121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04699 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  100 
 
 
357 aa  725    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  43.72 
 
 
373 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  43.99 
 
 
373 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  44.81 
 
 
373 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  43.99 
 
 
373 aa  272  6e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  41.48 
 
 
365 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  42.7 
 
 
369 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  43.21 
 
 
373 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  43.21 
 
 
373 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  43.17 
 
 
373 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  43.17 
 
 
373 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  43.17 
 
 
373 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  43.17 
 
 
373 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  43.17 
 
 
373 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  44.31 
 
 
337 aa  265  8e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  42.9 
 
 
373 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  42.9 
 
 
373 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  42.62 
 
 
373 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  43.29 
 
 
369 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  36.01 
 
 
371 aa  204  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  34.53 
 
 
364 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  33.52 
 
 
364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  34.71 
 
 
366 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  33.88 
 
 
366 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  34.08 
 
 
365 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  33.06 
 
 
361 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  33.89 
 
 
361 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  32.87 
 
 
362 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  31.44 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  31.83 
 
 
363 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  28.91 
 
 
382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  31.25 
 
 
439 aa  132  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.84 
 
 
439 aa  126  5e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  25.77 
 
 
368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  34.25 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  25.64 
 
 
372 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  30.97 
 
 
372 aa  105  9e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  24.93 
 
 
371 aa  99  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.53 
 
 
345 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3024  ImpA-like  28.75 
 
 
359 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7014  ImpA domain-containing protein  27.71 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  27.67 
 
 
340 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0402  hypothetical protein  38.98 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.228405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1201  ImpA-like N-terminal family protein  38.98 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1599  hypothetical protein  38.98 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.595885  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1782  hypothetical protein  38.98 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2961  ImpA-related N-terminal family protein  38.98 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2836  ImpA-related N-terminal family protein  38.98 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  unclonable  0.000685446  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0452  ImpA-related N-terminal family protein  38.98 
 
 
359 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.183774  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26680  ImpA domain-containing protein  41.82 
 
 
344 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0224115  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6687  ImpA domain-containing protein  26.61 
 
 
354 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.895171  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  27.63 
 
 
343 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  25.14 
 
 
358 aa  75.1  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2098  cytoplasmic protein  28.31 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6121  ImpA domain-containing protein  26.43 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537436  normal  0.338806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3467  ImpA domain-containing protein  27.86 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  28.13 
 
 
341 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  34.94 
 
 
343 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0257  ImpA-like N-terminal family protein  35.59 
 
 
354 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  34.34 
 
 
344 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0948  ImpA domain protein  28.36 
 
 
368 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  31.97 
 
 
520 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4092  ImpA family type VI secretion-associated protein  26.93 
 
 
345 aa  67  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000185022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3014  ImpA domain-containing protein  26.73 
 
 
352 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  25.41 
 
 
339 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3901  ImpA domain-containing protein  27.73 
 
 
372 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.968784 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00245  ImpA-related N-terminal family  25 
 
 
342 aa  65.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  31.73 
 
 
518 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  32.79 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1169  putative type VI secretion protein VasJ-1  20.56 
 
 
461 aa  63.5  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  24.38 
 
 
789 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  31.19 
 
 
790 aa  61.2  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1902  ImpA-like N-terminal family protein  27.6 
 
 
314 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0289  ImpA-related protein  24.56 
 
 
351 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0973  ImpA-like protein  24.18 
 
 
372 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0304  ImpA-related N- family protein  24.27 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43050  hypothetical protein  33.06 
 
 
518 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.33519  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.93 
 
 
360 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  24.12 
 
 
347 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0291  ImpA-related N- family protein  24.27 
 
 
349 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.15903  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05864  hypothetical protein  22.26 
 
 
533 aa  57.8  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3616  hypothetical protein  33.06 
 
 
518 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.432292  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0134  ImpA-like N-terminal family protein  26.43 
 
 
356 aa  57  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  27.22 
 
 
376 aa  57  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0250  ImpA-related N-terminal family protein  31.48 
 
 
371 aa  53.5  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1902  hypothetical protein  31.48 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1702  ImpA-like N-terminal family protein  31.48 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0913  hypothetical protein  31.48 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1200  hypothetical protein  31.48 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0341  ImpA, N-terminal  31.48 
 
 
367 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.402046  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000434  hypothetical protein  25.93 
 
 
437 aa  53.5  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2175  ImpA-related N-terminal family protein  31.43 
 
 
345 aa  52.4  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.229693  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1359  ImpA domain-containing protein  21.76 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.906132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1471  ImpA domain-containing protein  21.76 
 
 
397 aa  52.4  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0796  ImpA domain-containing protein  32.11 
 
 
534 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5596  ImpA-like  33.01 
 
 
520 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  31.15 
 
 
357 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  31.15 
 
 
357 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2699  ImpA domain-containing protein  22.63 
 
 
393 aa  50.8  0.00004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.325925  hitchhiker  0.00854988 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3246  type VI secretion-associated protein  27.74 
 
 
528 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.644399  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>