More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04731 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04731  transposase TnpA, ISL3 family  100 
 
 
472 aa  983    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0781115  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0866  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  56.5 
 
 
434 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0226  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  51.8 
 
 
438 aa  472  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1253  ISL3 family transposase  47.62 
 
 
435 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2022  ISL3 family transposase  47.62 
 
 
417 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0473  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.52 
 
 
429 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0197  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.52 
 
 
429 aa  340  4e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0888  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.52 
 
 
429 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2328  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.52 
 
 
429 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1106  transposase TnpA  42.52 
 
 
429 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1124  transposase TnpA  42.52 
 
 
429 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2905  transposase TnpA  42.52 
 
 
429 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0553555  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1607  transposase TnpA  42.52 
 
 
429 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.694754  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2909  transposase TnpA  42.52 
 
 
429 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0389  transposase TnpA  42.52 
 
 
429 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.241503  normal  0.900463 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0885  transposase TnpA  42.52 
 
 
429 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0223  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  42.52 
 
 
429 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4457  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.47 
 
 
422 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2871  transposase  36.71 
 
 
422 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0586611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1514  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  37.09 
 
 
459 aa  213  9e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.623533 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0249  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.08 
 
 
395 aa  169  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.983773  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1437  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.08 
 
 
395 aa  169  8e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.12833  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  29.08 
 
 
395 aa  169  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.395404  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0351  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.83 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.172822  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1348  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.83 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1023  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.83 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0717423  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1562  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.83 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0215492  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1186  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.83 
 
 
395 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4482  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.59 
 
 
408 aa  160  5e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4034  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.59 
 
 
408 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1816  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.59 
 
 
408 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3509  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.59 
 
 
408 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2977  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.34 
 
 
408 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1438  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  28.42 
 
 
391 aa  155  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1792  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.88 
 
 
396 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.333719  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1367  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.88 
 
 
396 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00109866  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0918  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.91 
 
 
391 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3856  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.91 
 
 
391 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3098  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.88 
 
 
396 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0316374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1434  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.88 
 
 
396 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.458597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3433  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.74 
 
 
391 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2328  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.74 
 
 
391 aa  150  4e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3286  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.74 
 
 
391 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0649  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.74 
 
 
391 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0565  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.74 
 
 
391 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2445  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.74 
 
 
391 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.08593  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1314  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.74 
 
 
391 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0608  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.74 
 
 
391 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0803  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.25 
 
 
396 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3125  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  27.25 
 
 
396 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1174  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.76 
 
 
408 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000815795  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0599  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.76 
 
 
408 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0551  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.76 
 
 
408 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.340213  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.76 
 
 
408 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1002  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.76 
 
 
408 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.520122  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1542  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.76 
 
 
408 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0083  hypothetical protein  23.45 
 
 
383 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0865474 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0110  hypothetical protein  23.45 
 
 
383 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1544  hypothetical protein  23.45 
 
 
383 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.454113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5170  hypothetical protein  23.45 
 
 
383 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188868 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1177  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.76 
 
 
408 aa  109  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123826  normal  0.601968 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0373  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.14 
 
 
408 aa  108  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000384224  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0341  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.55 
 
 
408 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.717183  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0646  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.27 
 
 
408 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.468712  normal  0.0451791 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0631  transposase  24.34 
 
 
418 aa  103  7e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3476  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.96 
 
 
431 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418883  normal  0.413938 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0315  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.88 
 
 
432 aa  102  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.677908  normal  0.267906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2896  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.88 
 
 
390 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.158144  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1271  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.88 
 
 
390 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.148538 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1056  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.96 
 
 
389 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0849  transposase  24.11 
 
 
418 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.414114  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1162  transposase  24.11 
 
 
418 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1834  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.88 
 
 
432 aa  102  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1556  transposase  24.11 
 
 
418 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1692  transposase  24.11 
 
 
442 aa  102  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.67531  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4396  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  26.88 
 
 
390 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4119  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.62 
 
 
417 aa  98.6  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2732  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.71 
 
 
407 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.109288  normal  0.214466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4575  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.71 
 
 
407 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.115967 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4792  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.71 
 
 
407 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5329  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  26.91 
 
 
407 aa  96.7  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.5369 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1035  hypothetical protein  22.11 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2037  hypothetical protein  22.11 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2311  hypothetical protein  22.11 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2402  hypothetical protein  22.11 
 
 
391 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0936  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.18 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5539  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165  27.46 
 
 
407 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.704796 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0006  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.11 
 
 
411 aa  96.3  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1949  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  23.91 
 
 
411 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.960551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4632  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.94 
 
 
434 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.135033  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2889  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.94 
 
 
434 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0124927  hitchhiker  0.00109872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1245  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.94 
 
 
434 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139986  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3047  transposase IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  24.94 
 
 
434 aa  94.4  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000291896  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23490  transposase family protein  25.18 
 
 
454 aa  94  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22400  transposase family protein  25.18 
 
 
454 aa  94  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.323222  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05360  transposase family protein  25.18 
 
 
454 aa  94  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.711648  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0116  transposase, IS204/IS1001/IS1096/IS1165 family protein  25.14 
 
 
421 aa  93.6  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0526  putative transposase  26.2 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1788  transposase and inactivated derivatives  26.2 
 
 
411 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2818  ISBma1, transposase  23.32 
 
 
406 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.859057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>