75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03869 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  100 
 
 		 344 aa  701    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  61.9 
 
 		 344 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  60.19 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  56.76 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  56.92 
 
 		 383 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  53.82 
 
 		 346 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  54.86 
 
 		 320 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  53.48 
 
 		 326 aa  370  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  57.1 
 
 		 330 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  52.1 
 
 		 367 aa  361  9e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  51.16 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  53.82 
 
 		 335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  35.09 
 
 		 450 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.91 
 
 		 444 aa  173  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  32.83 
 
 		 348 aa  152  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  31.55 
 
 		 618 aa  146  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.01 
 
 		 316 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  31.1 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  31.65 
 
 		 464 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  30.09 
 
 		 533 aa  139  6e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  32.41 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  29.91 
 
 		 509 aa  136  7.000000000000001e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  32.13 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  30.09 
 
 		 524 aa  134  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  32.63 
 
 		 1186 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  31.02 
 
 		 315 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  31.33 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  30.56 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  30.38 
 
 		 535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  30.17 
 
 		 311 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  27.44 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  30.21 
 
 		 527 aa  109  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  28.23 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  28.7 
 
 		 679 aa  107  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  29.62 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.35 
 
 		 712 aa  93.6  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  27.22 
 
 		 1338 aa  92.8  8e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.69 
 
 		 324 aa  92  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.65 
 
 		 313 aa  87.8  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  27.08 
 
 		 330 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  27.43 
 
 		 487 aa  86.7  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  30.08 
 
 		 401 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  27.81 
 
 		 667 aa  80.9  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  27.36 
 
 		 644 aa  77  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  24.4 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  30.89 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  23.04 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  24.03 
 
 		 471 aa  60.8  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  24.6 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  25.59 
 
 		 384 aa  59.3  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.79 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.97 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  28.14 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  26.91 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  25.98 
 
 		 345 aa  56.2  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  28.3 
 
 		 340 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  29.53 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.81 
 
 		 341 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  25.29 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  25.19 
 
 		 325 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  23.93 
 
 		 337 aa  50.1  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  32 
 
 		 472 aa  50.1  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  46.67 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.24 
 
 		 576 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 		 472 aa  47.4  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 506 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  28.12 
 
 		 456 aa  46.2  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  29.77 
 
 		 829 aa  44.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  25.64 
 
 		 572 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2529  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.5 
 
 		 355 aa  43.9  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0997912 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1302  putative beta-xylosidase  35.53 
 
 		 713 aa  42.7  0.008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.69 
 
 		 352 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3298  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.34 
 
 		 593 aa  42.7  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 345 aa  42.7  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3109  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 348 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>