More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0015 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_0005  DNA gyrase, B subunit  55.21 
 
 
640 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0047  DNA gyrase, B subunit  51.16 
 
 
645 aa  664    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.109606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  52.37 
 
 
654 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  54.37 
 
 
642 aa  698    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0003  DNA gyrase, B subunit  61.48 
 
 
795 aa  677    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  60.47 
 
 
646 aa  771    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  58.14 
 
 
654 aa  772    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0002  DNA gyrase, B subunit  56.32 
 
 
638 aa  699    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  61.33 
 
 
796 aa  679    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2549  DNA gyrase, B subunit  55.45 
 
 
643 aa  674    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  56.25 
 
 
636 aa  721    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0005  DNA gyrase subunit B  58.7 
 
 
640 aa  729    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.19557  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  52.37 
 
 
654 aa  652    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0006  DNA gyrase, B subunit  58.46 
 
 
638 aa  736    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.014329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 
650 aa  667    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  60.25 
 
 
633 aa  747    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  51.4 
 
 
647 aa  645    Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0005  DNA gyrase subunit B  58.54 
 
 
640 aa  728    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  52.06 
 
 
654 aa  649    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0005  DNA gyrase subunit B  58.54 
 
 
640 aa  728    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  52.06 
 
 
654 aa  649    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  50.31 
 
 
635 aa  636    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  59.16 
 
 
640 aa  734    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  52.06 
 
 
654 aa  649    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  54.23 
 
 
650 aa  674    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  60.25 
 
 
635 aa  748    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  51.74 
 
 
654 aa  647    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  53.43 
 
 
649 aa  649    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  55.35 
 
 
661 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  53.51 
 
 
655 aa  668    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  61.73 
 
 
633 aa  773    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2517  DNA gyrase subunit B  54.87 
 
 
645 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000275107  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0005  DNA gyrase, B subunit  55.21 
 
 
640 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  55.94 
 
 
636 aa  718    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  60.47 
 
 
795 aa  671    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  54.84 
 
 
642 aa  701    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  85.25 
 
 
644 aa  1145    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  53.19 
 
 
655 aa  665    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  84.7 
 
 
637 aa  1119    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  53.98 
 
 
655 aa  675    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0004  DNA gyrase subunit B  60.88 
 
 
795 aa  673    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00743221  normal  0.701582 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  57.43 
 
 
642 aa  702    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  56.49 
 
 
635 aa  718    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0005  DNA gyrase subunit B  58.54 
 
 
640 aa  728    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  52.06 
 
 
654 aa  649    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  52.77 
 
 
655 aa  663    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  53.39 
 
 
645 aa  645    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0006  DNA gyrase subunit B  50.15 
 
 
675 aa  635    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0596209 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  58.59 
 
 
651 aa  776    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  56.78 
 
 
627 aa  704    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  57.8 
 
 
634 aa  746    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  51.9 
 
 
654 aa  648    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  52.14 
 
 
654 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  59.54 
 
 
802 aa  692    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  53.4 
 
 
675 aa  695    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10005  DNA gyrase subunit B  50.74 
 
 
714 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0004  DNA gyrase, B subunit  60.22 
 
 
794 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  52.79 
 
 
655 aa  687    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4195  DNA gyrase, B subunit  51.02 
 
 
653 aa  659    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698411 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  60.97 
 
 
632 aa  802    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  52.8 
 
 
648 aa  639    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  54.96 
 
 
645 aa  648    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0005  DNA gyrase, B subunit  57.85 
 
 
825 aa  657    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000146448 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  87.89 
 
 
644 aa  1195    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  53.2 
 
 
655 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0006  DNA gyrase subunit B  50.15 
 
 
675 aa  635    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  54.7 
 
 
644 aa  718    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  52.7 
 
 
655 aa  668    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  52.88 
 
 
658 aa  673    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  60.06 
 
 
652 aa  801    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0006  DNA gyrase subunit B  58.37 
 
 
638 aa  714    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0006  DNA gyrase subunit B  58.22 
 
 
638 aa  714    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  52.09 
 
 
641 aa  650    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  100 
 
 
644 aa  1335    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  55.28 
 
 
633 aa  738    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  53.75 
 
 
655 aa  670    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  59.87 
 
 
641 aa  755    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  56.13 
 
 
651 aa  694    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  51.16 
 
 
644 aa  644    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0005  DNA gyrase subunit B  52.87 
 
 
652 aa  652    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.986745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0005  DNA gyrase subunit B  58.54 
 
 
640 aa  728    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00230725  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  52.7 
 
 
655 aa  665    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  84.82 
 
 
649 aa  1144    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  54.15 
 
 
786 aa  651    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1480  DNA gyrase subunit B  55.28 
 
 
650 aa  672    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0006  DNA gyrase subunit B  50.81 
 
 
696 aa  642    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248414  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  54.93 
 
 
651 aa  688    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  58.6 
 
 
628 aa  777    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  57.17 
 
 
808 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  85.96 
 
 
643 aa  1154    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0005  DNA gyrase subunit B  51.73 
 
 
666 aa  637    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  61.52 
 
 
802 aa  696    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  84.16 
 
 
643 aa  1134    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0014  DNA gyrase subunit B  50.15 
 
 
675 aa  635    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  58.39 
 
 
640 aa  726    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  53.47 
 
 
656 aa  693    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  52.8 
 
 
719 aa  639    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  60.38 
 
 
640 aa  786    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  58.79 
 
 
640 aa  731    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0822  DNA gyrase subunit B  50.81 
 
 
675 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.795596  normal  0.437658 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>