275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04663 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  100 
 
 
305 aa  620  1e-177  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  77.42 
 
 
308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  77.42 
 
 
308 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  76.34 
 
 
308 aa  442  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  74.48 
 
 
291 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3604  taurine dioxygenase  70.82 
 
 
304 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  71.8 
 
 
308 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  73.31 
 
 
302 aa  434  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  70.2 
 
 
302 aa  437  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  72.04 
 
 
308 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  69.41 
 
 
308 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  71.33 
 
 
287 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  70.99 
 
 
299 aa  408  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0169  TauD/TfdA family dioxygenase  66.31 
 
 
299 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  67.03 
 
 
298 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0190  taurine dioxygenase  66.67 
 
 
299 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0188  taurine dioxygenase  62.58 
 
 
299 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.354503 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34750  putative taurine catabolism dioxygenase  64.97 
 
 
295 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.109909  normal  0.0729012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  66.31 
 
 
298 aa  390  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5058  taurine dioxygenase  65.59 
 
 
299 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  65.23 
 
 
298 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  63.6 
 
 
273 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0746  putative alpha-ketoglutarate-dependent taurine dioxygenase oxidoreductase protein  62.18 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0762  Taurine dioxygenase  57.77 
 
 
300 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0696  Taurine dioxygenase  57.91 
 
 
300 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.976015  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2004  taurine dioxygenase  41.49 
 
 
278 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316372  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0254  taurine dioxygenase  41.28 
 
 
277 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4982  taurine dioxygenase  39.87 
 
 
277 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.393114  normal  0.753177 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0230  taurine dioxygenase  40.94 
 
 
277 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.091152  hitchhiker  0.00688358 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0245  taurine dioxygenase  40.2 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311094  normal  0.333642 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0838  taurine dioxygenase  40.29 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.518318  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  38.33 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1172  taurine dioxygenase  41.28 
 
 
277 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.105338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2733  taurine dioxygenase  39.6 
 
 
295 aa  195  7e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488932  normal  0.0804136 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12970  taurine dioxygenase  41.28 
 
 
277 aa  195  7e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.325066 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0397  taurine dioxygenase  38.95 
 
 
283 aa  192  5e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3239  Taurine dioxygenase  38.95 
 
 
283 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00318  taurine dioxygenase  38.68 
 
 
283 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0443  taurine dioxygenase  38.68 
 
 
283 aa  192  7e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3260  taurine dioxygenase  38.68 
 
 
283 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.169566  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00322  hypothetical protein  38.68 
 
 
283 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0432  taurine dioxygenase  38.68 
 
 
283 aa  192  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0253  taurine dioxygenase  37.85 
 
 
280 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.907637 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0392  taurine dioxygenase  38.6 
 
 
283 aa  191  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3692  taurine dioxygenase  38.11 
 
 
282 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3935  taurine dioxygenase  38.11 
 
 
282 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0261  taurine dioxygenase  38.11 
 
 
282 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0841  taurine dioxygenase  37.54 
 
 
283 aa  186  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.149733 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6202  Taurine dioxygenase  40.96 
 
 
272 aa  183  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3809  taurine dioxygenase  38.79 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.610442 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6361  taurine dioxygenase  39.86 
 
 
264 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0124625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4563  taurine dioxygenase  38.33 
 
 
282 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.737071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5293  taurine dioxygenase  39.65 
 
 
264 aa  179  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5742  Taurine dioxygenase  36.14 
 
 
307 aa  179  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.448505  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0828  taurine dioxygenase  38.52 
 
 
276 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.297497  normal  0.696924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  38.28 
 
 
296 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3087  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.62 
 
 
304 aa  176  6e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2137  taurine dioxygenase  39.66 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0799  taurine dioxygenase  37.88 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229107  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2223  taurine dioxygenase  39.66 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1374  Taurine dioxygenase  35.67 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  38.79 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  38.79 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  38.79 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  38.79 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0623  taurine dioxygenase  39.31 
 
 
277 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0658151  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  38.79 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  38.79 
 
 
297 aa  171  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1796  taurine dioxygenase  35.48 
 
 
270 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.404778  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7076  Taurine dioxygenase  37.94 
 
 
282 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0720  taurine dioxygenase  37.63 
 
 
309 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.047481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4542  taurine dioxygenase  36.77 
 
 
301 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0422287  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4329  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.43 
 
 
305 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2086  taurine dioxygenase  40.15 
 
 
293 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2717  taurine dioxygenase  36.93 
 
 
305 aa  165  9e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4409  taurine dioxygenase 2-oxoglutarate-dependent  37.46 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0425898  normal  0.500105 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0986  taurine dioxygenase  36.29 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0829  taurine dioxygenase  34.62 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161297  normal  0.464747 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2481  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36.01 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  0.197499 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4751  taurine dioxygenase  34.84 
 
 
304 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.325692  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4158  taurine dioxygenase  35.45 
 
 
297 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3776  Taurine dioxygenase  36.18 
 
 
315 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1242  TauD/TfdA family dioxygenase  35.9 
 
 
281 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02435  hypothetical protein  36.27 
 
 
299 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2270  taurine dioxygenase  37.94 
 
 
289 aa  159  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2770  taurine dioxygenase  36.52 
 
 
323 aa  159  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4218  Taurine dioxygenase  37.72 
 
 
322 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3893  Taurine dioxygenase  39.76 
 
 
290 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  34.78 
 
 
287 aa  158  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0273  hypothetical protein  35.59 
 
 
299 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5979  Taurine dioxygenase  34.97 
 
 
290 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1640  TauD/TfdA family dioxygenase  34.66 
 
 
327 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1559  TauD/TfdA family dioxygenase  34.66 
 
 
327 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1546  taurine dioxygenase  34.38 
 
 
316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4567  taurine dioxygenase  36.24 
 
 
315 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0252  taurine dioxygenase  35.47 
 
 
308 aa  155  6e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  33.45 
 
 
284 aa  155  9e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1795  taurine dioxygenase  38.18 
 
 
289 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.119759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2066  taurine dioxygenase  36.59 
 
 
315 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.214366  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4017  taurine dioxygenase  36.59 
 
 
315 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>