284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04219 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3744  amino acid/peptide transporter  71.23 
 
 
499 aa  711    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.971567 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  65.69 
 
 
510 aa  662    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04219  di-tripeptide transporter  100 
 
 
502 aa  984    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189754  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  65.1 
 
 
510 aa  671    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1313  amino acid/peptide transporter  36.82 
 
 
489 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000607679  normal  0.565693 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1380  amino acid/peptide transporter  36.82 
 
 
489 aa  297  3e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00016017  normal  0.180173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1649  amino acid/peptide transporter  36.62 
 
 
490 aa  295  9e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000051541  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1373  amino acid/peptide transporter  36.42 
 
 
489 aa  295  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000302128  hitchhiker  0.00000791426 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2266  amino acid/peptide transporter  36.42 
 
 
490 aa  293  4e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000291592  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1393  amino acid/peptide transporter  37.48 
 
 
501 aa  293  6e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.825614  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3034  alkaline phosphatase  36 
 
 
491 aa  290  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.513893  hitchhiker  0.00921345 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1357  amino acid/peptide transporter  36.42 
 
 
489 aa  286  8e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2905  amino acid/peptide transporter  36.58 
 
 
500 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000347826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1397  amino acid/peptide transporter  34.93 
 
 
489 aa  282  9e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000128075  normal  0.33376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3942  amino acid/peptide transporter  38.41 
 
 
496 aa  280  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0547773  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2895  amino acid/peptide transporter  35.25 
 
 
501 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000544318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0834  amino acid/peptide transporter  34.95 
 
 
499 aa  276  9e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000422142 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01330  hypothetical protein  37.7 
 
 
462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3037  amino acid/peptide transporter  34.85 
 
 
501 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000164206  normal  0.191533 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1468  amino acid/peptide transporter  34.85 
 
 
501 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129299  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  36.06 
 
 
527 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  37.5 
 
 
444 aa  273  6e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3369  proton/peptide symporter family protein  34.29 
 
 
544 aa  268  1e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.31641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2545  amino acid/peptide transporter  34.84 
 
 
501 aa  266  5e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0825  di-/tripeptide transporter  35.41 
 
 
451 aa  265  1e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1421  amino acid/peptide transporter  34.94 
 
 
494 aa  265  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0834  amino acid/peptide transporter  38.88 
 
 
432 aa  265  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.655453  normal  0.033682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004134  di-/tripeptide transporter  35.38 
 
 
462 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3647  peptide/proton symporter family protein  35.81 
 
 
479 aa  263  6.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0604  amino acid/peptide transporter  39.2 
 
 
461 aa  259  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000192962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0757  proton/peptide symporter family protein  38.98 
 
 
461 aa  258  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000369558  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0655  proton/peptide symporter family protein  38.98 
 
 
461 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000039773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0599  peptide symporter family protein  38.98 
 
 
461 aa  257  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000279304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0600  peptide symporter family protein  38.98 
 
 
461 aa  257  3e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000822499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0689  proton/peptide symporter family protein  38.98 
 
 
461 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0721  proton/peptide symporter family protein  39.2 
 
 
461 aa  257  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000879332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0744  proton/peptide symporter family protein  38.98 
 
 
461 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000387987 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4615  proton/peptide symporter family protein  39.2 
 
 
461 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000740471  normal  0.0901188 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0817  proton/peptide symporter family protein  38.75 
 
 
461 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000167379  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  35.04 
 
 
516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0823  amino acid/peptide transporter  35.2 
 
 
517 aa  255  2.0000000000000002e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1845  amino acid/peptide transporter  35.93 
 
 
504 aa  253  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.241988 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3244  amino acid/peptide transporter  35.27 
 
 
495 aa  252  9.000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.950565  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0669  proton/peptide symporter family protein  36.1 
 
 
461 aa  251  2e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.3578e-43 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0682  proton/peptide symporter family protein  36.32 
 
 
461 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00298567  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0651  proton/peptide symporter family protein  36.32 
 
 
461 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000984184  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  33.96 
 
 
516 aa  251  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1105  alkaline phosphatase  32.98 
 
