16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04852 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04852  ISxac1 transposase  100 
 
 		 61 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00697578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00634  ISXoo8 transposase  100 
 
 		 407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01507  ISXoo8 transposase  100 
 
 		 407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.17204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01863  ISXoo8 transposase  100 
 
 		 407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02154  ISXoo8 transposase  100 
 
 		 407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.775985  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03192  ISXoo8 transposase  100 
 
 		 407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04334  ISXoo8 transposase  100 
 
 		 407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000241715  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05638  ISXoo8 transposase  100 
 
 		 407 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01801  ISXoo8 transposase  94.74 
 
 		 407 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02581  ISXoo8 transposase  92.98 
 
 		 404 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03317  ISxac1 transposase  94.74 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04657  ISXoo8 transposase  92.98 
 
 		 407 aa  107  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.18331  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1976  transposase IS4 family protein  48.08 
 
 		 397 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00982369  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2015  transposase IS4 family protein  48.08 
 
 		 397 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3303  transposase IS4 family protein  48.08 
 
 		 397 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3793  transposase IS4 family protein  48.08 
 
 		 397 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>