31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04739 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04739  cysteine protease  100 
 
 
270 aa  556  1e-157  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04730  cysteine protease  92.22 
 
 
312 aa  487  1e-137  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0404654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3515  peptidase C1A papain  31.92 
 
 
307 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.071303  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  29.36 
 
 
820 aa  95.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  25.61 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  24.89 
 
 
535 aa  69.7  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  24.58 
 
 
308 aa  68.9  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  25.69 
 
 
789 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  25.53 
 
 
307 aa  63.2  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  26.46 
 
 
934 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  23.95 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  25.52 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4188  peptidase C1A papain  22.41 
 
 
599 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  22.92 
 
 
395 aa  56.6  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  25.11 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  25.68 
 
 
255 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  26.22 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  25.21 
 
 
271 aa  55.1  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  26.75 
 
 
1242 aa  54.3  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  26.23 
 
 
487 aa  53.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  30.58 
 
 
1332 aa  49.3  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  24.7 
 
 
268 aa  49.3  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0145  hypothetical protein  31.54 
 
 
712 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_4995  predicted protein  25.7 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  51.43 
 
 
753 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  23.89 
 
 
323 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  32.04 
 
 
718 aa  45.1  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  25 
 
 
494 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  45.71 
 
 
640 aa  43.9  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  24.12 
 
 
1628 aa  43.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  51.43 
 
 
688 aa  42.4  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>