More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05536 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_05536  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
166 aa  329  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.192233  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  77.11 
 
 
174 aa  261  4e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1577  lipoprotein signal peptidase  75.62 
 
 
167 aa  238  2e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1520  lipoprotein signal peptidase  75.62 
 
 
167 aa  238  2e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0161435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  50 
 
 
176 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  49.69 
 
 
170 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  49.69 
 
 
170 aa  141  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  49.69 
 
 
170 aa  141  4e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  49.68 
 
 
170 aa  140  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  51.02 
 
 
171 aa  138  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 
182 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3531  lipoprotein signal peptidase  48.43 
 
 
170 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  52.32 
 
 
154 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  52.78 
 
 
170 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  42.77 
 
 
182 aa  136  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 
170 aa  135  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  48.75 
 
 
159 aa  134  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  45.35 
 
 
202 aa  134  5e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 
171 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 
171 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  50.34 
 
 
171 aa  133  9e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  42.94 
 
 
173 aa  133  9e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 
168 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 
164 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  49.66 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  46.88 
 
 
176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 
176 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 
170 aa  127  6e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  42.44 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  43.02 
 
 
169 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  40.36 
 
 
168 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  44.1 
 
 
171 aa  125  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  43.03 
 
 
169 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  43.03 
 
 
169 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  51.01 
 
 
163 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  44.38 
 
 
169 aa  124  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  46.41 
 
 
158 aa  124  7e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
166 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
166 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
166 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
166 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
166 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
166 aa  123  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
166 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  47.48 
 
 
174 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  47.86 
 
 
166 aa  122  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  47.48 
 
 
174 aa  122  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 
178 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0027  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
164 aa  121  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.102784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0029  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
164 aa  121  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0677738  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0025  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
164 aa  121  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.258735  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3628  lipoprotein signal peptidase  43.64 
 
 
164 aa  121  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.73283  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00031  signal peptidase II  43.64 
 
 
164 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00165346  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00030  hypothetical protein  43.64 
 
 
164 aa  121  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0011292  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  46.67 
 
 
166 aa  121  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 
235 aa  121  5e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 
166 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 
166 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 
166 aa  121  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  43.36 
 
 
170 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  42.01 
 
 
170 aa  120  7e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3572  lipoprotein signal peptidase  43.03 
 
 
164 aa  120  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.262738  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  43.03 
 
 
164 aa  120  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  48.55 
 
 
154 aa  120  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1780  lipoprotein signal peptidase  44.83 
 
 
178 aa  119  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.316682  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  46.76 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  48.55 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  48.55 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 
166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0029  lipoprotein signal peptidase  43.03 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0223845  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  43.51 
 
 
160 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 
166 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3652  lipoprotein signal peptidase  42.95 
 
 
170 aa  117  6e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  45.27 
 
 
166 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  46 
 
 
166 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  44.44 
 
 
169 aa  116  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2110  lipoprotein signal peptidase  39.63 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.670579  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0585  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 
166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00142013  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0401  lipoprotein signal peptidase  48.73 
 
 
216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  41.1 
 
 
167 aa  115  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  42.24 
 
 
171 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  45.03 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0363  lipoprotein signal peptidase  48.73 
 
 
171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3845  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 
170 aa  114  5e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3391  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 
166 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.137503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2304  signal peptidase II  44 
 
 
166 aa  114  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000504038  hitchhiker  0.000155189 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 
168 aa  114  6e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  45.57 
 
 
168 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  48.23 
 
 
164 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  42.94 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0051  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.322975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  43.88 
 
 
170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  45.77 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0050  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.612919  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0052  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 
166 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.876995  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0051  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 
166 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  38.82 
 
 
169 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0051  lipoprotein signal peptidase  41.32 
 
 
166 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0475146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  42.28 
 
 
161 aa  111  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>