159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03898 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03898  paar motif family  100 
 
 		 137 aa  270  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.356089  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03514  paar motif family  51.82 
 
 		 133 aa  133  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05511  paar motif family  57.33 
 
 		 86 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0211513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4969  PAAR  51.9 
 
 		 102 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2190  PAAR  50 
 
 		 88 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0631  hypothetical protein  47.44 
 
 		 84 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.1829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2996  hypothetical protein  52.63 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.401348 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1288  PAAR repeat-containing protein  49.35 
 
 		 83 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0430607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1513  PAAR repeat-containing protein  48.75 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.462725  normal  0.806121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2590  PAAR repeat-containing protein  48.05 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6434  PAAR repeat-containing protein  49.35 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6436  PAAR repeat-containing protein  48.65 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2255  hypothetical protein  45 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2227  PAAR repeat-containing protein  45.45 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798766  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0011  PAAR repeat-containing protein  45.45 
 
 		 83 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0479  hypothetical protein  45 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000400722  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01943  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.309937 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2589  hypothetical protein  46.84 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254981  normal  0.133425 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5741  PAAR repeat-containing protein  45 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0643815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0903  PAAR domain-containing protein  42.31 
 
 		 101 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0959  PAAR repeat-containing protein  42.31 
 
 		 88 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3874  PAAR domain-containing protein  42.31 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.626619  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0316  hypothetical protein  38.21 
 
 		 453 aa  60.1  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0211  PAAR repeat-containing protein  43.75 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4083  PAAR  41.1 
 
 		 89 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3671  hypothetical protein  38.75 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7616  hypothetical protein  43.04 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0119  hypothetical protein  37.5 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.435332  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0056  PAAR repeat-containing protein  41.89 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44930  hypothetical protein  41.33 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00624733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3483  PAAR repeat-containing protein  43.21 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.22158  normal  0.485236 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3920  PAAR repeat-containing protein  45 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5205  PAAR repeat-containing protein  46.67 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000429039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2332  PAAR  37.84 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3238  PAAR repeat-containing protein  45.12 
 
 		 85 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.198697  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2610  hypothetical protein  43.9 
 
 		 85 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408788  normal  0.0150385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1195  PAAR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0890388  normal  0.0215751 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5509  hypothetical protein  41.56 
 
 		 87 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3115  PAAR repeat-containing protein  42.68 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2301  PAAR repeat-containing protein  41.03 
 
 		 87 aa  52.4  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3774  hypothetical protein  36.17 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.801042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3249  PAAR repeat-containing protein  48.05 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0505406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4801  hypothetical protein  40 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0636786  normal  0.750355 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3367  PAAR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1541 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0943  hypothetical protein  41.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00127142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1878  hypothetical protein  41.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0199793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0650  YD repeat protein  40.3 
 
 		 1422 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.614814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3827  PAAR repeat-containing protein  41.56 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.86819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7018  PAAR repeat-containing protein  39.51 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.893923 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1541 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1541 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1541 aa  51.2  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1541 aa  51.2  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1112  PAAR repeat-containing protein  31.16 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0335  phosphomethylpyrimidine kinase  42.86 
 
 		 466 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.135685 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1541 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  38.81 
 
 		 1517 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  40.3 
 
 		 1381 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2741  hypothetical protein  38.36 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1845  PAAR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.101109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1375  PAAR motif-containing protein  41.03 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.573546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0500  hypothetical protein  41.03 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.714041  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1577  PAAR motif-containing protein  41.03 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.18435  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1603  PAAR motif-containing protein  41.03 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0657  PAAR motif-containing protein  41.03 
 
 		 88 aa  50.8  0.000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3217  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0242808 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2706  PAAR motif-containing protein  41.03 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61171  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1693  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 		 87 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1612  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 		 87 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0961  hypothetical protein  40.26 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.915695 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0203  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00559285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1586  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160727  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0990  hypothetical protein  40.24 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0092  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3868  hypothetical protein  52.17 
 
 		 512 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0748992  normal  0.0167221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3228  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0952  S-type pyocin domain-containing protein  52.17 
 
 		 510 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0130  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0103  PAAR motif-containing protein  44.74 
 
 		 87 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  32.88 
 
 		 855 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0016  PAAR  43.04 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5071  PAAR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.104912 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0644  bacteriophage GP29 protein  35.44 
 
 		 173 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1527 aa  49.3  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0897  PAAR/S-type pyocin domain-containing protein  52.17 
 
 		 510 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1609  YD repeat protein  34.12 
 
 		 1447 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  32.86 
 
 		 1229 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0699  PAAR repeat-containing protein  43.86 
 
 		 113 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1765  PAAR motif-containing protein  39.74 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.847105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5089  hypothetical protein  37.23 
 
 		 152 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2758  PAAR repeat-containing protein  38.57 
 
 		 406 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.011226  normal  0.594441 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1810  PAAR repeat-containing protein  39.24 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.316839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0098  PAAR motif-containing protein  43.42 
 
 		 87 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.314734  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  38.81 
 
 		 1553 aa  47  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3252  PAAR repeat-containing protein  42.67 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.447164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000030  hypothetical protein  42.42 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2340  PAAR motif-containing protein  33.57 
 
 		 141 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6532  PAAR repeat-containing protein  52.17 
 
 		 52 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.551581  normal  0.153605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0059  PAAR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>