More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04057 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_04057  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  100 
 
 
437 aa  855    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1863  sun protein  65.02 
 
 
431 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1927  Sun protein  64.32 
 
 
429 aa  508  1e-143  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  62.65 
 
 
443 aa  482  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  45.69 
 
 
434 aa  329  6e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  43.02 
 
 
427 aa  326  6e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  42.89 
 
 
427 aa  325  8.000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  43.09 
 
 
426 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0025  sun protein  42.29 
 
 
429 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0912026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0085  sun protein  47.1 
 
 
436 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273968  hitchhiker  0.000000136476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0027  sun protein  41.82 
 
 
429 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.930823  hitchhiker  0.0023625 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0033  sun protein  42.29 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.709945  hitchhiker  0.00000640703 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0066  sun protein  47.1 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000506957 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0082  sun protein  47.58 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.531544  hitchhiker  0.0000000000001805 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  39.34 
 
 
462 aa  314  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0082  sun protein  47.34 
 
 
436 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.254701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  40.14 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  42.29 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0029  sun protein  42.06 
 
 
428 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116562 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0030  sun protein  42.06 
 
 
428 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0025  sun protein  41.82 
 
 
428 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  43.19 
 
 
433 aa  311  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  40.65 
 
 
429 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  42.62 
 
 
427 aa  311  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  40.65 
 
 
429 aa  311  1e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  42.86 
 
 
427 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  41.08 
 
 
426 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0029  sun protein  41.82 
 
 
428 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000239617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0022  sun protein  42.29 
 
 
429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  47.41 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0073  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  40.7 
 
 
444 aa  309  5.9999999999999995e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  39.63 
 
 
445 aa  306  4.0000000000000004e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  42 
 
 
429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  42.89 
 
 
427 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0053  sun protein  45.58 
 
 
437 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03139  16S rRNA m5C967 methyltransferase, S-adenosyl-L-methionine-dependent  40.65 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  40.65 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  40.65 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3771  16S rRNA methyltransferase B  40.89 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.075284  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0425  16S rRNA methyltransferase B  40.65 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.53016  hitchhiker  0.000468253 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03090  hypothetical protein  40.65 
 
 
429 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0030  sun protein  40.89 
 
 
428 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3673  16S rRNA methyltransferase B  41.12 
 
 
429 aa  302  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4611  16S rRNA methyltransferase B  40.65 
 
 
429 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0527839  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3584  16S rRNA methyltransferase B  40.89 
 
 
429 aa  301  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287379  normal  0.154829 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  41.92 
 
 
425 aa  300  3e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  39.63 
 
 
439 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0015  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  45.32 
 
 
436 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0208773  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  39.68 
 
 
437 aa  298  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  40.65 
 
 
429 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  41.36 
 
 
431 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  40.42 
 
 
429 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  43.02 
 
 
431 aa  296  6e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  40.19 
 
 
429 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  41.96 
 
 
431 aa  295  8e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  40.42 
 
 
429 aa  295  8e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  43.52 
 
 
434 aa  295  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  39.95 
 
 
429 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  40.65 
 
 
429 aa  293  5e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  43.98 
 
 
434 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  39.23 
 
 
440 aa  292  8e-78  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0179  sun protein  44.1 
 
 
448 aa  292  8e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  39.25 
 
 
428 aa  292  8e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  40.23 
 
 
436 aa  292  9e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  40.65 
 
 
429 aa  291  2e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  36.78 
 
 
436 aa  285  8e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2083  sun protein  42.59 
 
 
437 aa  285  8e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  43.38 
 
 
429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0197  sun protein  45.75 
 
 
432 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.404032  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  45.31 
 
 
433 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  42.71 
 
 
403 aa  278  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0017  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  43.87 
 
 
448 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0205  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  34.56 
 
 
430 aa  275  1.0000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2118  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  34.1 
 
 
430 aa  271  2e-71  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.772275  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  43.47 
 
 
443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0039  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  38.88 
 
 
462 aa  269  7e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0022  sun protein  41.97 
 
 
431 aa  269  8.999999999999999e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.242982 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0021  sun protein  41.97 
 
 
434 aa  268  1e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2626  sun protein  43.12 
 
 
437 aa  266  5e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.183752  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  35.57 
 
 
427 aa  265  1e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  35.1 
 
 
427 aa  259  5.0000000000000005e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0016  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  43.11 
 
 
418 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.398476  normal  0.248834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4003  sun protein  50.88 
 
 
453 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000045232 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0184  sun protein  40.05 
 
 
425 aa  247  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00019985 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3351  sun protein  42.56 
 
 
443 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0272  Sun protein  50.9 
 
 
449 aa  237  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.432064  decreased coverage  0.0030391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3674  sun protein  42.3 
 
 
443 aa  236  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0028  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  40.65 
 
 
419 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.577432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0075  putative RNA methyltransferase (SUN protein)  44.42 
 
 
441 aa  227  4e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191133  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0392  sun protein  38.75 
 
 
442 aa  226  6e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4528  sun protein  42.09 
 
 
461 aa  226  9e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3243  sun protein  46.06 
 
 
457 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.183936  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2382  Fmu (Sun) domain-containing protein  32.26 
 
 
528 aa  219  6e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.029605 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3590  sun protein  44.68 
 
 
454 aa  218  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0840523  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3894  sun protein  45.93 
 
 
457 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2266  sun protein  41.31 
 
 
470 aa  216  5e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4436  sun protein  38.48 
 
 
445 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3632  sun protein  38.36 
 
 
450 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.10429 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2077  sun protein  33.85 
 
 
438 aa  209  7e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3139  sun protein  37.82 
 
 
463 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.670033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>