243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04694 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04694  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 896 aa  1786    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.510612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0628  phosphoenolpyruvate carboxylase  78.35 
 
 		 903 aa  1321    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.472091  normal  0.156419 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.68 
 
 		 906 aa  532  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.26 
 
 		 931 aa  522  1e-146  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4721  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.32 
 
 		 896 aa  500  1e-140  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.73 
 
 		 933 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2522  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.96 
 
 		 898 aa  495  9.999999999999999e-139  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.314131  normal  0.688456 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3372  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.96 
 
 		 954 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.16897  normal  0.0169506 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.51 
 
 		 926 aa  489  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4375  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.46 
 
 		 896 aa  487  1e-136  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0553395  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0472  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.84 
 
 		 898 aa  488  1e-136  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1468  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.55 
 
 		 898 aa  489  1e-136  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2494  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.57 
 
 		 897 aa  485  1e-135  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.64 
 
 		 1009 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.43 
 
 		 929 aa  482  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.39 
 
 		 985 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.54 
 
 		 918 aa  476  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.74 
 
 		 1001 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.24 
 
 		 928 aa  473  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.27 
 
 		 1006 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.47 
 
 		 939 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.59 
 
 		 929 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.83 
 
 		 1002 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 		 938 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0614  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.71 
 
 		 954 aa  467  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.38 
 
 		 952 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.61 
 
 		 920 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0261  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.39 
 
 		 882 aa  463  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.132478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.62 
 
 		 928 aa  462  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.15 
 
 		 929 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.06 
 
 		 933 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1661  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.55 
 
 		 938 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.13 
 
 		 951 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.81 
 
 		 936 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.5 
 
 		 937 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0178  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.68 
 
 		 940 aa  459  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 		 972 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.5 
 
 		 931 aa  456  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0994  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.79 
 
 		 892 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.43848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.72 
 
 		 929 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2291  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.62 
 
 		 883 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.36 
 
 		 947 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0828  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.85 
 
 		 928 aa  449  1e-125  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.891362  normal  0.27066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.19 
 
 		 949 aa  452  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.99 
 
 		 930 aa  452  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6583  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.88 
 
 		 981 aa  451  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.800439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.45 
 
 		 933 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4447  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.04 
 
 		 945 aa  449  1.0000000000000001e-124  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0254  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.54 
 
 		 887 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.974753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5805  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.81 
 
 		 914 aa  449  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.454197 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.87 
 
 		 949 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.87 
 
 		 949 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 		 946 aa  444  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2408  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.82 
 
 		 946 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2454  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.82 
 
 		 946 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.302733  normal  0.778298 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.77 
 
 		 950 aa  445  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2448  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.82 
 
 		 946 aa  444  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0742  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.22 
 
 		 937 aa  442  9.999999999999999e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.94 
 
 		 929 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.09 
 
 		 900 aa  441  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3418  Phosphoenolpyruvate carboxylase  40.4 
 
 		 881 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.63 
 
 		 900 aa  442  9.999999999999999e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2707  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.17 
 
 		 936 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136783 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.01 
 
 		 915 aa  440  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.94 
 
 		 929 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.13 
 
 		 947 aa  439  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.54 
 
 		 926 aa  439  1e-121  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1255  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.08 
 
 		 876 aa  436  1e-121  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0155098  normal  0.99385 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0327  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.49 
 
 		 878 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.95477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.34 
 
 		 994 aa  434  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0248  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.59 
 
 		 887 aa  433  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16690  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.28 
 
 		 878 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.2 
 
 		 1075 aa  433  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.69 
 
 		 932 aa  436  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3706  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.66 
 
 		 937 aa  435  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.625576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0274  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.52 
 
 		 881 aa  431  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.54 
 
 		 926 aa  429  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4015  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.63 
 
 		 889 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.265986 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4096  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.63 
 
 		 889 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.46 
 
 		 911 aa  432  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695017  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4125  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.52 
 
 		 889 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.76 
 
 		 910 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3718  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.52 
 
 		 889 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.910029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4214  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.52 
 
 		 889 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1451  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.17 
 
 		 878 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.4068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07300  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.28 
 
 		 942 aa  427  1e-118  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1653  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.15 
 
 		 892 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0256628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1323  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.8 
 
 		 879 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.133852 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0606  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.78 
 
 		 922 aa  428  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4278  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.51 
 
 		 878 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.419374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.77 
 
 		 970 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.94 
 
 		 994 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0701  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.41 
 
 		 890 aa  428  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.94 
 
 		 1009 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4065  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.57 
 
 		 879 aa  429  1e-118  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.94 
 
 		 1009 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.46 
 
 		 1030 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.21 
 
 		 1004 aa  425  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3710  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.26 
 
 		 889 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3360  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.07 
 
 		 878 aa  425  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>