55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04813 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04813  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  304  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2650  protein of unknown function DUF456  62.5 
 
 
161 aa  180  9.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.435877  normal  0.169604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1793  hypothetical protein  44.16 
 
 
162 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1010  hypothetical protein  44.67 
 
 
160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0973  protein of unknown function DUF456  45 
 
 
161 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.344624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2638  hypothetical protein  47.83 
 
 
159 aa  121  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0433  hypothetical protein  44.38 
 
 
171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2010  hypothetical protein  42.21 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000106435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1732  hypothetical protein  43.87 
 
 
161 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000256519  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1503  protein of unknown function DUF456  40.99 
 
 
161 aa  104  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000108827  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1560  protein of unknown function DUF456  41.94 
 
 
161 aa  97.8  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0774261  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2882  protein of unknown function DUF456  41.56 
 
 
159 aa  95.5  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0019277  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0886  hypothetical protein  38.97 
 
 
159 aa  89  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2530  protein of unknown function DUF456  39.37 
 
 
157 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1447  hypothetical protein  41.18 
 
 
165 aa  79  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.704764  normal  0.137111 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1263  protein of unknown function DUF456  39.29 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.916313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1705  protein of unknown function DUF456  37.66 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0325  protein of unknown function DUF456  37.59 
 
 
159 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.390841  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1006  hypothetical protein  39.13 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000095323  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0954  protein of unknown function DUF456  37.24 
 
 
161 aa  75.9  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00446905  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0314  protein of unknown function DUF456  37.59 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0303  hypothetical protein  37.59 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2062  hypothetical protein  49.67 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000914602  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0075  protein of unknown function DUF456  30.46 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1610  hypothetical protein  41.84 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.148481  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1181  hypothetical protein  37.88 
 
 
161 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0330  hypothetical protein  30.28 
 
 
162 aa  61.2  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3098  hypothetical protein  29.87 
 
 
162 aa  57.8  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.142691 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4254  hypothetical protein  36.84 
 
 
160 aa  57.4  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1098  protein of unknown function DUF456  33.33 
 
 
168 aa  57.4  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0512381 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3260  hypothetical protein  30.94 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.897225 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2049  hypothetical protein  30.94 
 
 
160 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.299091  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1382  hypothetical protein  29.37 
 
 
154 aa  54.3  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.764083  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0698  hypothetical protein  27.22 
 
 
162 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2091  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2127  hypothetical protein  30.22 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.87001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1912  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1874  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00711757  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1865  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.215956  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2058  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2159  hypothetical protein  29.41 
 
 
160 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00020937  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0184  protein of unknown function DUF456  35.45 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.348806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1189  hypothetical protein  35.56 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1909  hypothetical protein  28.68 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0448  protein of unknown function DUF456  27.27 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0986569  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5072  protein of unknown function DUF456  34.01 
 
 
180 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.810313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11270  hypothetical protein  32.98 
 
 
161 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0350705  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0261  protein of unknown function DUF456  28.1 
 
 
168 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1881  hypothetical protein  32.76 
 
 
172 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575492 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1078  hypothetical protein  47.62 
 
 
179 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.128864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0095  hypothetical protein  28.97 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0940  protein of unknown function DUF456  31.34 
 
 
200 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0104  hypothetical protein  28.97 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.199717 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0085  hypothetical protein  28.97 
 
 
160 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1547  hypothetical protein  31.4 
 
 
160 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0619985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>