 
544 aa  251  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.377732 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0093  di-tripeptide ABC transporter  34.35 
 
 
497 aa  250  3e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.569603  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  34.36 
 
 
498 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1881  amino acid/peptide transporter  35.01 
 
 
517 aa  250  5e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0879055  hitchhiker  0.00292537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4332  amino acid/peptide transporter  35.24 
 
 
497 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1737  amino acid/peptide transporter  32.63 
 
 
497 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.824621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0531  amino acid/peptide transporter  35.89 
 
 
463 aa  246  8e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0236293  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1058  amino acid/peptide transporter  34.47 
 
 
467 aa  245  1.9999999999999999e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3596  amino acid/peptide transporter  32.75 
 
 
501 aa  243  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.161382  normal  0.0248648 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  34.16 
 
 
534 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2925  amino acid/peptide transporter  35.1 
 
 
528 aa  242  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2904  amino acid/peptide transporter  32.99 
 
 
497 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  33.45 
 
 
539 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  33.82 
 
 
539 aa  240  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  33.27 
 
 
539 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0580  proton/peptide symporter family protein  35.81 
 
 
452 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00403619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0614  proton/peptide symporter family protein  35.81 
 
 
452 aa  239  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1344  di-/tripeptide transporter  32.68 
 
 
507 aa  239  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.938084  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0984  dipeptide/tripeptide permease  35.81 
 
 
483 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00152732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1927  amino acid/peptide transporter  36.22 
 
 
464 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  33.77 
 
 
539 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1555  proton dependent peptide transporter  34.45 
 
 
512 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1664  amino acid/peptide transporter  34.45 
 
 
512 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  36.85 
 
 
509 aa  236  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4686  peptide transport protein, POT family  35.52 
 
 
449 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000138038  hitchhiker  8.70422e-24 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0463  hypothetical protein  34.41 
 
 
446 aa  233  5e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0524  POT family peptide transport protein  34.84 
 
 
449 aa  233  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0524  POT family peptide transport protein  34.84 
 
 
449 aa  233  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000299815  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0457  hypothetical protein  34.41 
 
 
446 aa  233  5e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0528  amino acid/peptide transporter  35.07 
 
 
449 aa  231  3e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000146171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2868  amino acid/peptide transporter  32.06 
 
 
495 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00750801  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03062  putative proton-dependent peptide transporter  34.35 
 
 
483 aa  227  3e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000506345  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0078  amino acid/peptide transporter  32.78 
 
 
603 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17650  amino acid/peptide transporter (peptide:H symporter)  34.12 
 
 
511 aa  227  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0742  proton/peptide symporter family protein  34.91 
 
 
395 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000114111  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3792  amino acid/peptide transporter  34.08 
 
 
482 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0641583  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0615  proton/peptide symporter family protein  31.91 
 
 
492 aa  225  2e-57  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0922  amino acid/peptide transporter  33.8 
 
 
477 aa  224  3e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000322625  unclonable  8.27442e-19 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1420  amino acid/peptide transporter  32.73 
 
 
558 aa  223  4.9999999999999996e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0757  di-/tripeptide transporter  31.79 
 
 
517 aa  223  6e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.548363  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1572  di-/tripeptide transporter  31.5 
 
 
492 aa  223  7e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.827276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4252  amino acid/peptide transporter  33.47 
 
 
486 aa  223  8e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  30.49 
 
 
495 aa  219  1e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1345  di-/tripeptide transporter  31.21 
 
 
516 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0920  amino acid/peptide transporter  33.12 
 
 
436 aa  216  8e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000308736  unclonable  5.10372e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  31.16 
 
 
490 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2274  amino acid/peptide transporter  33.14 
 
 
520 aa  213  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000484906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2556  amino acid/peptide transporter  32.41 
 
 
484 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.109155  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2335  amino acid/peptide transporter  32.92 
 
 
524 aa  211  3e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0988959  normal  0.193339 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0750  amino acid/peptide transporter  31.12 
 
 
501 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.603499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0767  amino acid/peptide transporter  31.12 
 
 
501 aa  209  6e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  30.53 
 
 
489 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  30.74 
 
 
489 aa  209  7e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.953433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>