243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0010 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0010  cytochrome c class I  100 
 
 		 126 aa  265  2e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000266179  hitchhiker  0.00574029 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0009  cytochrome c class I  67.2 
 
 		 124 aa  167  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0010  cytochrome c class I  56.1 
 
 		 123 aa  126  9.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  55.83 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0031  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  69.62 
 
 		 126 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214026  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2005  sulfide dehydrogenase, cytochrome subunit  73.97 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0152993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1738  cytochrome c, class I  45.45 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1162  cytochrome c, class I  42.67 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.806523  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0626  cytochrome c class I  46.38 
 
 		 106 aa  70.5  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0237  cytochrome c, class I  31.58 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  normal  0.118914 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3047  cytochrome c class I  45.21 
 
 		 106 aa  67.8  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.545307  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  43.94 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1330  cytochrome c553-like protein  37.04 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  38.46 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3427  cytochrome c, class I  47.06 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.105775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1266  cytochrome c, class I  43.48 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.14391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1844  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000314475  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  37.68 
 
 		 108 aa  60.1  0.000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1185  cytochrome c family protein  35.35 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.472956  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3262  cytochrome c, class I  36.99 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.161977  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1665  cytochrome c, class I  40.91 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0134409  normal  0.341373 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2578  hypothetical protein  37.66 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.365734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0729  hypothetical protein  43.48 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2428  putative cytochrome c  40.58 
 
 		 110 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3133  putative signal peptide protein  38.16 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3461  conserved hypothetical signal peptide protein  36.14 
 
 		 118 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  44.44 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4438  cytochrome c553-like  40.58 
 
 		 112 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0685  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.18451  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  40.45 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  42.03 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  37.78 
 
 		 217 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4249  putative cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  37.14 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.22639 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1476  putative signal peptide protein  38.24 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.907195  normal  0.613134 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  39.06 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 225 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  44.62 
 
 		 237 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3263  putative signal peptide protein  38.16 
 
 		 116 aa  51.6  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4954  Cytochrome c553-like protein  37.14 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3771  putative cytochrome c  33.33 
 
 		 125 aa  51.2  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 263 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  37.5 
 
 		 221 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4567  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00798656  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1179  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1017  cytochrome c, class IC  34.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1332  cytochrome c, class IC  34.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.0014287  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  37.66 
 
 		 223 aa  50.8  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4365  cytochrome subunit of sulfide dehydrogenase  37.14 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0848  cytochrome C4 family protein  34.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0300  cytochrome c, class IC  34.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.949004  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  36.67 
 
 		 217 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1171  cytochrome c family protein  34.48 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1589  class I diheme cytochrome c4  35.94 
 
 		 191 aa  50.4  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3136  cytochrome c, class I  35.29 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.753585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0966  cytochrome c, class IC:cytochrome c, class I  34.18 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2985  cytochrome c553-like protein  30.33 
 
 		 281 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3330  cytochrome c553-like protein  42.65 
 
 		 109 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  30.09 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  36.62 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  36.23 
 
 		 382 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 218 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  35.82 
 
 		 216 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0546  cytochrome c, class I  28.57 
 
 		 249 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2081  putative cytochrome c  32.31 
 
 		 194 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  36.36 
 
 		 318 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1770  cytochrome c553-like protein  34.38 
 
 		 195 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.290935 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  37.88 
 
 		 256 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2741  class I diheme cytochrome c4  37.5 
 
 		 198 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.236816  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  31.82 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1578  cytochrome c, class I  32.35 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  37.33 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  32.39 
 
 		 266 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  34.33 
 
 		 217 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7221  cytochrome c class I  37.88 
 
 		 112 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  26.92 
 
 		 262 aa  47.4  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  33.78 
 
 		 153 aa  47.4  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  29.84 
 
 		 222 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2566  putative cytochrome c  32.89 
 
 		 228 aa  47.4  0.00006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458345 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1400  class I diheme cytochrome c4  35.94 
 
 		 198 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.49014  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.78 
 
 		 202 aa  47  0.00009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  26.92 
 
 		 262 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  26.92 
 
 		 262 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  26.92 
 
 		 262 aa  47  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 219 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  30.49 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  36.51 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  37.31 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  31.43 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  30.99 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.86 
 
 		 205 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6469  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3028  class I cytochrome c  35.38 
 
 		 103 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  31.34 
 
 		 273 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  28.79 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  40 
 
 		 223 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>