
351 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.500417  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1942  uroporphyrin-III C-methyltransferase-like  65.64 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1248  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  34.06 
 
 
520 aa  236  9e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.472521 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3062  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.97 
 
 
512 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00105684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.33 
 
 
510 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.89 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  33.11 
 
 
516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0358  uroporphyrin-III C-methyltransferase  35.61 
 
 
510 aa  216  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0701  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.94 
 
 
504 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.49 
 
 
505 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  31.81 
 
 
505 aa  214  2.9999999999999995e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3353  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.5 
 
 
504 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3062  uroporphyrinogen-III methylase  33.74 
 
 
513 aa  210  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3452  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.6 
 
 
525 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.305578  normal  0.171928 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2528  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.26 
 
 
493 aa  208  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  33.12 
 
 
508 aa  208  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.01 
 
 
511 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03694  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.94 
 
 
479 aa  205  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1278  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.34 
 
 
504 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000100069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3286  uroporphyrinogen III synthase/methyltransferase  33.17 
 
 
515 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3235  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  33.01 
 
 
513 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0761379  normal  0.140873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3188  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.56 
 
 
272 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1977  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / uroporphyrinogen-III synthase  32.15 
 
 
513 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0017868  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0671  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.48 
 
 
482 aa  201  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  0.0127709 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2837  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  31.25 
 
 
503 aa  201  3e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.452302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2383  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  44.73 
 
 
462 aa  201  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.806488  hitchhiker  0.00704026 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.14 
 
 
512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2597  siroheme synthase  45.99 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30340  siroheme synthase  45.99 
 
 
465 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.03 
 
 
519 aa  199  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3999  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.3 
 
 
463 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.426226  hitchhiker  0.00756787 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3344  siroheme synthase  44.18 
 
 
464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00903193  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3403  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.3 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.242571 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03219  fused siroheme synthase 1,3-dimethyluroporphyriongen III dehydrogenase and siroheme ferrochelatase/uroporphyrinogen methyltransferase  42.02 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0344  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.02 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0344  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.898093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3744  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3650  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000355794 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3174  uroporphyrin-III C-methyltransferase, C-terminal:siroheme synthase, N-terminal  43.78 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.108275  normal  0.319321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28170  Uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.99 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4679  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.839222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03171  hypothetical protein  42.02 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3073  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.62 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.419877  normal  0.821671 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3564  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0862  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.62 
 
 
276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0632575  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3374  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.53 
 
 
509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3838  siroheme synthase  42.02 
 
 
457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3604  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.87 
 
 
463 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.556509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0899  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.62 
 
 
276 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3581  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  44.03 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249196  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1107  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.15 
 
 
487 aa  197  5.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3728  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.22 
 
 
276 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0896  uroporphyrin-III C-methyltransferase  34.45 
 
 
506 aa  196  6e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1834  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.87 
 
 
463 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000289405 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2207  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.44 
 
 
507 aa  195  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00880064  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2767  uroporphyrin-III C-methyltransferase  32.22 
 
 
503 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2236  uroporphyrin-III C-methyltransferase  31.78 
 
 
503 aa  196  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0672  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.82 
 
 
273 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608831 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12360  uroporphyrin-III C-methyltransferase  29.9 
 
 
579 aa  194  2e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0958  uroporphyrin-III C-methyltransferase  45.34 
 
 
273 aa  194  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.297399  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3675  siroheme synthase  41.25 
 
 
457 aa  193  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2471  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  43.14 
 
 
479 aa  193  5e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0675252  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1546  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.67 
 
 
283 aa  192  8e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.402925  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3846  siroheme synthase  40.86 
 
 
457 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.130759  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3784  siroheme synthase  40.86 
 
 
457 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.37 
 
 
511 aa  192  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.8 
 
 
506 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3675  siroheme synthase  40.86 
 
 
459 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3749  siroheme synthase  40.86 
 
 
457 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.848215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3044  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.58 
 
 
277 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3362  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
480 aa  190  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2313  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.39 
 
 
502 aa  190  4e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1371  uroporphyrin-III C-methyltransferase  30.59 
 
 
502 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0787  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.44 
 
 
273 aa  190  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.464331  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3519  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.87 
 
 
480 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.605082  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1324  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.73 
 
 
309 aa  189  9e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.867605  normal  0.902463 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1397  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.9 
 
 
528 aa  189  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2892  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.76 
 
 
269 aa  189  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2189  uroporphyrin-III C-methyltransferase, putative  43.67 
 
 
259 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3797  uroporphyrin-III C-methyltransferase  42.97 
 
 
269 aa  188  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000253578  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2173  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  42.62 
 
 
489 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0457  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.77 
 
 
249 aa  187  4e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000204102  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1065  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase / precorrin-2 dehydrogenase  45.27 
 
 
554 aa  187  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0953  uroporphyrin-III C-methyltransferase  44.76 
 
 
278 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.553083  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2235  uroporphyrin-III C-methyltransferase  41.32 
 
 
470 aa  186  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0215  siroheme synthase  41.98 
 
 
462 aa  186  9e-46  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0179  siroheme synthase  42.55 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3796  siroheme synthase  39.3 
 
 
457 aa  186  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.01671 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0407  uroporphyrin-III C-methyltransferase  46.38 
 
 
259 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1679  precorrin-2 dehydrogenase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  40.73 
 
 
481 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0927  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.72 
 
 
281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3409  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.72 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0173  siroheme synthase  42.55 
 
 
478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0232  siroheme synthase  40.38 
 
 
473 aa  185  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0961  uroporphyrin-III C-methyltransferase  43.72 
 
 
281 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.509191  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>